/test-data/fasta_formatter1.fasta

https://bitbucket.org/cistrome/cistrome-harvard/ · Unknown · 100 lines · 100 code · 0 blank · 0 comment · 0 complexity · 6cbc8a7b8a5b699e12ef2f23b125b642 MD5 · raw file 

    

  1. >Scaffold3648
    2. 

  2. AGGAATGATGACTACAATGATCAACTTAACCTATCTATTTAATTTAGTTC
    3. 

  3. CCTAATGTCAGGGACCTACCTGTTTTTGTTATGTTTGGGTTTTGTTGTTG
    4. 

  4. TTGTTTTTTTAATCTGAAGGTATTGTGCATTATATGACCTGTAATACACA
    5. 

  5. GTATAACTTTTCAAATACTTTTGTTTTACAACTTTTCTCTCTGGACTTAT
    6. 

  6. ATTAAAGTCAATTTTAATGAACATGTAGTAAAAACTAATACATGTACATC
    7. 

  7. TACAGTTTATTTATTTTTTTCTTCTTCTTTTTGTATTTCTTGTGTTACAT
    8. 

  8. TATTTCACTTCACGTTCATGTTACCAACCTTGCCCCCTTGCTTTCCATGC
    9. 

  9. AAAAAAAGAAAAAAAAGAAGCAATACTTACACTTACCCTTGAGATATCTT
    10. 

  10. GATCTGAATGCTTTAACATTCTATATGTACAATAAATTTTTGTATCTATA
    11. 

  11. GCCTATTATTATATATGTTGCTATGTCAGGCACATTGACAACATTCTCAG
    12. 

  12. AAGGTTAGAAGATGGTATTGTTCTGAAATGCCTGGAATGCCTTGTGAACT
    13. 

  13. AAGATGATTACTCATGTCATTAAAGTCCCCTAACCCAGGTATTTCCTCCT
    14. 

  14. TCCCATGACGAAAACAGTCCATTTAAACTTCACCCCACTTTGGACCCGAA
    15. 

  15. AGTGGGGTGCATTTTGGTGGTAAGCTCACCACAGAGCAAGAGAGAGTTAG
    16. 

  16. AGTCCCTAATCTGCAGTGTAAACAAACTTTGCCAGGACATCACCAGCCCA
    17. 

  17. ACCTTGATAAGTACTGCTTGGAACTCCTCCATGATGTTCTAGTCTTATTC
    18. 

  18. GCAGTCTCATATAGGTTCGGATTTTGTCCATTCTCATAGCTACCAGTATA
    19. 

  19. CATGGGAGATGCCAGTTTCATCTTCCTTGCTTCACTTTATAAGCATAGTT
    20. 

  20. ATATCANGAACTTCCTGGTTATAATTATGTTCCTTTCAAGTTTCATCATA
    21. 

  21. ATTGTCTAGTTCGATATAGTACATGGACACAATTAAATATGATATTGTCT
    22. 

  22. >Scaffold9299
    23. 

  23. CAGCATCTACATAATATGATCGCTATTAAACTTAAATCTCCTTGACGGAG
    24. 

  24. TCTTCGGTCATAACACAAACCCAGACCTACGTATATGACAAAGCTAATAG
    25. 

  25. GAAAAGCATCCTTGTTTGTTTCACTATGCTTTTTAATGGTTGACGTTAAa
    26. 

  26. ggtaaagaccagtattggaaacgccccaatttcaaaaaatgaaatggaag
    27. 

  27. ctctcattaccaatcatgtgaaagaatatgttttgactaatacatgatga
    28. 

  28. taaaaaaattgccgggaaaccgcctactaattcatatatttagtaaattt
    29. 

  29. gtttctctcatggtctgtgagagatatagggtagtcccatatacatcttt
    30. 

  30. ctgtgtatagtgcttgtaactttacgaagaatgggccaaatttcttatca
    31. 

  31. ttttgatgattccagaaccttgcagatgcgagatggtagatgatcaacct
    32. 

  32. tttctgatcgattccataacgtttctttcacaatgcaatcgcatgaccat
    33. 

