/test-data/cuffdiff_out6.txt

https://bitbucket.org/cistrome/cistrome-harvard/ · Plain Text · 88 lines · 88 code · 0 blank · 0 comment · 0 complexity · 5602d109b4e342bcf0121d40ff471a4b MD5 · raw file 

    

  1. tracking_id	class_code	nearest_ref_id	gene_id	gene_short_name	tss_id	locus	length	coverage	status	q1_FPKM	q1_conf_lo	q1_conf_hi	q2_FPKM	q2_conf_lo	q2_conf_hi
    2. 

  2. XLOC_000001	-	-	XLOC_000001	-	-	chr1:3204754-3204833	-	-	OK	0	0	0	5.42247e+06	0	1.3091e+07
    3. 

  3. XLOC_000002	-	-	XLOC_000002	-	-	chr1:3111449-3111490	-	-	OK	0	0	0	1.39654e+08	0	4.18963e+08
    4. 

  4. XLOC_000003	-	-	XLOC_000003	-	-	chr1:3111545-3111576	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    5. 

  5. XLOC_000004	-	-	XLOC_000004	-	-	chr1:3174765-3174792	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    6. 

  6. XLOC_000005	-	-	XLOC_000005	-	-	chr1:3187401-3187428	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    7. 

  7. XLOC_000006	-	-	XLOC_000006	-	-	chr1:3188521-3188548	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    8. 

  8. XLOC_000007	-	-	XLOC_000007	-	-	chr1:3189810-3190789	-	-	OK	2.6642e+06	71325.8	5.25708e+06	5.53756e+06	926051	1.01491e+07
    9. 

  9. XLOC_000008	-	-	XLOC_000008	-	-	chr1:3190858-3191434	-	-	OK	227564	66605.9	388523	240951	73918.5	407983
    10. 

  10. XLOC_000009	-	-	XLOC_000009	-	-	chr1:3191512-3192077	-	-	OK	1.406e+07	0	3.91501e+07	3.74293e+07	3.65533e+06	7.12032e+07
    11. 

  11. XLOC_000010	-	-	XLOC_000010	-	-	chr1:3192250-3192336	-	-	OK	1.91712e+06	0	5.75136e+06	1.91712e+06	0	5.75136e+06
    12. 

