/test-data/cuffdiff_out6.txt
Plain Text | 88 lines | 88 code | 0 blank | 0 comment | 0 complexity | 5602d109b4e342bcf0121d40ff471a4b MD5 | raw file
1tracking_id class_code nearest_ref_id gene_id gene_short_name tss_id locus length coverage status q1_FPKM q1_conf_lo q1_conf_hi q2_FPKM q2_conf_lo q2_conf_hi 2XLOC_000001 - - XLOC_000001 - - chr1:3204754-3204833 - - OK 0 0 0 5.42247e+06 0 1.3091e+07 3XLOC_000002 - - XLOC_000002 - - chr1:3111449-3111490 - - OK 0 0 0 1.39654e+08 0 4.18963e+08 4XLOC_000003 - - XLOC_000003 - - chr1:3111545-3111576 - - OK 0 0 0 0 0 0 5XLOC_000004 - - XLOC_000004 - - chr1:3174765-3174792 - - OK 0 0 0 0 0 0 6XLOC_000005 - - XLOC_000005 - - chr1:3187401-3187428 - - OK 0 0 0 0 0 0 7XLOC_000006 - - XLOC_000006 - - chr1:3188521-3188548 - - OK 0 0 0 0 0 0 8XLOC_000007 - - XLOC_000007 - - chr1:3189810-3190789 - - OK 2.6642e+06 71325.8 5.25708e+06 5.53756e+06 926051 1.01491e+07 9XLOC_000008 - - XLOC_000008 - - chr1:3190858-3191434 - - OK 227564 66605.9 388523 240951 73918.5 407983 10XLOC_000009 - - XLOC_000009 - - chr1:3191512-3192077 - - OK 1.406e+07 0 3.91501e+07 3.74293e+07 3.65533e+06 7.12032e+07 11XLOC_000010 - - XLOC_000010 - - chr1:3192250-3192336 - - OK 1.91712e+06 0 5.75136e+06 1.91712e+06 0 5.75136e+06 12XLOC_000011 - - XLOC_000011 - - chr1:3192441-3192494 - - OK 0 0 0 5.56023e+07 0 1.19806e+08 13XLOC_000012 - - XLOC_000012 - - chr1:3192550-3192629 - - OK 0 0 0 2.71123e+06 0 8.1337e+06 14XLOC_000013 - - XLOC_000013 - - chr1:3192649-3192676 - - OK 0 0 0 0 0 0 15XLOC_000014 - - XLOC_000014 - - chr1:3192731-3192811 - - OK 0 0 0 0 0 0 16XLOC_000015 - - XLOC_000015 - - chr1:3192940-3193042 - - OK 0 0 0 3.93442e+06 0 8.47748e+06 17XLOC_000016 - - XLOC_000016 - - chr1:3194185-3194226 - - OK 0 0 0 1.39654e+08 0 4.18963e+08 18XLOC_000017 - - XLOC_000017 - - chr1:3194302-3194329 - - OK 0 0 0 0 0 0 19XLOC_000018 - - XLOC_000018 - - chr1:3194706-3194733 - - OK 0 0 0 0 0 0 20XLOC_000019 - - XLOC_000019 - - chr1:3195083-3195110 - - OK 0 0 0 0 0 0 21XLOC_000020 - - XLOC_000020 - - chr1:3195450-3195477 - - OK 0 0 0 0 0 0 22XLOC_000021 - - XLOC_000021 - - chr1:3197089-3197116 - - OK 0 0 0 0 0 0 23XLOC_000022 - - XLOC_000022 - - chr1:3197246-3197273 - - OK 0 0 0 0 0 0 24XLOC_000023 - - XLOC_000023 - - chr1:3197346-3197373 - - OK 0 0 0 0 0 0 25XLOC_000024 - - XLOC_000024 - - chr1:3197425-3197452 - - OK 0 0 0 0 0 0 26XLOC_000025 - - XLOC_000025 - - chr1:3200022-3200191 - - OK 460348 0 991912 460348 0 991912 27XLOC_000026 - - XLOC_000026 - - chr1:3200325-3200352 - - OK 0 0 