PageRenderTime 212ms CodeModel.GetById 29ms RepoModel.GetById 1ms app.codeStats 0ms

/test-data/test_annotated_dbsnp.vcf

https://bitbucket.org/cistrome/cistrome-harvard/
Unknown | 1001 lines | 1001 code | 0 blank | 0 comment | 0 complexity | ce1e7345d5932e1e298fb9aa4ed1fe18 MD5 | raw file

Large files files are truncated, but you can click here to view the full file

    

  1. ##fileformat=VCFv4.0
    2. 

  2. ##fileDate=20110215
    3. 

  3. ##source=freeBayes version 0.4.1
    4. 

  4. ##reference=/d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa
    5. 

  5. ##phasing=none
    6. 

  6. ##commandline="/share/software/freebayes/bin/freebayes --stdin --no-filters --min-alternate-count 2 --posterior-integration-depth 100 --pvar 0.01 --vcf /d1/data/1000G/20101123/filteringTests/AFR/mosaik/noFilters/Pipeline/none//freebayes/freebayes.20:0-1000000.baq.20110210.vcf --fasta-reference /d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa --region 20:0..1000000"
    7. 

  7. ##vcfPytools=merge freebayes.20:0-1000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:1000000-2000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:2000000-3000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:3000000-4000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:4000000-5000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:5000000-6000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:6000000-7000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:7000000-8000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:8000000-9000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:9000000-10000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:10000000-11000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:11000000-12000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:12000000-13000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:13000000-14000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:14000000-15000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:15000000-16000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:16000000-17000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:17000000-18000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:18000000-19000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:19000000-20000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:20000000-21000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:21000000-22000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:22000000-23000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:23000000-24000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:24000000-25000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:25000000-26000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:26000000-27000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:27000000-28000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:28000000-29000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:29000000-30000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:30000000-31000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:31000000-32000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:32000000-33000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:33000000-34000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:34000000-35000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:35000000-36000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:36000000-37000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:37000000-38000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:38000000-39000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:39000000-40000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:40000000-41000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:41000000-42000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:42000000-43000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:43000000-44000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:44000000-45000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:45000000-46000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:46000000-47000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:47000000-48000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:48000000-49000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:49000000-50000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:50000000-51000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:51000000-52000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:52000000-53000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:53000000-54000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:54000000-55000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:55000000-56000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:56000000-57000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:57000000-58000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:58000000-59000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:59000000-60000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:60000000-61000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:61000000-62000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:62000000-63000000.baq.20110210.vcf, freebayes.20:63000000-63025520.baq.20110210.vcf
    8. 

  8. ##vcfPytools=
    9. 

  9. ##vcfPytools=annotated vcf file with dbSNP file /Users/rc/work/galaxy_lims/galaxy-central/database/files/000/dataset_60.dat
    10. 

  10. ##INFO=<ID=REPEAT,Number=1,Type=String,Description="Description of the local repeat structures flanking the current position">
    11. 

  11. ##INFO=<ID=DEL,Number=1,Type=Integer,Description="Length of deletion allele, if present">
    12. 

  12. ##INFO=<ID=INS,Number=1,Type=Integer,Description="Length of insertion allele, if present">
    13. 

  13. ##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total read depth at the locus">
    14. 

  14. ##INFO=<ID=TV,Number=0,Type=Flag,Description="transversion SNP">
    15. 

  15. ##INFO=<ID=TS,Number=0,Type=Flag,Description="transition SNP">
    16. 

  16. ##INFO=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
    17. 

  17. ##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data">
    18. 

  18. ##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
    19. 

  19. ##INFO=<ID=ABA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the alternate allele">
    20. 

  20. ##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alternate alleles in called genotypes">
    21. 

  21. ##INFO=<ID=AB,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
    22. 

  22. ##INFO=<ID=AF,Number=1,Type=Float,Description="Estimated allele frequency in the range (0,1]">
    23. 

  23. ##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
    24. 

  24. ##INFO=<ID=ABR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the reference allele">
    25. 

  25. ##INFO=<ID=RUN,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length: the number of consecutive nucleotides in the reference genome matching the alternate allele prior to the current position">
    26. 

  26. ##INFO=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
    27. 

  27. ##INFO=<ID=CpG,Number=0,Type=Flag,Description="CpG site (either CpG, TpG or CpA)">
    28. 

  28. ##INFO=<ID=MNP,Number=0,Type=Integer,Description="Length of MNP allele, if present">
    29. 