  12. XLOC_000011	-	-	XLOC_000011	-	-	chr1:3192441-3192494	-	-	OK	0	0	0	5.56023e+07	0	1.19806e+08
    13. 

  13. XLOC_000012	-	-	XLOC_000012	-	-	chr1:3192550-3192629	-	-	OK	0	0	0	2.71123e+06	0	8.1337e+06
    14. 

  14. XLOC_000013	-	-	XLOC_000013	-	-	chr1:3192649-3192676	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    15. 

  15. XLOC_000014	-	-	XLOC_000014	-	-	chr1:3192731-3192811	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    16. 

  16. XLOC_000015	-	-	XLOC_000015	-	-	chr1:3192940-3193042	-	-	OK	0	0	0	3.93442e+06	0	8.47748e+06
    17. 

  17. XLOC_000016	-	-	XLOC_000016	-	-	chr1:3194185-3194226	-	-	OK	0	0	0	1.39654e+08	0	4.18963e+08
    18. 

  18. XLOC_000017	-	-	XLOC_000017	-	-	chr1:3194302-3194329	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    19. 

  19. XLOC_000018	-	-	XLOC_000018	-	-	chr1:3194706-3194733	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    20. 

  20. XLOC_000019	-	-	XLOC_000019	-	-	chr1:3195083-3195110	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    21. 

  21. XLOC_000020	-	-	XLOC_000020	-	-	chr1:3195450-3195477	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    22. 

  22. XLOC_000021	-	-	XLOC_000021	-	-	chr1:3197089-3197116	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    23. 

  23. XLOC_000022	-	-	XLOC_000022	-	-	chr1:3197246-3197273	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    24. 

  24. XLOC_000023	-	-	XLOC_000023	-	-	chr1:3197346-3197373	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    25. 

  25. XLOC_000024	-	-	XLOC_000024	-	-	chr1:3197425-3197452	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    26. 

  26. XLOC_000025	-	-	XLOC_000025	-	-	chr1:3200022-3200191	-	-	OK	460348	0	991912	460348	0	991912
    27. 

  27. XLOC_000026	-	-	XLOC_000026	-	-	chr1:3200325-3200352	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    28. 

  28. XLOC_000027	-	-	XLOC_000027	-	-	chr1:3200430-3200457	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    29. 

  29. XLOC_000028	-	-	XLOC_000028	-	-	chr1:3201007-3201039	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    30. 

  30. XLOC_000029	-	-	XLOC_000029	-	-	chr1:3201077-3201481	-	-	OK	37206.6	0	80169.2	186033	15366.6	356700
    31. 

  31. XLOC_000030	-	-	XLOC_000030	-	-	chr1:3201596-3201666	-	-	OK	9.11292e+06	0	2.20005e+07	0	0	0
    32. 

  32. XLOC_000031	-	-	XLOC_000031	-	-	chr1:3201672-3201699	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    33. 

  33. XLOC_000032	-	-	XLOC_000032	-	-	chr1:3201725-3201809	-	-	OK	8.43162e+06	0	1.81676e+07	0	0	0
    34. 

  34. XLOC_000033	-	-	XLOC_000033	-	-	chr1:3211521-3211561	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    35. 

  35. XLOC_000034	-	-	XLOC_000034	-	-	chr1:3212213-3212292	-	-	OK	0	0	0	5.42247e+06	0	1.3091e+07
    36. 

  36. XLOC_000035	-	-	XLOC_000035	-	-	chr1:3212367-3212439	-	-	OK	0	0	0	1.60978e+07	0	3.46859e+07
    37. 

  37. XLOC_000036	-	-	XLOC_000036	-	-	chr1:3212717-3212801	-	-	OK	2.10791e+06	0	6.32372e+06	0	0	0
    38. 

  38. XLOC_000037	-	-	XLOC_000037	-	-	chr1:3213095-3213192	-	-	OK	2.38694e+06	0	5.76259e+06	1.19347e+06	0	3.58042e+06
    39. 

