PageRenderTime 26ms CodeModel.GetById 18ms RepoModel.GetById 0ms app.codeStats 0ms

/test-data/s2fq_paired_F3.csfasta

https://bitbucket.org/cistrome/cistrome-harvard/
Unknown | 99 lines | 99 code | 0 blank | 0 comment | 0 complexity | 3789c05a999375f3de62ac36f248756f MD5 | raw file
  1. # Fri Jan 23 21:37:16 2009 /share/apps/corona/bin/filter_fasta.pl --output=/data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/results.01/primary.20090124033450140 --name=0176_20090114_1_skmusc_cov_25_ --tag=F3 --minlength=25 --mask=1111111111111111111111111 --prefix=T /data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/jobs/postPrimerSetPrimary.1708/rawseq
  2. # Cwd: /home/pipeline
  3. # Title: 0176_20090114_1_skmusc_cov_25_
  4. >1378_11_329_F3
  5. T0020112221222232212331223
  6. >1378_17_1788_F3
  7. T0321123231332130012112033
  8. >1378_25_2035_F3
  9. T0132123233223231301322223
  10. >1378_28_770_F3
  11. T0132130321122112113211113
  12. >1378_33_1945_F3
  13. T2222222222222222222222222
  14. >1378_34_789_F3
  15. T0032232213201212333201323
  16. >1378_35_263_F3
  17. T0222122222212212222222222
  18. >1378_43_186_F3
  19. T0030130233222012123323213
  20. >1378_51_1671_F3
  21. T0322230223212213133212231
  22. >1378_56_324_F3
  23. T0022133220332332121320113
  24. >1378_56_773_F3
  25. T2323123202231013303111103
  26. >1378_62_2027_F3
  27. T0133110120313213121323223
  28. >1378_62_2029_F3
  29. T0313222132313312223122323
  30. >1378_67_1795_F3
  31. T0302322213023112220313011
  32. >1378_68_466_F3
  33. T0232031231223211023111323
  34. >1378_68_1692_F3
  35. T0223133132221012221100233
  36. >1378_80_664_F3
  37. T2132133320311112232202101
  38. >1378_85_1786_F3
  39. T0030130323120313230000000
  40. >1378_86_1011_F3
  41. T0130123303321313233323113
  42. >1378_86_1789_F3
  43. T0120030311113223330200230
  44. >1378_91_1596_F3
  45. T3330212233201303132132010
  46. >1378_94_1595_F3
  47. T2123212010211103233331020
  48. >1378_95_1039_F3
  49. T0122123110313312113320203
  50. >1378_95_1767_F3
  51. T2010121011031322122130011
  52. >1378_96_1037_F3
  53. T0031111100203211323320332
  54. >1378_96_1764_F3
  55. T0301011220011332101300021
  56. >1378_98_1574_F3
  57. T0233132112232313232212221
  58. >1378_107_1647_F3
  59. T0022113013012123103320302
  60. >1378_111_829_F3
  61. T0321221013321331331230333
  62. >1378_111_1900_F3
  63. T0311113121312213132321323
  64. >1378_112_1483_F3
  65. T0323110213032122133113113
  66. >1378_125_1287_F3
  67. T0323131322222211322330223
  68. >1378_126_468_F3
  69. T2313113203302010303131123
  70. >1378_127_664_F3
  71. T0020223322323133231210213
  72. >1378_129_463_F3
  73. T3113232221100211100320002
  74. >1378_129_875_F3
  75. T0333130322133012132313211
  76. >1378_140_1251_F3
  77. T0031130212122323133222201
  78. >1378_141_809_F3
  79. T0323113110232313233222323
  80. >1378_144_983_F3
  81. T1021211122332232122131231
  82. >1378_153_270_F3
  83. T0023113323111132223333111
  84. >1378_155_1689_F3
  85. T0332220222020202013020112
  86. >1378_157_1580_F3
  87. T3322211312232111332231323
  88. >1378_161_317_F3
  89. T1332211221001111223011300
  90. >1378_177_735_F3
  91. T1023012110323033321201102
  92. >1378_181_1684_F3
  93. T0120131112103310122310023
  94. >1378_187_1407_F3
  95. T0322123110131232223130312
  96. >1378_203_721_F3
  97. T0113000300111022230000203
  98. >1378_206_2039_F3
  99. T1111111111111111111111111