/test-data/1.lav
https://bitbucket.org/cistrome/cistrome-harvard/ · Unknown · 178 lines · 178 code · 0 blank · 0 comment · 0 complexity · ea07d954617a7a0dd5c545733ccb67c9 MD5 · raw file
- #:lav
- d {
- "blastz out.seq1m seq2data Y=3400 H=0 W=8 B=2 K=3000 C=0 m=83886080 P=0
- A C G T
- 91 -114 -31 -123
- -114 100 -125 -31
- -31 -125 100 -114
- -123 -31 -114 91
- O = 400, E = 30, K = 3000, L = 3000, M = 50"
- }
- #:lav
- s {
- "out.seq1m" 1 1680 0 1
- "seq2data" 1 1680 0 1
- }
- h {
- ">seqmask seq1data out.repeats"
- ">seq2"
- }
- a {
- s 161304
- b 1 1
- e 1680 1680
- l 1 1 1680 1680 100
- }
- a {
- s 15173
- b 186 251
- e 450 505
- l 186 251 244 309 92
- l 256 310 280 334 84
- l 281 336 307 362 78
- l 308 374 329 395 91
- l 341 396 367 422 81
- l 369 423 419 473 94
- l 422 474 425 477 75
- l 426 481 450 505 96
- }
- a {
- s 12134
- b 191 343
- e 361 503
- l 191 343 215 367 80
- l 216 369 244 397 86
- l 256 398 361 503 95
- }
- a {
- s 4422
- b 192 431
- e 276 505
- l 192 431 212 451 100
- l 223 452 244 473 95
- l 247 474 254 481 63
- l 255 484 276 505 91
- }
- a {
- s 6872
- b 192 311
- e 330 450
- l 192 311 215 334 83
- l 216 336 275 395 73
- l 286 396 307 417 91
- l 308 428 330 450 96
- }
- a {
- s 14437
- b 192 224
- e 472 505
- l 192 224 223 255 84
- l 224 257 255 288 84
- l 257 289 277 309 90
- l 288 310 308 330 90
- l 309 342 362 395 85
- l 374 396 395 417 91
- l 396 428 417 449 95
- l 428 450 449 471 95
- l 450 483 472 505 91
- }
- a {
- s 7306
- b 192 399
- e 308 505
- l 192 399 244 451 94
- l 256 452 277 473 91
- l 280 474 283 477 100
- l 284 481 308 505 92
- }
- a {
- s 11180
- b 193 290
- e 396 505
- l 193 290 212 309 100
- l 223 310 280 367 76
- l 281 369 332 420 88
- l 333 422 335 424 100
- l 336 429 341 434 83
- l 342 451 396 505 87
- }
- a {
- s 14437
- b 224 192
- e 505 472
- l 224 192 255 223 84
- l 257 224 288 255 84
- l 289 257 309 277 90
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- l 342 309 395 362 85
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- l 483 450 505 472 91
- }
- a {
- s 15173
- b 251 186
- e 505 450
- l 251 186 309 244 92
- l 310 256 334 280 84
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- l 396 341 422 367 81
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- l 474 422 477 425 75
- l 481 426 505 450 96
- }
- a {
- s 11180
- b 290 193
- e 505 396
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- l 310 223 367 280 76
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- l 451 342 505 396 87
- }
- a {
- s 6872
- b 311 192
- e 450 330
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- l 428 308 450 330 96
- }
- a {
- s 12134
- b 343 191
- e 503 361
- l 343 191 367 215 80
- l 369 216 397 244 86
- l 398 256 503 361 95
- }
- a {
- s 7306
- b 399 192
- e 505 308
- l 399 192 451 244 94
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- }
- a {
- s 4422
- b 431 192
- e 505 276
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- }
- x {
- n 0
- }
- m {
- n 0
- }
- #:eof