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  7. chr10 217843 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
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  10. chr10 282897 . C T 60 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 93,33,0:11:0:1/1:99
  11. chr10 292927 . C A 5.29 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 35,6,0:2:0:1/1:49
  12. chr10 294953 . A G 11.3 . DP=20;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=50;PV4=1,0.13,0.27,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,27:6:0:0/1:30
  13. chr10 297512 . T TCTATAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  14. chr10 299253 . T C 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  15. chr10 300784 . G GTGTCTCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  16. chr10 302656 . C T 14.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 46,6,0:2:0:1/1:49
  17. chr10 316660 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  18. chr10 323283 . A G 99 . DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,7,4,9;MQ=49;PV4=0.44,1.1e-05,0.0014,1 PL:DP:SP:GT:GQ 154,0,255:27:4:0/1:99
  19. chr10 329097 . C CTG 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
  20. chr10 329425 . T C 34 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=48;PV4=1,0.38,0.18,0.012 PL:DP:SP:GT:GQ 64,0,54:9:0:0/1:57
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  22. chr10 333917 . A C 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 41,6,0:2:0:1/1:49
  23. chr10 364501 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  24. chr10 370384 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  25. chr10 373048 . T C 68 . DP=51;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=15,12,11,4;MQ=49;PV4=0.33,1.6e-13,0.054,1 PL:DP:SP:GT:GQ 98,0,255:42:5:0/1:99
  26. chr10 387060 . G A 34.1 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 67,18,0:6:0:1/1:90
  27. chr10 388388 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  28. chr10 394714 . G A 20.1 . DP=23;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,2,1;MQ=47;PV4=0.4,1,0.043,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,0,28:5:4:0/1:31
  29. chr10 395266 . T C 6.79 . DP=15;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
  30. chr10 395463 . G A 38 . DP=32;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,27;MQ=50;PV4=1,0.00028,0.37,1 PL:DP:SP:GT:GQ 71,53,0:28:0:1/1:99
  31. chr10 415897 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  32. chr10 427441 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  33. chr10 429977 . G A 20 . DP=24;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,4,7,2;MQ=50;PV4=1,1.1e-14,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,0,255:23:0:0/1:53
  34. chr10 430502 . C G 14.2 . DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,12,8,0;MQ=49;PV4=0.0013,0.00012,0.012,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,255:24:29:0/1:47
  35. chr10 436010 . A G 3.01 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,44:2:0:0/1:33
  36. chr10 443775 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  37. chr10 444997 . C T 7.77 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,9,0:3:0:1/1:63
  38. chr10 445061 . C T 99 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,7;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 255,87,0:29:0:1/1:99
  39. chr10 459773 . A G 3.01 . DP=6;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=49;PV4=1,0.14,0.0034,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,83:5:0:0/1:33
  40. chr10 459940 . G A 36.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 69,12,0:4:0:1/1:72
  41. chr10 468854 . TGGAG TCACTCAGAGAGGAG 12.7 . INDEL;DP=7;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  42. chr10 518547 . ACTCT ACT 99 . INDEL;DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 249,45,0:15:0:1/1:99
  43. chr10 533406 . A AGAGCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  44. chr10 537741 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  45. chr10 555578 . GAG GAGAAG 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  46. chr10 569693 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  47. chr10 602486 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  48. chr10 610506 . C A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  49. chr10 617928 . C G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  50. chr10 667505 . A T 4.77 . DP=2;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,36:2:0:0/1:34
  51. chr10 668181 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  52. chr10 706998 . G A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  53. chr10 731058 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  54. chr10 739952 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  55. chr10 752193 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  56. chr10 752862 . cc cCAc 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
  57. chr10 758105 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  58. chr10 758483 . T TGTCTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  59. chr10 835606 . C T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  60. chr10 922988 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  61. chr10 941722 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  62. chr10 945698 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  63. chr10 1042023 . a aAAC 52.2 . INDEL;DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 91,6,0:2:0:1/1:49
  64. chr10 1043221 . T A 6.2 . DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,1,1;MQ=49;PV4=1,1,0.056,0.31 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,50:5:0:0/1:38
  65. chr10 1052950 . G A 83 . DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,10,0;MQ=48;PV4=1,8.3e-05,7.4e-07,1 PL:DP:SP:GT:GQ 113,0,228:26:0:0/1:99
  66. chr10 1056310 . G C 79 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=47;PV4=1,0.039,0.00012,0.43 PL:DP:SP:GT:GQ 109,0,126:9:0:0/1:99