0 0 0 0 28XLOC_000027 - - XLOC_000027 - - chr1:3200430-3200457 - - OK 0 0 0 0 0 0 29XLOC_000028 - - XLOC_000028 - - chr1:3201007-3201039 - - OK 0 0 0 0 0 0 30XLOC_000029 - - XLOC_000029 - - chr1:3201077-3201481 - - OK 37206.6 0 80169.2 186033 15366.6 356700 31XLOC_000030 - - XLOC_000030 - - chr1:3201596-3201666 - - OK 9.11292e+06 0 2.20005e+07 0 0 0 32XLOC_000031 - - XLOC_000031 - - chr1:3201672-3201699 - - OK 0 0 0 0 0 0 33XLOC_000032 - - XLOC_000032 - - chr1:3201725-3201809 - - OK 8.43162e+06 0 1.81676e+07 0 0 0 34XLOC_000033 - - XLOC_000033 - - chr1:3211521-3211561 - - OK 0 0 0 0 0 0 35XLOC_000034 - - XLOC_000034 - - chr1:3212213-3212292 - - OK 0 0 0 5.42247e+06 0 1.3091e+07 36XLOC_000035 - - XLOC_000035 - - chr1:3212367-3212439 - - OK 0 0 0 1.60978e+07 0 3.46859e+07 37XLOC_000036 - - XLOC_000036 - - chr1:3212717-3212801 - - OK 2.10791e+06 0 6.32372e+06 0 0 0 38XLOC_000037 - - XLOC_000037 - - chr1:3213095-3213192 - - OK 2.38694e+06 0 5.76259e+06 1.19347e+06 0 3.58042e+06 39XLOC_000038 - - XLOC_000038 - - chr1:3240606-3240633 - - OK 0 0 0 0 0 0 40XLOC_000039 - - XLOC_000039 - - chr1:3242479-3242512 - - OK 0 0 0 0 0 0 41XLOC_000040 - - XLOC_000040 - - chr1:3242633-3242923 - - OK 27029.9 0 81089.8 243269 0 494190 42XLOC_000041 - - XLOC_000041 - - chr1:3242924-3243005 - - OK 0 0 0 0 0 0 43XLOC_000042 - - XLOC_000042 - - chr1:3243018-3243079 - - OK 0 0 0 1.73712e+07 0 4.19378e+07 44XLOC_000043 - - XLOC_000043 - - chr1:3243108-3243154 - - OK 4.79961e+07 0 1.43988e+08 0 0 0 45XLOC_000044 - - XLOC_000044 - - chr1:3243347-3243401 - - OK 0 0 0 3.32455e+07 0 8.02618e+07 46XLOC_000045 - - XLOC_000045 - - chr1:3254079-3254106 - - OK 0 0 0 0 0 0 47XLOC_000046 - - XLOC_000046 - - chr1:3256974-3257011 - - OK 0 0 0 1.34946e+09 0 3.25789e+09 48XLOC_000047 - - XLOC_000047 - - chr1:3277155-3277182 - - OK 0 0 0 0 0 0 49XLOC_000048 - - XLOC_000048 - - chr1:3277190-3277218 - - OK 0 0 0 0 0 0 50XLOC_000049 - - XLOC_000049 - - chr1:3277913-3278390 - - OK 127495 8942.18 246048 27320.3 0 58867.2 51XLOC_000050 - - XLOC_000050 - - chr1:3280117-3280144 - - OK 0 0 0 0 0 0 52XLOC_000051 - - XLOC_000051 - - chr1:3280498-3280525 - - OK 0 0 0 0 0 0 53XLOC_000052 - - XLOC_000052 - - chr1:3280686-3280741 - - OK 0 0 0 1.49798e+07 0 4.49395e+07 54XLOC_000053 - - XLOC_000053 - - chr1:3282504-3282531 - - OK 0 0 0 0 0 0 55XLOC_000054 - - XLOC_000054 - - chr1:3282650-3282677 - - OK 0 0 0 0 0 0 56XLOC_000055 - - XLOC_000055 - - chr1:3282760-3282832 - - OK 0 0 0 0 0 0 57XLOC_000056 - - XLOC_000056 - - chr1:3284966-3284993 - - OK 0 0 0 0 0 0 58XLOC_000057 - - XLOC_000057 - - chr1:3290488-3290553 - - OK 0 0 0 6.39146e+06 0 1.91744e+07 59XLOC_000058 - - XLOC_000058 - - chr1:3290798-3290859 - - OK 8.68561e+06 0 2.60568e+07 0 0 0 60XLOC_000059 - - XLOC_000059 - - chr1:3290919-3291273 - - OK 7.79612e+06 0 1.75364e+07 1.49584e+06 0 4.5057e+06 61XLOC_000060 - - XLOC_000060 - - chr1:3299443-3299664 - - OK 449954 0 952175 89990.7 0 269972 62XLOC_000061 - - XLOC_000061 - - chr1:3299691-3299733 - - OK 0 0 0 0 0 0 63XLOC_000062 - - XLOC_000062 - - chr1:3300051-3300078 - - OK 0 0 0 0 0 0 64XLOC_000063 - - XLOC_000063 - - chr1:3307748-3307775 - - OK 0 0 0 0 0 0 65XLOC_000064 - - XLOC_000064 - - chr1:3318620-3318647 - - OK 0 0 0 0 0 0 66XLOC_000065 - - XLOC_000065 - - chr1:3318999-3319051 - - OK 0 0 0 0 0 0 67XLOC_000066 - - XLOC_000066 - - chr1:3330527-3330554 - - OK 0 0 0 0 0 0 68XLOC_000067 - - XLOC_000067 - - chr1:3351240-3351311 - - OK 4.27915e+06 0 1.28374e+07 0 0 0 69XLOC_000068 - - XLOC_000068 - - chr1:3355887-3356119 - - OK 281197 0 605895 0 0 0 70XLOC_000069 - - XLOC_000069 - - chr1:3356180-3356225 - - OK 5.72196e+07 0 1.71659e+08 0 0 0 71XLOC_000070 - - XLOC_000070 - - chr1:3363076-3363176 - - OK 2.1224e+06 0 5.12392e+06 0 0 0 72XLOC_000071 - - XLOC_000071 - - chr1:3363214-3363278 - - OK 0 0 0 0 0 0 73XLOC_000072 - - XLOC_000072 - - chr1:3363387-3363446 - - OK 3.08417e+07 0 6.64547e+07 0 0 0 74XLOC_000073 - - XLOC_000073 - - chr1:3363753-3363849 - - OK 0 0 0 0 0 0 75XLOC_000074 - - XLOC_000074 - - chr1:3364871-3364919 - - OK 3.50371e+07 0 1.05111e+08 0 0 0 76XLOC_000075 - - XLOC_000075 - - chr1:3367135-3367162 - - OK 0 0 0 0 0 0 77XLOC_000076 - - XLOC_000076 - - chr1:3367210-3367237 - - OK 0 0 0 0 0 0 78XLOC_000077 - - XLOC_000077 - - chr1:3367333-3367382 - - OK 0 0 0 0 0 0 79XLOC_000078 - - XLOC_000078 - - chr1:3369580-3369607 - - OK 0 0 0 0 0 0 80XLOC_000079 - - XLOC_000079 - - chr1:3375001-3375028 - - OK 0 0 0 0 0 0 81XLOC_000080 - - XLOC_000080 - - chr1:3377211-3377262 - - OK 0 0 0 0 0 0 82XLOC_000081 - - XLOC_000081 - - chr1:3379888-3379915 - - OK 0 0 0 0 0 0 83XLOC_000082 - - XLOC_000082 - - chr1:3386739-3386836 - - OK 0 0 0 0 0 0 84XLOC_000083 - - XLOC_000083 - - chr1:3391325-3391352 - - OK 0 0 0 0 0 0 85XLOC_000084 - - XLOC_000084 - - chr1:3435841-3435880 - - OK 0 0 0 0 0 0 86XLOC_000085 - - XLOC_000085 - - chr1:3447761-3447788 - - OK 0 0 0 0 0 0 87XLOC_000086 - - XLOC_000086 - - chr1:3450906-3450965 - - OK 0 0 0 0 0 0 88XLOC_000087 - - XLOC_000087 - - chr1:3451051-3451109 - - OK 0 0 0 0 0 0