  29. ##INFO=<ID=SNP,Number=0,Type=Flag,Description="SNP allele">
    30. 

  30. ##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the alternate allele: a number between 0 and 1 representing the ratio of forward strand sequence reads showing the alternate allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
    31. 

  31. ##INFO=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
    32. 

  32. ##FORMAT=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
    33. 

  33. ##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
    34. 

  34. ##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
    35. 

  35. ##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
    36. 

  36. ##FORMAT=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
    37. 

  37. ##FORMAT=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
    38. 

  38. ##FORMAT=<ID=GL,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Likelihood">
    39. 

  39. ##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
    40. 

  40. #CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO
    41. 

  41. 20	60479	.	C	T	75.2	PASS	NS=368;DP=2111;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2096;AA=9;SR=1153|943;SA=5|4;SB=0.55556;AB=0.47059;ABR=8;ABA=9;RUN=2;SNP;TS
    42. 

  42. 20	60571	.	C	A	99.0	PASS	NS=366;DP=2338;AC=6;AN=732;AF=0.0081967;RA=2293;AA=30;SR=1123|1170;SA=19|11;SB=0.63333;AB=0.51515;ABR=17;ABA=16;RUN=1;SNP;TV
    43. 

  43. 20	60828	.	T	G	8.94	PASS	NS=361;DP=2341;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2267;AA=30;SR=1101|1166;SA=15|15;SB=0.5;AB=0.16667;ABR=1;ABA=4;RUN=3;SNP;TV
    44. 

  44. 20	61098	rs6078030	C	T	99.0	PASS	NS=366;DP=1780;AC=140;AN=732;AF=0.19126;RA=1457;AA=317;SR=600|857;SA=132|185;SB=0.4164;AB=0.56587;ABR=262;ABA=198;RUN=2;SNP;TS
    45. 

  45. 20	61270	.	A	C	1.01	PASS	NS=220;DP=449;AC=18;AN=440;AF=0.040909;RA=423;AA=23;SR=165|258;SA=6|17;SB=0.26087;AB=0.61111;ABR=11;ABA=7;RUN=1;SNP;TV
    46. 

  46. 20	61388	.	T	C	46.6	PASS	NS=314;DP=1036;AC=2;AN=628;AF=0.0031847;RA=1025;AA=6;SR=709|316;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
    47. 

  47. 20	61409	.	A	G	36.0	PASS	NS=340;DP=1212;AC=1;AN=680;AF=0.0014706;RA=1207;AA=4;SR=876|331;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    48. 

  48. 20	61517	.	C	T	13.8	PASS	NS=363;DP=2032;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2019;AA=7;SR=1200|819;SA=7|0;SB=1;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=4;SNP;TS
    49. 

  49. 20	61535	.	A	G	0.0666	PASS	NS=362;DP=2048;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2037;AA=4;SR=1150|887;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    50. 

  50. 20	61586	.	C	A	0.0941	PASS	NS=362;DP=1953;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1941;AA=6;SR=1062|879;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    51. 

  51. 20	61651	.	C	A	99.0	PASS	NS=369;DP=2217;AC=6;AN=738;AF=0.0081301;RA=2190;AA=22;SR=1230|960;SA=12|10;SB=0.54545;AB=0.41176;ABR=14;ABA=20;RUN=4;SNP;TV
    52. 

  52. 20	61724	.	A	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2442;AC=6;AN=738;AF=0.0081301;RA=2409;AA=29;SR=1205|1204;SA=16|13;SB=0.55172;AB=0.48889;ABR=22;ABA=23;RUN=2;SNP;TV
    53. 

  53. 20	61795	rs4814683	G	T	99.0	PASS	NS=368;DP=2464;AC=324;AN=736;AF=0.44022;RA=1426;AA=1032;SR=740|686;SA=519|513;SB=0.50291;AB=0.49956;ABR=568;ABA=565;RUN=1;SNP;TV
    54. 

  54. 20	61807	.	G	T	16.2	PASS	NS=369;DP=2523;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2506;AA=7;SR=1311|1195;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
    55. 

  55. 20	61848	.	A	G	0.0723	PASS	NS=370;DP=2478;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2458;AA=9;SR=1313|1145;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS;CpG
    56. 

  56. 20	61909	.	C	G	0.224	PASS	NS=366;DP=2253;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2240;AA=4;SR=1131|1109;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    57. 

  57. 20	61986	.	G	A	0.054	PASS	NS=364;DP=2106;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2072;AA=26;SR=906|1166;SA=0|26;SB=0;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    58. 