  67. chr10 1061862 . A G 37 . DP=60;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,21,5,3;MQ=49;PV4=0.0056,3.9e-07,3e-06,1 PL:DP:SP:GT:GQ 67,0,255:31:22:0/1:70
  68. chr10 1070461 . C T 16.1 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=48;PV4=1,0.036,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 46,0,38:4:0:0/1:40
  69. chr10 1070710 . C G 99 . DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,13,1,18;MQ=48;PV4=1,4e-05,0.0011,1 PL:DP:SP:GT:GQ 147,0,215:33:0:0/1:99
  70. chr10 1076659 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  71. chr10 1089274 . G C 3.07 . DP=4;AF1=0.5126;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,0.41,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,13:3:0:0/1:16
  72. chr10 1090111 . A G 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  73. chr10 1110855 . a aCTAAGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  74. chr10 1115494 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  75. chr10 1128904 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  76. chr10 1142208 . T C 64 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,1,0,33;MQ=49;PV4=0.057,0.013,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 97,46,0:35:0:1/1:99
  77. chr10 1150928 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  78. chr10 1160913 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  79. chr10 1167722 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  80. chr10 1170304 . C G 99 . DP=40;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,14,4,11;MQ=48;PV4=0.68,3.3e-09,0.00038,0.49 PL:DP:SP:GT:GQ 171,0,255:32:2:0/1:99
  81. chr10 1195036 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  82. chr10 1204080 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  83. chr10 1204947 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  84. chr10 1230744 . G A 3.57 . DP=5;AF1=0.5048;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=49;PV4=1,0.24,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,17:3:0:0/1:20
  85. chr10 1230968 . C T 8.64 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,0,3;MQ=49;PV4=0.1,0.00042,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,77:5:10:0/1:41
  86. chr10 1254961 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  87. chr10 1263553 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  88. chr10 1283529 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  89. chr10 1310456 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  90. chr10 1350849 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  91. chr10 1352573 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  92. chr10 1352644 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  93. chr10 1353236 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  94. chr10 1373459 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  95. chr10 1421219 . A C 12.3 . DP=12;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.2,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,25:5:0:0/1:28
  96. chr10 1433275 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  97. chr10 1489768 . G A 9.31 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
  98. chr10 1489779 . A C,T 4.61 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 42,14,33,8,0,33:3:0:1/1:49
  99. chr10 1490725 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  100. chr10 1497258 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  101. chr10 1518317 . G GACGTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  102. chr10 1523964 . a aCCT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  103. chr10 1527079 . A C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  104. chr10 1548264 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  105. chr10 1558548 . TC TCGAC 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
  106. chr10 1605240 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  107. chr10 1611361 . T G 3.55 . DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  108. chr10 1623213 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  109. chr10 1645868 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  110. chr10 1651015 . G GTTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  111. chr10 1695429 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  112. chr10 1703265 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  113. chr10 1711741 . C CCCTATTTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  114. chr10 1721206 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  115. chr10 1731544 . a aTATTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  116. chr10 1737777 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  117. chr10 1749500 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  118. chr10 1761488 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  119. chr10 1817221 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  120. chr10 1852754 . G T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  121. chr10 1852973 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  122. chr10 1864370 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  123. chr10 1898737 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  124. chr10 1898746 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  125. chr10 1914304 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  126. chr10 1915241 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  127. chr10 1924253 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  128. chr10 1933036 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  129. chr10 1984951 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  130. chr10 2017468 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  131. chr10 2022889 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  132. chr10 2036480 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  133. chr10 2051564 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  134. chr10 2053274 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  135. chr10 2076529 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  136. chr10 2095607 . AGGTG A 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