  33. aactggtctttacctTTAAGTTGTAGGTCTTAATTGATAACACTATATAG
    34. 

  34. TTTTTTTCTTTTTACTGTTTTTATTAATGACCTCTGTAATTTGCCCTATT
    35. 

  35. GTGAAAATACTAAAATATGTTTATACGCCGATGATGCGGCAATATTTTGC
    36. 

  36. CAAGGCAAAGAAATTGCCCTTGTTGAGAAAACTCTTAAATGTGAGTTTAA
    37. 

  37. AAAAATAGTTGATCACATTGAAAAAGATGACTTAATGTTGAATATCAAGA
    38. 

  38. AGTGTAAGATCATGTTATTTGGGACAAGAAAACGAATCAAAAATCAAAGT
    39. 

  39. GTACGCTTGATTTACAGAGATAATGTTATCGAAGTTGTAAATGAATTTAA
    40. 

  40. ATATCTTGGTGTATTATTTGATAATTATTTAAAGTGGGATATACATATAT
    41. 

  41. CGAAAACTGCCTCCAAAATATCTAGAACCATATCATGTATAAAACGAATT
    42. 

  42. AAATATTATTTGCCGAAAAGAATTTTAAAATTGTTATATGATAGTTTGAT
    43. 

  43. ATTGTCACATATTGACTACGGTATTGTTTTGTGGGGATGTTCAGCAAAGT
    44. 

  44. GTCATTTGGAAAAGTTACAAAAGTTACAAAATCGTTATGCCCGTTTAATA
    45. 

  45. CTAAACGTAGATATTTTGACACCTCGTATTATATTATTATCCTCTCTAAG
    46. 

  46. ATGGCAATCAGTTGTTCAGAGAGTGCAATACCAA
    47. 

  47. >Scaffold9309
    48. 

  48. GAAGGAAGAAGAGGAAAATAATGATGAATTTGTAGAATTTCTATAACGTA
    49. 

  49. TGAAAACATAAACAACATGAAAAAGTATGAACCGACAGAAGAATGAAAAT
    50. 

  50. TTCAATCATATAACATGTCATTCACTTCTCTTCTCTGACTGTCAAGTATT
    51. 

  51. AGGTATTCCTTTTTATTTCCTCTTAAAATGATCATAGTTTCCTATTTCTT
    52. 

  52. TTACACCATTGGGAAGGGAATTCCAATGTTTTATGGCATTGTAATAAAAC
    53. 

  53. GAATTTCCAATACTACCTACTCTTTCTGGTAAGTTAAAGTTGAATCGGCT
    54. 

  54. ATTTCTTGTATTATAATCATGTACGTCAGTAACAAGATCGAAGTTGGATC
    55. 

  55. GAATATAATGATTCGACCTAGTATGATATATTTTATGCACGTGATGCAAT
    56. 

  56. ACGAGTTGTTTTGATCTTTGGTCGACTTCAAGAAAACCAGCTTTAGAAAG
    57. 

  57. TTCGCTGTAGCCAACATGAGTTCTTGCCTTGGACTAGAACAGTTGATAAA
    58. 

  58. TCTCACCATTTTGTTCTTTAAGATGGGTAGAAGAATCCCTGCAATCTAAA
    59. 

  59. TGGTCAATTACTGTGAAGTTATTTTTACTGGATGCACCCAATAttttttt
    60. 

  60. gataatttttttttctttgataatttttttctttttctttaataaatttt
    61. 

  61. ttggataatttttttttggataaatagttcttttttgataattctaataa
    62. 

  62. tttttttatttattttttttttttctataattttttttaaaaaatttatt
    63. 

  63. aatttttaattaaaaaaaaaataaGAGTTAACAGATTAAGGGAAACTGAC
    64. 

  64. AATTCAAAAAAAAAAAAAA
    65. 

  65. >Scaffold9310
    66. 