  39. XLOC_000038	-	-	XLOC_000038	-	-	chr1:3240606-3240633	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    40. 

  40. XLOC_000039	-	-	XLOC_000039	-	-	chr1:3242479-3242512	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    41. 

  41. XLOC_000040	-	-	XLOC_000040	-	-	chr1:3242633-3242923	-	-	OK	27029.9	0	81089.8	243269	0	494190
    42. 

  42. XLOC_000041	-	-	XLOC_000041	-	-	chr1:3242924-3243005	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    43. 

  43. XLOC_000042	-	-	XLOC_000042	-	-	chr1:3243018-3243079	-	-	OK	0	0	0	1.73712e+07	0	4.19378e+07
    44. 

  44. XLOC_000043	-	-	XLOC_000043	-	-	chr1:3243108-3243154	-	-	OK	4.79961e+07	0	1.43988e+08	0	0	0
    45. 

  45. XLOC_000044	-	-	XLOC_000044	-	-	chr1:3243347-3243401	-	-	OK	0	0	0	3.32455e+07	0	8.02618e+07
    46. 

  46. XLOC_000045	-	-	XLOC_000045	-	-	chr1:3254079-3254106	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    47. 

  47. XLOC_000046	-	-	XLOC_000046	-	-	chr1:3256974-3257011	-	-	OK	0	0	0	1.34946e+09	0	3.25789e+09
    48. 

  48. XLOC_000047	-	-	XLOC_000047	-	-	chr1:3277155-3277182	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    49. 

  49. XLOC_000048	-	-	XLOC_000048	-	-	chr1:3277190-3277218	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    50. 

  50. XLOC_000049	-	-	XLOC_000049	-	-	chr1:3277913-3278390	-	-	OK	127495	8942.18	246048	27320.3	0	58867.2
    51. 

  51. XLOC_000050	-	-	XLOC_000050	-	-	chr1:3280117-3280144	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    52. 

  52. XLOC_000051	-	-	XLOC_000051	-	-	chr1:3280498-3280525	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    53. 

  53. XLOC_000052	-	-	XLOC_000052	-	-	chr1:3280686-3280741	-	-	OK	0	0	0	1.49798e+07	0	4.49395e+07
    54. 

  54. XLOC_000053	-	-	XLOC_000053	-	-	chr1:3282504-3282531	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    55. 

  55. XLOC_000054	-	-	XLOC_000054	-	-	chr1:3282650-3282677	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    56. 

  56. XLOC_000055	-	-	XLOC_000055	-	-	chr1:3282760-3282832	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    57. 

  57. XLOC_000056	-	-	XLOC_000056	-	-	chr1:3284966-3284993	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    58. 

  58. XLOC_000057	-	-	XLOC_000057	-	-	chr1:3290488-3290553	-	-	OK	0	0	0	6.39146e+06	0	1.91744e+07
    59. 

  59. XLOC_000058	-	-	XLOC_000058	-	-	chr1:3290798-3290859	-	-	OK	8.68561e+06	0	2.60568e+07	0	0	0
    60. 

  60. XLOC_000059	-	-	XLOC_000059	-	-	chr1:3290919-3291273	-	-	OK	7.79612e+06	0	1.75364e+07	1.49584e+06	0	4.5057e+06
    61. 

  61. XLOC_000060	-	-	XLOC_000060	-	-	chr1:3299443-3299664	-	-	OK	449954	0	952175	89990.7	0	269972
    62. 

  62. XLOC_000061	-	-	XLOC_000061	-	-	chr1:3299691-3299733	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    63. 

  63. XLOC_000062	-	-	XLOC_000062	-	-	chr1:3300051-3300078	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    64. 

  64. XLOC_000063	-	-	XLOC_000063	-	-	chr1:3307748-3307775	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    65. 

  65. XLOC_000064	-	-	XLOC_000064	-	-	chr1:3318620-3318647	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    66. 

  66. XLOC_000065	-	-	XLOC_000065	-	-	chr1:3318999-3319051	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    67. 

  67. XLOC_000066	-	-	XLOC_000066	-	-	chr1:3330527-3330554	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    68. 

  68. XLOC_000067	-	-	XLOC_000067	-	-	chr1:3351240-3351311	-	-	OK	4.27915e+06	0	1.28374e+07	0	0	0
    69. 

  69. XLOC_000068	-	-	XLOC_000068	-	-	chr1:3355887-3356119	-	-	OK	281197	0	605895	0	0	0
    70. 

  70. XLOC_000069	-	-	XLOC_000069	-	-	chr1:3356180-3356225	-	-	OK	5.72196e+07	0	1.71659e+08	0	0	0
    71. 

  71. XLOC_000070	-	-	XLOC_000070	-	-	chr1:3363076-3363176	-	-	OK	2.1224e+06	0	5.12392e+06	0	0	0
    72. 

  72. XLOC_000071	-	-	XLOC_000071	-	-	chr1:3363214-3363278	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    73. 

  73. XLOC_000072	-	-	XLOC_000072	-	-	chr1:3363387-3363446	-	-	OK	3.08417e+07	0	6.64547e+07	0	0	0
    74. 

  74. XLOC_000073	-	-	XLOC_000073	-	-	chr1:3363753-3363849	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    75. 

  75. XLOC_000074	-	-	XLOC_000074	-	-	chr1:3364871-3364919	-	-	OK	3.50371e+07	0	1.05111e+08	0	0	0
    76. 

  76. XLOC_000075	-	-	XLOC_000075	-	-	chr1:3367135-3367162	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    77. 

  77. XLOC_000076	-	-	XLOC_000076	-	-	chr1:3367210-3367237	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    78. 

  78. XLOC_000077	-	-	XLOC_000077	-	-	chr1:3367333-3367382	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    79. 

  79. XLOC_000078	-	-	XLOC_000078	-	-	chr1:3369580-3369607	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    80. 

  80. XLOC_000079	-	-	XLOC_000079	-	-	chr1:3375001-3375028	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    81. 

  81. XLOC_000080	-	-	XLOC_000080	-	-	chr1:3377211-3377262	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    82. 

  82. XLOC_000081	-	-	XLOC_000081	-	-	chr1:3379888-3379915	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    83. 

  83. XLOC_000082	-	-	XLOC_000082	-	-	chr1:3386739-3386836	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    84. 

  84. XLOC_000083	-	-	XLOC_000083	-	-	chr1:3391325-3391352	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    85. 

  85. XLOC_000084	-	-	XLOC_000084	-	-	chr1:3435841-3435880	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    86. 

  86. XLOC_000085	-	-	XLOC_000085	-	-	chr1:3447761-3447788	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    87. 

  87. XLOC_000086	-	-	XLOC_000086	-	-	chr1:3450906-3450965	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    88. 

  88. XLOC_000087	-	-	XLOC_000087	-	-	chr1:3451051-3451109	-	-	OK	0	0	0	0	0	0
    89.