PageRenderTime 12ms CodeModel.GetById 9ms app.highlight 1ms RepoModel.GetById 1ms app.codeStats 0ms

/test-data/s2fq_paired_F3.csfasta

https://bitbucket.org/cistrome/cistrome-harvard/
Unknown | 99 lines | 99 code | 0 blank | 0 comment | 0 complexity | 3789c05a999375f3de62ac36f248756f MD5 | raw file
 1# Fri Jan 23 21:37:16 2009 /share/apps/corona/bin/filter_fasta.pl --output=/data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/results.01/primary.20090124033450140 --name=0176_20090114_1_skmusc_cov_25_ --tag=F3 --minlength=25 --mask=1111111111111111111111111 --prefix=T /data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/jobs/postPrimerSetPrimary.1708/rawseq 
 2# Cwd: /home/pipeline
 3# Title: 0176_20090114_1_skmusc_cov_25_
 4>1378_11_329_F3
 5T0020112221222232212331223
 6>1378_17_1788_F3
 7T0321123231332130012112033
 8>1378_25_2035_F3
 9T0132123233223231301322223
10>1378_28_770_F3
11T0132130321122112113211113
12>1378_33_1945_F3
13T2222222222222222222222222
14>1378_34_789_F3
15T0032232213201212333201323
16>1378_35_263_F3
17T0222122222212212222222222
18>1378_43_186_F3
19T0030130233222012123323213
20>1378_51_1671_F3
21T0322230223212213133212231
22>1378_56_324_F3
23T0022133220332332121320113
24>1378_56_773_F3
25T2323123202231013303111103
26>1378_62_2027_F3
27T0133110120313213121323223
28>1378_62_2029_F3
29T0313222132313312223122323
30>1378_67_1795_F3
31T0302322213023112220313011
32>1378_68_466_F3
33T0232031231223211023111323
34>1378_68_1692_F3
35T0223133132221012221100233
36>1378_80_664_F3
37T2132133320311112232202101
38>1378_85_1786_F3
39T0030130323120313230000000
40>1378_86_1011_F3
41T0130123303321313233323113
42>1378_86_1789_F3
43T0120030311113223330200230
44>1378_91_1596_F3
45T3330212233201303132132010
46>1378_94_1595_F3
47T2123212010211103233331020
48>1378_95_1039_F3
49T0122123110313312113320203
50>1378_95_1767_F3
51T2010121011031322122130011
52>1378_96_1037_F3
53T0031111100203211323320332
54>1378_96_1764_F3
55T0301011220011332101300021
56>1378_98_1574_F3
57T0233132112232313232212221
58>1378_107_1647_F3
59T0022113013012123103320302
60>1378_111_829_F3
61T0321221013321331331230333
62>1378_111_1900_F3
63T0311113121312213132321323
64>1378_112_1483_F3
65T0323110213032122133113113
66>1378_125_1287_F3
67T0323131322222211322330223
68>1378_126_468_F3
69T2313113203302010303131123
70>1378_127_664_F3
71T0020223322323133231210213
72>1378_129_463_F3
73T3113232221100211100320002
74>1378_129_875_F3
75T0333130322133012132313211
76>1378_140_1251_F3
77T0031130212122323133222201
78>1378_141_809_F3
79T0323113110232313233222323
80>1378_144_983_F3
81T1021211122332232122131231
82>1378_153_270_F3
83T0023113323111132223333111
84>1378_155_1689_F3
85T0332220222020202013020112
86>1378_157_1580_F3
87T3322211312232111332231323
88>1378_161_317_F3
89T1332211221001111223011300
90>1378_177_735_F3
91T1023012110323033321201102
92>1378_181_1684_F3
93T0120131112103310122310023
94>1378_187_1407_F3
95T0322123110131232223130312
96>1378_203_721_F3
97T0113000300111022230000203
98>1378_206_2039_F3
99T1111111111111111111111111