/test-data/lastz_wrapper_out3.tabular

https://bitbucket.org/cistrome/cistrome-harvard/ · Unknown · 22 lines · 22 code · 0 blank · 0 comment · 0 complexity · 7a4ffa7babe6b98b357f292389f9de63 MD5 · raw file 

    

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    2. 

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    6. 

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  9. phiX174	4109	4110	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:478:252	12	13	-	36	C	A	ATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCGCATC	ATGCTTGGCTTCAATAAGCAGATGGATAACCGCATC
    10. 

  10. phiX174	3126	3127	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:589:96	28	29	-	36	A	G	CAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCC	CAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGGGGCCGCC
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  11. phiX174	2569	2570	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:1472:716	23	24	+	36	G	T	TGGTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAG	TGGTAATGGTGGTTTTCTTCATTTCATTCAG
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  12. phiX174	2972	2973	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:836:1204	17	18	+	36	G	T	TTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAAT	TTGCTTCTGCTCTTGCTTGTGGCGCCATGTCTAAAT
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  13. phiX174	2234	2235	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:172:1412	13	14	-	36	C	A	AAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACC	AAATTTAATGTGAACGTTTATCGCAATCTGCCGACC
    14. 

  14. phiX174	2902	2903	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:540:1415	18	19	+	36	G	T	TTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTA	TTATTAAAGAGATTATTTTTCTCCAGCCACTTA
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  15. phiX174	2837	2838	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:253:1162	14	15	-	36	T	A	ATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGC	ATGGTTTGGTCAAACTTTACCGCTACTAAATGC
    16. 

  16. phiX174	4662	4663	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:828:754	26	27	+	36	G	T	TTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGT	TTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGTTCGTATGGT
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  17. phiX174	4202	4203	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:891:1437	19	20	+	36	G	T	TAATGGTGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTG	TAATGGTGATATGTATGTTTACGTCCATAAGGCTG
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  18. phiX174	4206	4207	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:891:1437	23	24	+	36	G	T	TAATGGTGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGCTG	TAATGGTGATATGTATGTTTACGTCCATAAGGCTG
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  19. phiX174	430	431	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:203:667	9	10	-	36	T	C	AGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGC	AGACCGCCTTGGCCTCTATTAAGC
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  20. phiX174	2857	2858	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:578:971	15	16	+	36	G	T	CGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCG	CGCTACTAAATTCCGCGGATTGGTTTCG
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  21. phiX174	3112	3113	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:1721:1800	27	28	-	36	T	C	TCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCC	TCAAGGCTCTAATGTCCCTAACCC
    22. 

  22. phiX174	4825	4826	+	5386	HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:815:1640	9	10	-	36	T	G	CCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCA	CCCTAATTTGGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCA
    23.