  137. chr10 2113136 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  138. chr10 2114416 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  139. chr10 2136360 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  140. chr10 2197980 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  141. chr10 2232715 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  142. chr10 2241737 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  143. chr10 2247878 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  144. chr10 2337671 . A ACAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  145. chr10 2355472 . g gCTACAGC 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
  146. chr10 2356045 . C CCTTAAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  147. chr10 2372111 . gg gGCGTATg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  148. chr10 2395355 . T G 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  149. chr10 2407844 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  150. chr10 2498965 . C CCTCTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  151. chr10 2508018 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  152. chr10 2520704 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  153. chr10 2556292 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  154. chr10 2588027 . T A 3.02 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  155. chr10 2596929 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  156. chr10 2624329 . G C 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  157. chr10 2663483 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  158. chr10 2663892 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  159. chr10 2706224 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  160. chr10 2714085 . G C 4.77 . DP=2;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,44:2:0:0/1:36
  161. chr10 2729351 . CTT CTTTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  162. chr10 2734777 . A C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  163. chr10 2742346 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  164. chr10 2748997 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  165. chr10 2751235 . a aTGACG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  166. chr10 2756672 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  167. chr10 2796523 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  168. chr10 2842254 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  169. chr10 2879429 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  170. chr10 2899820 . A G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
  171. chr10 2919978 . T C 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  172. chr10 2923945 . A T,G 3.41 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 36,10,31,4,0,31:3:0:1/1:49
  173. chr10 2929732 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  174. chr10 2950233 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  175. chr10 2952487 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  176. chr10 2952601 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
  177. chr10 2955146 . a aGACGGAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  178. chr10 2957192 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  179. chr10 2963110 . G GACTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  180. chr10 2964207 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  181. chr10 2985557 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  182. chr10 3023958 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  183. chr10 3054036 . T C 52.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 85,18,0:6:0:1/1:90
  184. chr10 3056560 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  185. chr10 3063846 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  186. chr10 3068551 . T G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  187. chr10 3075387 . AG AGAGG 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
  188. chr10 3080755 . c cTGAGT 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  189. chr10 3101616 . A T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
  190. chr10 3112082 . T TCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  191. chr10 3119862 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  192. chr10 3120010 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  193. chr10 3124516 . G A 5.29 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 35,6,0:2:0:1/1:49
  194. chr10 3143643 . A C 11.3 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,9,0:3:0:1/1:63
  195. chr10 3145906 . A C 60 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,6,0;MQ=47;PV4=1,0.0016,0.0043,1 PL:DP:SP:GT:GQ 90,0,174:13:0:0/1:93
  196. chr10 3146180 . C T 18 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 50,9,0:3:0:1/1:63
  197. chr10 3149402 . A G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 165,33,0:11:0:1/1:99
  198. chr10 3150973 . C T 33.2 . DP=42;AF1=0.5263;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,3;MQ=49;PV4=1,0.29,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 63,0,10:5:0:0/1:13
  199. chr10 3155237 . A G 91 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 124,30,0:10:0:1/1:99
  200. chr10 3155540 . A G 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 132,30,0:10:0:1/1:99
  201. chr10 3155753 . G C 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,4;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 133,15,0:5:0:1/1:75
  202. chr10 3158848 . C T 25.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 57,6,0:2:0:1/1:49
  203. chr10 3159234 . G A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  204. chr10 3161131 . C T 11.3 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,9,0:3:0:1/1:63
