PageRenderTime 27ms CodeModel.GetById 20ms app.highlight 2ms RepoModel.GetById 1ms app.codeStats 0ms

/test-data/indel_analysis_in2.sam

https://bitbucket.org/cistrome/cistrome-harvard/
Unknown | 24 lines | 24 code | 0 blank | 0 comment | 0 complexity | 1d0498af06f0eb2cf5bcd5250f471643 MD5 | raw file
 1r327	16	chrM	11	37	8M1D10M	*	0	0	CTTACCAGATAGTCATCA	-+<2;?@BA@?-,.+4=4	XT:A:U  NM:i:1  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:1  XG:i:1	MD:Z:41^C35
 2r457	0	chr1	14	37	14M	*	0	0	ACCTGACAGATATC	=/DF;?@1A@?-,.	XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:76
 3r501	16	chrM	6	23	7M1I13M	*	0	0	TCTGTGCCTACCAGACATTCA	+=$2;?@BA@?-,.+4=4=4A	XT:A:U  NM:i:3  X0:i:1  X1:i:1  XM:i:2  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:28C36G9  XA:Z:chr5,+134263658,14M1I61M,4;
 4r764	4	*	0	0	*	*	0	0	TTAAGGGGAACGTGTGGGCTATTTAGGCTTTATG	BBB=?BBA?>;?=B=AA=;A@B>=;;>:A=?:?9
 5r1288	16	chrM	8	37	11M1I7M	*	0	0	TCACTTACCTGTACACACA	/*F2;?@%A@?-,.+4=4=	XT:A:U  NM:i:4  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:3  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:2T0T1A69
 6r1902	0	chr1	4	37	7M2D18M	*	0	0	AGTCTCTTACCTGACGGTTATGA	<2;?@BA@?-,.+4=4=4AA663	XT:A:U  NM:i:3  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:2  MD:Z:17^CA58A0
 7r2204	16	chrM	9	0	19M	*	0	0	CTGGTACCTGACAGGTATC	2;?@BA@?-,.+4=4=4AA	XT:A:R  NM:i:1  X0:i:2  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:0T75  XA:Z:chr1,-564927,76M,1;
 8r2314	16	chrM	6	37	10M2D6M	*	0	0	TCACTCTTACGTCTGA	<2;?@BA@?-,.+4=4	XT:A:U  NM:i:3  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:2  MD:Z:25A5^CA45
 9r3001	0	chrM	13	37	3M1D5M2I7M	*	0	0	TACAGTCACCCTCATCA	<2;?@BA/(@?-,$&	XT:A:U  NM:i:3  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:2  MD:Z:17^CA58A0
10r3218	0	chr1	13	37	8M1D7M	*	0	0	TACAGTCACTCATCA	<2;?@BA/(@?-,$&	XT:A:U  NM:i:3  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:1  XO:i:1  XG:i:2  MD:Z:17^CA58A0
11r3760	4	*	0	0	*	*	0	0	CCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGG	BABCBCBBBABBACBCABCAACBBCBBB=?B
12r4767	16	chr2	3	37	15M2I7M	*	0	0	CAGACTCTCTTACCAAAGACAGAC	<2;?@BA/(@?-,.+4=4=4AA66	XT:A:U  NM:i:4  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:3  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:2T1A4T65
13r5333	0	chrM	5	37	17M1D8M	*	0	0	GTCTCTCATACCAGACAACGGCAT	FB3$@BA/(@?-,.+4=4=4AA66	XT:A:U  NM:i:4  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:3  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:45C10^C0C5C13
14r6121	4	*	0	0	*	*	0	0	GTTAATAGGGTGATAGA	AB/BC==CC%ACBC/CB
15r6690	16	chrM	7	23	20M	*	0	0	CTCTCTTACCAGACAGACAT	2;?@BA/(@?-,.+4=4=4A	XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  X1:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:76  XA:Z:chr1,-568532,76M,1;
16r7211	0	chrM	7	37	24M	*	0	0	CGACAGAGACAAAATAACATTTAA	//<2;?@BA@?-,.+4=442;;6:	XT:A:U  NM:i:3  X0:i:1  X1:i:0  XM:i:2  XO:i:1  XG:i:1  MD:Z:73G0G0
17r8122	4	*	0	0	*	*	0	0	GACCTGTGATCCATCGTGATGT	CBBAB/$3BB<AB/,CBCABCA
18r9922	16	chrM	4	0	7M3I9M	*	0	0	CCAGACATTTGAAATCAGG	F/D4=44^D++26632;;6	XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  X1:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:76
19r9987	16	chrM	4	0	9M1I18M	*	0	0	AGGTTCTCATTACCTGACACTCATCTTG	G/AD6"/+4=4426632;;6:<2;?@BA	XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  X1:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:76
20r10145	16	chr1	16	0	5M2D7M	*	0	0	CACATTGTTGTA	G//+4=44=4AA	XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  X1:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:76
21r10324	16	chrM	15	0	6M1D5M	*	0	0	CCGTTCTACTTG	A@??8.G//+4=	XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  X1:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:76
22r11324	4	*	0	0	*	*	0	0	AATAGGGTGATAGACCTG	//CCCC#ACB;;C3BA5C
23r12331	16	chrM	17	0	4M2I6M	*	0	0	AGTCGAATACGTG	632;;6:<2;?@B	XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  X1:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:76
24r12914	16	chr2	24	0	4M3I3M	*	0	0	ACTACCCCAA	G//+4=42,.	XT:A:U  NM:i:0  X0:i:1  X1:i:1  XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:76