  58. 20	62100	rs6047235	T	C	82.3	PASS	NS=363;DP=2082;AC=3;AN=726;AF=0.0041322;RA=2069;AA=8;SR=1052|1017;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.5;ABR=7;ABA=7;RUN=1;SNP;TS
    59. 

  59. 20	62255	.	T	C	99.0	PASS	NS=361;DP=2204;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2195;AA=6;SR=1247|948;SA=6|0;SB=1;AB=0.57143;ABR=8;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
    60. 

  60. 20	62348	.	A	G	99.0	PASS	NS=350;DP=1861;AC=2;AN=700;AF=0.0028571;RA=1845;AA=10;SR=949|896;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.23077;ABR=3;ABA=10;RUN=1;SNP;TS
    61. 

  61. 20	62420	.	A	G	46.8	PASS	NS=364;DP=1821;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1812;AA=3;SR=933|879;SA=0|3;SB=0;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    62. 

  62. 20	62471	.	G	A	43.6	PASS	NS=350;DP=1782;AC=2;AN=700;AF=0.0028571;RA=1772;AA=7;SR=891|881;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.69231;ABR=9;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG
    63. 

  63. 20	62530	.	A	G	1.17	PASS	NS=364;DP=2137;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2129;AA=4;SR=1034|1095;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    64. 

  64. 20	62545	.	C	G	99.0	PASS	NS=348;DP=2043;AC=5;AN=696;AF=0.0071839;RA=2018;AA=17;SR=907|1111;SA=9|8;SB=0.52941;AB=0.44828;ABR=13;ABA=16;RUN=1;SNP;TV
    65. 

  65. 20	62553	.	T	C	0.193	PASS	NS=345;DP=2009;AC=2;AN=690;AF=0.0028986;RA=1986;AA=5;SR=869|1117;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TS
    66. 

  66. 20	62673	.	G	T	0.556	PASS	NS=359;DP=2225;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2218;AA=5;SR=1217|1001;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    67. 

  67. 20	62727	.	C	T	8.51	PASS	NS=347;DP=1801;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1794;AA=2;SR=906|888;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    68. 

  68. 20	62731	rs34147676	C	A	99.0	PASS	NS=345;DP=1727;AC=22;AN=690;AF=0.031884;RA=1666;AA=55;SR=840|826;SA=26|29;SB=0.47273;AB=0.53061;ABR=52;ABA=46;RUN=2;SNP;TV
    69. 

  69. 20	62739	.	T	C	7.0	PASS	NS=342;DP=1646;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1623;AA=7;SR=812|811;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    70. 

  70. 20	62770	.	G	C	3.33	PASS	NS=324;DP=1429;AC=1;AN=648;AF=0.0015432;RA=1422;AA=3;SR=655|767;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    71. 

  71. 20	62783	.	A	G	17.3	PASS	NS=328;DP=1471;AC=1;AN=656;AF=0.0015244;RA=1455;AA=8;SR=665|790;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    72. 

  72. 20	62881	.	G	T	0.253	PASS	NS=345;DP=1772;AC=1;AN=690;AF=0.0014493;RA=1761;AA=7;SR=910|851;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    73. 

  73. 20	62946	.	T	A	83.9	PASS	NS=349;DP=1880;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1868;AA=5;SR=787|1081;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.58333;ABR=7;ABA=5;RUN=2;SNP;TV
    74. 

  74. 20	62997	.	A	T	5.74	PASS	NS=364;DP=2195;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2190;AA=2;SR=1042|1148;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    75. 

  75. 20	63054	.	A	G	48.5	PASS	NS=364;DP=2097;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2082;AA=8;SR=1090|992;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=2;SNP;TS
    76. 

  76. 20	63055	.	A	G	0.234	PASS	NS=362;DP=2088;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2078;AA=4;SR=1096|982;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    77. 

  77. 20	63063	.	T	C	0.0841	PASS	NS=363;DP=2065;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2059;AA=2;SR=1083|976;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    78. 

  78. 20	63141	.	T	C	2.61	PASS	NS=360;DP=1900;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1891;AA=2;SR=1041|850;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    79. 

  79. 20	63197	.	T	A	0.305	PASS	NS=364;DP=2047;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2037;AA=5;SR=1067|970;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    80. 

  80. 20	63231	rs6076506	T	G	99.0	PASS	NS=360;DP=2025;AC=76;AN=720;AF=0.10556;RA=1828;AA=186;SR=914|914;SA=102|84;SB=0.54839;AB=0.52581;ABR=163;ABA=145;RUN=1;SNP;TV
    81. 