  205. chr10 3168373 . G C 8.65 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  206. chr10 3171995 . G T 3.01 . DP=8;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=50;PV4=1,0.00025,0.14,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,135:7:0:0/1:33
  207. chr10 3172229 . G A 24 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,4;MQ=48;PV4=1,0.0029,0.013,1 PL:DP:SP:GT:GQ 54,0,142:9:0:0/1:57
  208. chr10 3178815 . G C 39 . DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,11,0,5;MQ=49;PV4=1,8.8e-05,3.1e-07,1 PL:DP:SP:GT:GQ 69,0,255:17:0:0/1:72
  209. chr10 3191727 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  210. chr10 3206365 . T C 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
  211. chr10 3212187 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  212. chr10 3229964 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  213. chr10 3238997 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  214. chr10 3256461 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  215. chr10 3266803 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  216. chr10 3281251 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  217. chr10 3302979 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  218. chr10 3325037 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
  219. chr10 3364820 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  220. chr10 3367318 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  221. chr10 3370814 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  222. chr10 3389660 . G GTCTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  223. chr10 3390765 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  224. chr10 3424524 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  225. chr10 3434101 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  226. chr10 3450171 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  227. chr10 3451517 . G GGT 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
  228. chr10 3465444 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  229. chr10 3473819 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  230. chr10 3474112 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  231. chr10 3486595 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  232. chr10 3492888 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
  233. chr10 3499283 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  234. chr10 3521236 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  235. chr10 3526792 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  236. chr10 3539155 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  237. chr10 3584507 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  238. chr10 3586349 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  239. chr10 3590536 . AAGAGAGAG AAGAGAG 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
  240. chr10 3606942 . CT CATAAGT 3.81 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  241. chr10 3643414 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  242. chr10 3660946 . T A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  243. chr10 3694363 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  244. chr10 3694597 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  245. chr10 3698288 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  246. chr10 3711002 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  247. chr10 3715278 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
  248. chr10 3716521 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  249. chr10 3720097 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  250. chr10 3720385 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  251. chr10 3743697 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  252. chr10 3747686 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  253. chr10 3753120 . tgga t 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
  254. chr10 3756309 . TAAG T 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
  255. chr10 3800996 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  256. chr10 3812387 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  257. chr10 3835047 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  258. chr10 3851381 . T A 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  259. chr10 3853849 . GTGT G 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  260. chr10 3872341 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  261. chr10 3873419 . A T 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  262. chr10 3894179 . A C 3.54 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,42:2:0:0/1:34
  263. chr10 3907121 . GT GTT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  264. chr10 3909411 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  265. chr10 3911829 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  266. chr10 3913900 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  267. chr10 3931867 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  268. chr10 3935971 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  269. chr10 3938767 . C G 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
  270. chr10 3956629 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  271. chr10 3987365 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