  66. GCGGGGGCTGGGGAGGAAGGGGTGGCGTTATTTCACTTCCGATCTAATAC
    67. 

  67. GCTTTCTTAAGACACTGAAATATCAGTAGGTATTGGTATAGAGAATTACT
    68. 

  68. TTTTATTTTTAATTAAAACATTATCGAAATGAAGATACAGAGAAAAACGA
    69. 

  69. TGAGATGTAAGAAGTGCGCGTATTTAtgtgtgtgggtgcgtgtgtgtgtg
    70. 

  70. tgtgtgtgtgttgtgtgcgtgcgtgtgtgtggtggtgtgtACTAATTTTG
    71. 

  71. ATGTGTGTTGTGGCACAATTGCAATCATCAGTATCTTCATGAAAATGATA
    72. 

  72. ACCAGAAGCACAAAAAGGAGGgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtttagtgt
    73. 

  73. gcgtgcgtgtgagggtgtttaagtgtgtatgtCGGAAATGTGGCACAATT
    74. 

  74. GCAATCATCTGTATCTTCATGAAAATGATAACCAGAAGAACAAAAAAAAA
    75. 

  75. AAACATTGAGAGAACATGTTTTTTTGATGGAAGACAAGAAGTTCTCGTAA
    76. 

  76. CGTAGGATCTCCGAGACATGATGGGGTCAACTTAAAAAGAGAGCAGTGAG
    77. 

  77. AGGCATTTATATCGAAGGTCAGGGAAAGGCAAACAAAGAAAGAAAAAAAA
    78. 

  78. AAGGCTCACAGGAGAACGAAAACACGGGCCAAAATAATAAACAGGAGCAA
    79. 

  79. GTGAACGGGCAGTTTGGTAGCTACTTCATTTACCGGCTTTTAAaggtact
    80. 

  80. atgtcccatttgcaggtcaaaaaaaatgaaaaagttaaattccaactgca
    81. 

  81. tttgaaagataatactaatttacaacttccctaaaaaaggtggggcttga
    82. 

  82. aaatgtcttcaagtgcggaaaataacgactattagttgtcaaatcgactt
    83. 

  83. tagggCTATAGAGCCCAAAAGTAATAGTCTTGA
    84. 

  84. >Scaffold11911
    85. 

  85. TTCTTGGCACCCCCCCCCCCCCCACACTCCTGCACTGAAGAACTACTCAA
    86. 

  86. GTTTAAACTTTGCATTGCTTTTCTTTCTTTTTCAGTATTTTTTGCTTGGT
    87. 

  87. ACATGTTTCTCTTAATATCTGTCGTATAGatttttaatatttttatttat
    88. 

  88. atCTACGTCAATCTGGCTGttctttttcttgtcttctttttttttctctc
    89. 

  89. tcttttttttcctcgtattttGTATTGATCCTTACCCTAGTTTTTGAACT
    90. 

  90. TGAACAGCAATTTGCAGCACTCAAATTTCTTTAAAATTACCTTCTCTTAT
    91. 

  91. TTGtctctgttcccctctccccccctctctctctctctctctctctctct
    92. 

  92. ctctctctctttcATCTCCCATATCATAATTTGAAGTACCATCTATGGTG
    93. 

  93. TTTTCAGATTGATCTTTCTTGCTTTCCCCACCCTCCCCCTTTATGCAGTT
    94. 

  94. AATTTTCAGTCTATTTGTGTTTTCTGTGGTTGATTCTAATCATATTCTAA
    95. 

  95. CTCTTATTTTACATTTTACTTCACTAACAACTGGTTTATTATATTTGTTA
    96. 

  96. CTAATTTTGAATTAAACTATTTACCATTCTGAACGAACTGAAAGATTAAA
    97. 

  97. GATCAAACTATCTATGAATAGAATGGTATTTCTTCAATTTATTCAAATTT
    98. 

  98. CTCTCTCTTTAACCCCCTTTTTCTGCTTGCATTTTTATCCCTTTGCCGTG
    99. 

  99. GACTTCACTGGATATTTTGCTTTGATGCCAATCCAACAATTTTGCATATA
    100. 

  100. TTA
    101.