  81. 20	63244	rs6139074	A	C	99.0	PASS	NS=364;DP=1991;AC=84;AN=728;AF=0.11538;RA=1701;AA=284;SR=871|830;SA=132|152;SB=0.46479;AB=0.46951;ABR=154;ABA=174;RUN=2;SNP;TV
    82. 

  82. 20	63245	.	C	A	4.67	PASS	NS=364;DP=2000;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1990;AA=6;SR=1010|980;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    83. 

  83. 20	63351	.	A	G	30.7	PASS	NS=369;DP=2363;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2354;AA=5;SR=1414|940;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    84. 

  84. 20	63360	.	C	T	38.4	PASS	NS=367;DP=2348;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2334;AA=4;SR=1363|971;SA=0|4;SB=0;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
    85. 

  85. 20	63426	.	G	T	99.0	PASS	NS=369;DP=2178;AC=5;AN=738;AF=0.0067751;RA=2146;AA=17;SR=1263|883;SA=8|9;SB=0.47059;AB=0.69231;ABR=27;ABA=12;RUN=1;SNP;TV
    86. 

  86. 20	63452	.	C	G	99.0	PASS	NS=369;DP=2242;AC=22;AN=738;AF=0.02981;RA=2169;AA=68;SR=1220|949;SA=40|28;SB=0.58824;AB=0.47321;ABR=53;ABA=59;RUN=1;SNP;TV
    87. 

  87. 20	63466	.	A	G	0.305	PASS	NS=369;DP=2343;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2334;AA=3;SR=1290|1044;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    88. 

  88. 20	63521	.	G	A	33.5	PASS	NS=370;DP=2387;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2376;AA=3;SR=1217|1159;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    89. 

  89. 20	63680	.	A	G	0.841	PASS	NS=371;DP=2758;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2741;AA=5;SR=1422|1319;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
    90. 

  90. 20	63733	.	C	T	99.0	PASS	NS=366;DP=2571;AC=58;AN=732;AF=0.079235;RA=2363;AA=200;SR=1311|1052;SA=101|99;SB=0.505;AB=0.50291;ABR=173;ABA=171;RUN=1;SNP;TS;CpG
    91. 

  91. 20	63746	.	C	T	0.0651	PASS	NS=369;DP=2564;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2552;AA=3;SR=1391|1161;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    92. 

  92. 20	63799	rs1418258	C	T	99.0	PASS	NS=367;DP=2322;AC=331;AN=734;AF=0.45095;RA=1274;AA=1026;SR=610|664;SA=489|537;SB=0.47661;AB=0.53157;ABR=564;ABA=494;RUN=3;SNP;TS
    93. 

  93. 20	63808	.	G	C	99.0	PASS	NS=368;DP=2352;AC=61;AN=736;AF=0.08288;RA=2168;AA=171;SR=1043|1125;SA=80|91;SB=0.46784;AB=0.56869;ABR=178;ABA=134;RUN=1;SNP;TV
    94. 

  94. 20	63967	.	A	G	99.0	PASS	NS=370;DP=2363;AC=21;AN=740;AF=0.028378;RA=2276;AA=68;SR=911|1365;SA=26|42;SB=0.38235;AB=0.48837;ABR=63;ABA=66;RUN=1;SNP;TS
    95. 

  95. 20	63983	.	C	T	0.569	PASS	NS=371;DP=2349;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2334;AA=3;SR=892|1442;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    96. 

  96. 20	64016	.	G	A	32.3	PASS	NS=370;DP=2259;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2231;AA=15;SR=854|1377;SA=1|14;SB=0.066667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=2;SNP;TS
    97. 

  97. 20	64062	.	G	A	62.0	PASS	NS=370;DP=2274;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2264;AA=6;SR=953|1311;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=3;SNP;TS
    98. 

  98. 20	64150	rs7274499	C	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2268;AC=38;AN=736;AF=0.05163;RA=2160;AA=103;SR=881|1279;SA=41|62;SB=0.39806;AB=0.545;ABR=109;ABA=90;RUN=1;SNP;TV
    99. 

  99. 20	64175	.	A	G	97.6	PASS	NS=369;DP=2213;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2192;AA=10;SR=838|1354;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=3;SNP;TS
    100. 