  272. chr10 3992909 . C G 12.3 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  273. chr10 4014922 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  274. chr10 4017381 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  275. chr10 4031135 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  276. chr10 4031735 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  277. chr10 4034594 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  278. chr10 4049052 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  279. chr10 4049847 . C T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  280. chr10 4053810 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  281. chr10 4057160 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  282. chr10 4069192 . T TGTGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  283. chr10 4083656 . ct cTGCTTGAt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  284. chr10 4129954 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  285. chr10 4135785 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  286. chr10 4171409 . cg cGTGATATCTGTg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  287. chr10 4174241 . G GTTGTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  288. chr10 4185639 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  289. chr10 4233710 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  290. chr10 4251583 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  291. chr10 4276813 . g gTTTTCTCTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  292. chr10 4294415 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  293. chr10 4332523 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  294. chr10 4360945 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  295. chr10 4395806 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  296. chr10 4395821 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  297. chr10 4420491 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  298. chr10 4453877 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  299. chr10 4481483 . A G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  300. chr10 4483673 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  301. chr10 4495977 . T G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  302. chr10 4561636 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  303. chr10 4574896 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  304. chr10 4577724 . T TCTCAACAAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  305. chr10 4578308 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  306. chr10 4581124 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  307. chr10 4581619 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  308. chr10 4613801 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  309. chr10 4692001 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  310. chr10 4711974 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  311. chr10 4725899 . g gTGCAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  312. chr10 4733335 . cG cGTAG 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
  313. chr10 4753253 . G A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  314. chr10 4788010 . CGG CGGG 13.4 . INDEL;DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 52,6,0:2:0:1/1:49
  315. chr10 4788081 . A ACTCCT 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
  316. chr10 4811809 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  317. chr10 4869585 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  318. chr10 4885208 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  319. chr10 4892308 . GC GCAAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  320. chr10 4927603 . G C 7.8 . DP=9;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=48;PV4=1,0,0,0.44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,28:3:0:0/1:30
  321. chr10 4929976 . GT GTCT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  322. chr10 4958031 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  323. chr10 5010913 . C T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  324. chr10 5011048 . A C 4.77 . DP=6;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.016,0.22,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,40:4:0:0/1:35
  325. chr10 5014678 . G T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  326. chr10 5016241 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  327. chr10 5018287 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  328. chr10 5019959 . G A 9.52 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=48;PV4=1,0.087,0.23,0.12 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,108:5:0:0/1:42
  329. chr10 5026052 . A G 26 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 58,9,0:3:0:1/1:63
  330. chr10 5037772 . C A 39 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=45;PV4=1,1,0.055,0.41 PL:DP:SP:GT:GQ 69,0,64:6:0:0/1:66
  331. chr10 5038853 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  332. chr10 5041028 . C A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  333. chr10 5042852 . T A 13.2 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,2,0;MQ=47;PV4=0.067,0.086,0.0013,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,123:6:12:0/1:46
  334. chr10 5045884 . G GTAGACTT 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
  335. chr10 5050761 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  336. chr10 5050793 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  337. chr10 5079812 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  338. chr10 5092192 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  339. chr10 5101028 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  340. chr10 5112354 . A G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
  341. chr10 5123006 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  342. chr10 5139685 . G A 50.1 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 83,18,0:6:0:1/1:90
  343. chr10 5165443 . CT CTT 37.5 . INDEL;DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.26 PL:DP:SP:GT:GQ 75,0,110:9:0:0/1:78
  344. chr10 5165525 . G A 20.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 52,6,0:2:0:1/1:49
  345. chr10 5165809 . tcac t 6.55 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,44:2:0:0/1:43
  346. chr10 5175847 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  347. chr10 5177350 . G A 35.5 . DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 68,12,0:4:0:1/1:72
  348. chr10 5190458 . ga gAa 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  349. chr10 5200756 . C T 6.98 . DP=2;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,30:2:0:0/1:32
  350. chr10 5202060 . C T 20 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 52,9,0:3:0:1/1:63
  351. chr10 5242346 . G A 97.1 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 130,21,0:7:0:1/1:84
  352. chr10 5249377 . A T 21.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 53,6,0:2:0:1/1:49
  353. chr10 5249770 . G A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
  354. chr10 5249973 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  355. chr10 5260611 . TTCACT TT 33.5 . INDEL;DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,2,0;MQ=50;PV4=1,0.00027,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 71,0,160:7:0:0/1:74
  356. chr10 5260812 . A G 16.1 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 48,9,0:3:0:1/1:63
  357. chr10 5260813 . GCC GCCCC 12.7 . INDEL;DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  358. chr10 5283318 . aaataa aaa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  359. chr10 5283974 . A C 7.8 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  360. chr10 5319029 . A AGT 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
  361. chr10 5320897 . C T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
  362. chr10 5349776 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  363. chr10 5364097 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  364. chr10 5366794 . G GTGAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  365. chr10 5384423 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  366. chr10 5385285 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  367. chr10 5394537 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  368. chr10 5402285 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  369. chr10 5409210 . G C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
  370. chr10 5416124 . G T 11.3 . DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,5,1,3;MQ=49;PV4=1,0.13,0.009,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,152:12:0:0/1:44
  371. chr10 5416130 . C A 13.2 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,2,0,4;MQ=48;PV4=0.43,0.064,0.036,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,80:8:4:0/1:46
  372. chr10 5435918 . G A 18.1 . DP=53;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,10,9,2;MQ=50;PV4=0.25,3.8e-08,0.00094,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,255:34:6:0/1:51
  373. chr10 5436273 . C T 21 . DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=17,6,0,9;MQ=49;PV4=0.00018,2e-07,0.00093,1 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,255:32:37:0/1:54
  374. chr10 5436462 . T C 6.2 . DP=11;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=47;PV4=1,1,0.3,0.011 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,45:5:0:0/1:38
  375. chr10 5437365 . A G 16.1 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,8,1,4;MQ=49;PV4=0.6,0.00011,0.047,1 PL:DP:SP:GT:GQ 46,0,255:20:2:0/1:49
  376. chr10 5455799 . tgga t 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  377. chr10 5459010 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  378. chr10 5468709 . T C 14.2 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,4,0,4;MQ=50;PV4=1,0.056,0.013,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,128:9:0:0/1:47
  379. chr10 5471122 . T C 5.54 . DP=12;AF1=0.5128;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=47;PV4=1,1,0.33,0.077 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,13:3:0:0/1:16
  380. chr10 5471200 . C T 15.1 . DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,9,0:3:0:1/1:63
  381. chr10 5471251 . T G 3.03 . DP=17;AF1=0.5029;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,0.077,0.33,0.071 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,19:3:0:0/1:22
  382. chr10 5473242 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  383. chr10 5479131 . A ATTTGCCCGAGAACGGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  384. chr10 5481451 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
  385. chr10 5499040 . AT ATT 99 . INDEL;DP=18;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,14;MQ=50;PV4=1,1,1,0.39 PL:DP:SP:GT:GQ 172,0,33:17:0:0/1:36
  386. chr10 5500026 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  387. chr10 5504879 . c cCAG 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
  388. chr10 5505591 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  389. chr10 5542320 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  390. chr10 5567366 . G A 92 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,4;MQ=47;PV4=0.44,0.00014,0.00085,1 PL:DP:SP:GT:GQ 122,0,61:9:4:0/1:64
  391. chr10 5571516 . C T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  392. chr10 5577742 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  393. chr10 5578608 . ac aCCGTTTc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  394. chr10 5585992 . tac tACAGac 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  395. chr10 5602993 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  396. chr10 5607598 . T G 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  397. chr10 5617452 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
  398. chr10 5637224 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
  399. chr10 5640419 . G T 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  400. chr10 5640435 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  401. chr10 5652173 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  402. chr10 5652185 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  403. chr10 5652880 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
  404. chr10 5667066 . C A 19.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 51,6,0:2:0:1/1:49
  405. chr10 5682641 . C T 18.6 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 51,12,0:4:0:1/1:72