  100. 20	64186	.	C	G	99.0	PASS	NS=369;DP=2166;AC=4;AN=738;AF=0.0054201;RA=2111;AA=20;SR=858|1253;SA=9|11;SB=0.45;AB=0.5;ABR=12;ABA=12;RUN=1;SNP;TV
    101. 

  101. 20	64539	.	A	T	0.0711	PASS	NS=352;DP=1674;AC=1;AN=704;AF=0.0014205;RA=1667;AA=4;SR=856|811;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=5;SNP;TV
    102. 

  102. 20	64560	.	A	G	0.0799	PASS	NS=358;DP=1831;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1824;AA=4;SR=1057|767;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    103. 

  103. 20	64568	.	A	C	1.98	PASS	NS=355;DP=1856;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1842;AA=7;SR=1124|718;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    104. 

  104. 20	64587	.	A	G	1.36	PASS	NS=357;DP=1971;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1963;AA=3;SR=1234|729;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    105. 

  105. 20	64597	.	T	C	0.152	PASS	NS=359;DP=1981;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1974;AA=3;SR=1238|736;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
    106. 

  106. 20	64618	.	G	A	0.794	PASS	NS=361;DP=2018;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2011;AA=3;SR=1263|748;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=4;SNP;TS
    107. 

  107. 20	64624	.	T	C	5.08	PASS	NS=364;DP=2000;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1994;AA=3;SR=1238|756;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    108. 

  108. 20	64625	.	A	G	99.0	PASS	NS=363;DP=1995;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1980;AA=7;SR=1229|751;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
    109. 

  109. 20	64647	.	T	C	0.188	PASS	NS=362;DP=1911;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1899;AA=5;SR=1157|742;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    110. 

  110. 20	64656	.	C	T	2.15	PASS	NS=368;DP=1875;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1866;AA=3;SR=1113|753;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    111. 

  111. 20	64672	.	T	C	48.3	PASS	NS=365;DP=1877;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1869;AA=5;SR=1097|772;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.375;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
    112. 

  112. 20	64771	.	A	G	0.563	PASS	NS=365;DP=2023;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2017;AA=2;SR=1315|702;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    113. 

  113. 20	64898	.	G	A	49.7	PASS	NS=371;DP=2342;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2329;AA=7;SR=1249|1080;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
    114. 

  114. 20	64913	.	G	T	0.846	PASS	NS=370;DP=2344;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2333;AA=5;SR=1234|1099;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    115. 

  115. 20	65122	.	T	C	1.23	PASS	NS=368;DP=2280;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2265;AA=3;SR=976|1289;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    116. 

  116. 20	65173	.	C	G	12.2	PASS	NS=370;DP=2118;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2104;AA=4;SR=947|1157;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    117. 

  117. 20	65240	.	G	A	89.4	PASS	NS=364;DP=2106;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=2087;AA=8;SR=941|1146;SA=0|8;SB=0;AB=0.25;ABR=2;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
    118. 

  118. 20	65241	.	T	C	0.371	PASS	NS=364;DP=2101;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2087;AA=8;SR=934|1153;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    119. 

  119. 20	65288	rs13043000	G	T	99.0	PASS	NS=364;DP=2003;AC=21;AN=728;AF=0.028846;RA=1924;AA=76;SR=915|1009;SA=29|47;SB=0.38158;AB=0.4963;ABR=67;ABA=68;RUN=1;SNP;TV
    120. 

  120. 20	65317	.	A	C	0.0806	PASS	NS=365;DP=1967;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1957;AA=4;SR=954|1003;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    121. 

  121. 20	65335	.	T	G	99.0	PASS	NS=363;DP=1773;AC=12;AN=726;AF=0.016529;RA=1744;AA=22;SR=831|913;SA=11|11;SB=0.5;AB=0.46875;ABR=15;ABA=17;RUN=1;SNP;TV
    122. 

  122. 20	65338	.	A	T	0.813	PASS	NS=362;DP=1726;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1715;AA=3;SR=799|916;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    123. 

  123. 20	65562	.	A	G	6.8	PASS	NS=325;DP=1375;AC=2;AN=650;AF=0.0030769;RA=1343;AA=4;SR=759|584;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    124. 

  124. 20	65578	.	T	C	3.24	PASS	NS=327;DP=1379;AC=1;AN=654;AF=0.0015291;RA=1375;AA=3;SR=790|585;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    125. 

  125. 20	65632	.	C	T	40.9	PASS	NS=366;DP=1714;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1703;AA=5;SR=918|785;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
    126. 