  406. chr10 5683860 . A ANNNNNC 3.25 . INDEL;DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,88:4:0:0/1:41
  407. chr10 5688395 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  408. chr10 5689917 . A T 6.98 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  409. chr10 5690879 . G A 28 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,1,3;MQ=42;PV4=0.033,0.046,0.0014,0.43 PL:DP:SP:GT:GQ 58,0,149:10:15:0/1:61
  410. chr10 5693379 . A G 20.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 52,6,0:2:0:1/1:49
  411. chr10 5720721 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  412. chr10 5751578 . CTA CTAGTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  413. chr10 5781628 . T G 29.5 . DP=28;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,3;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 62,12,0:4:0:1/1:72
  414. chr10 5781969 . A T 99 . DP=51;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,23,22;MQ=48;PV4=1,0.3,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 254,113,0:46:0:1/1:99
  415. chr10 5788126 . ACT ACTCAGTGCTCT 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
  416. chr10 5788608 . G C 70.5 . DP=32;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,8,0;MQ=48;PV4=1,1,0.17,1 PL:DP:SP:GT:GQ 103,12,0:9:0:1/1:72
  417. chr10 5789325 . T G 21 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,2,0,4;MQ=47;PV4=0.17,0.16,0.093,1 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,107:9:8:0/1:54
  418. chr10 5789966 . CCTGCCTCAGCTGCC CCTGCC 99 . INDEL;DP=49;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,18,6,7;MQ=50;PV4=0.48,0.0023,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,0,255:39:3:0/1:99
  419. chr10 5790420 . T C 99 . DP=51;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,17,25;MQ=49;PV4=0.42,0.046,0.29,1 PL:DP:SP:GT:GQ 237,97,0:43:0:1/1:99
  420. chr10 5790616 . A G 99 . DP=46;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,18,4,15;MQ=49;PV4=1,5e-14,0.00042,0.44 PL:DP:SP:GT:GQ 169,0,255:41:0:0/1:99
  421. chr10 5793899 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  422. chr10 5793938 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  423. chr10 5798782 . T A 7.59 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
  424. chr10 5800811 . A C 25 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=48;PV4=1,0.038,0.17,1 PL:DP:SP:GT:GQ 55,0,59:6:0:0/1:57
  425. chr10 5803530 . AA AAGA 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  426. chr10 5804531 . G A 29.1 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 62,18,0:6:0:1/1:90
  427. chr10 5804633 . TTC TTCTC 99 . INDEL;DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=50;PV4=1,1,0.2,1 PL:DP:SP:GT:GQ 145,0,108:9:0:0/1:99
  428. chr10 5823705 . tg tGCGAGGAg 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
  429. chr10 5828019 . T C 3.54 . DP=10;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,0,2;MQ=49;PV4=0.4,1,0.026,0.25 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,50:5:4:0/1:34
  430. chr10 5828942 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  431. chr10 5836286 . C T 12 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
  432. chr10 5872773 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
  433. chr10 5874958 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  434. chr10 5902105 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  435. chr10 5917372 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  436. chr10 5925820 . gg gGCTg 3.25 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,0,1;MQ=50;PV4=0.25,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,102:4:0:0/1:41
  437. chr10 5925971 . C A 41.5 . DP=45;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,1,8,0;MQ=49;PV4=0.11,0.077,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 70,0,1:9:0:1/1:5
  438. chr10 5929962 . G C 18.1 . DP=53;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,5,4,3;MQ=50;PV4=0.62,0.0016,0.073,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,191:15:2:0/1:51
  439. chr10 5938195 . TC TCGC 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
  440. chr10 5948657 . C T 63 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,10;MQ=49;PV4=1,4.9e-09,0.0028,1 PL:DP:SP:GT:GQ 93,0,199:19:0:0/1:96
  441. chr10 5953148 . A G 5.46 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=49;PV4=1,0.43,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,35:4:0:0/1:34
  442. chr10 5953588 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  443. chr10 5967256 . A C 22 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,1,5,0;MQ=48;PV4=1,0.0077,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 52,0,119:10:0:0/1:55
  444. chr10 5971969 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
  445. chr10 5978411 . T C 3.54 . DP=34;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,0,3;MQ=50;PV4=0.4,0.05,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,37:5:0:0/1:33
  446. chr10 5982573 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
  447. chr10 5989110 . C CTTA 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
  448. chr10 6013625 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
  449. chr10 6056837 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  450. chr10 6060054 . G T 10.4 . DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,19,6,0;MQ=49;PV4=3e-05,9.3e-05,0.00041,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,255:26:45:0/1:43
  451. chr10 6062018 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  452. chr10 6063674 . T C 99 . DP=35;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 183,87,0:29:0:1/1:99
  453. chr10 6091069 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
  454. chr10 6091333 . A G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
  455. chr10 6101041 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
  456. chr10 6111851 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:G

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