  126. 20	65850	.	G	A	0.111	PASS	NS=307;DP=1146;AC=1;AN=614;AF=0.0016287;RA=1128;AA=3;SR=696|432;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    127. 

  127. 20	65900	rs6053810	G	A	99.0	PASS	NS=325;DP=1412;AC=530;AN=650;AF=0.81538;RA=271;AA=1129;SR=145|126;SA=639|490;SB=0.56599;AB=0.47594;ABR=178;ABA=193;RUN=1;SNP;TS;CpG
    128. 

  128. 20	65986	.	G	A	8.36	PASS	NS=370;DP=2269;AC=3;AN=740;AF=0.0040541;RA=2255;AA=6;SR=1197|1058;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    129. 

  129. 20	66029	.	T	C	0.101	PASS	NS=339;DP=1544;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1526;AA=7;SR=748|778;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    130. 

  130. 20	66060	.	C	T	6.42	PASS	NS=324;DP=1304;AC=1;AN=648;AF=0.0015432;RA=1297;AA=3;SR=613|684;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    131. 

  131. 20	66248	.	C	T	12.0	PASS	NS=288;DP=1080;AC=1;AN=576;AF=0.0017361;RA=1074;AA=2;SR=440|634;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    132. 

  132. 20	66370	rs6054257	G	A	99.0	PASS	NS=262;DP=824;AC=404;AN=524;AF=0.77099;RA=185;AA=629;SR=79|106;SA=267|362;SB=0.42448;AB=0.55801;ABR=101;ABA=79;RUN=1;SNP;TS
    133. 

  133. 20	66388	.	C	T	0.809	PASS	NS=269;DP=809;AC=1;AN=538;AF=0.0018587;RA=798;AA=3;SR=351|447;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    134. 

  134. 20	66620	.	C	T	2.19	PASS	NS=338;DP=1326;AC=1;AN=676;AF=0.0014793;RA=1319;AA=3;SR=634|685;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=4;SNP;TS
    135. 

  135. 20	66705	.	C	T	4.94	PASS	NS=292;DP=835;AC=8;AN=584;AF=0.013699;RA=819;AA=10;SR=483|336;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.5;ABR=6;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
    136. 

  136. 20	66890	.	G	T	6.54	PASS	NS=313;DP=1102;AC=1;AN=626;AF=0.0015974;RA=1097;AA=4;SR=670|427;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    137. 

  137. 20	67080	.	A	G	0.371	PASS	NS=355;DP=1745;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1732;AA=4;SR=907|825;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
    138. 

  138. 20	67421	.	A	C	0.0555	PASS	NS=363;DP=1999;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1990;AA=6;SR=945|1045;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
    139. 

  139. 20	67461	.	A	G	99.0	PASS	NS=357;DP=1894;AC=4;AN=714;AF=0.0056022;RA=1872;AA=14;SR=841|1031;SA=8|6;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=13;ABA=13;RUN=2;SNP;TS;CpG
    140. 

  140. 20	67563	.	A	G	3.64	PASS	NS=360;DP=1912;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1904;AA=4;SR=1033|871;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    141. 

  141. 20	67572	.	A	T	0.0602	PASS	NS=363;DP=1887;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1871;AA=6;SR=1028|843;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=2;SNP;TV
    142. 

  142. 20	67573	.	C	T	4.67	PASS	NS=364;DP=1888;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1878;AA=6;SR=1028|850;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    143. 

  143. 20	67641	.	C	T	99.0	PASS	NS=364;DP=1910;AC=23;AN=728;AF=0.031593;RA=1837;AA=67;SR=897|940;SA=35|32;SB=0.52239;AB=0.52679;ABR=59;ABA=53;RUN=1;SNP;TS
    144. 

  144. 20	67644	.	T	C	40.4	PASS	NS=365;DP=1899;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=1887;AA=9;SR=933|954;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG
    145. 

  145. 20	67646	.	G	A	3.98	PASS	NS=365;DP=1897;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1877;AA=6;SR=923|954;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    146. 

  146. 20	67752	.	T	A	0.292	PASS	NS=367;DP=2181;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2163;AA=6;SR=1201|962;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.82353;ABR=14;ABA=3;RUN=2;SNP;TV
    147. 

  147. 20	67760	.	C	T	67.6	PASS	NS=367;DP=2169;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2152;AA=5;SR=1181|971;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG
    148. 

  148. 20	67765	.	C	T	99.0	PASS	NS=369;DP=2200;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2178;AA=11;SR=1201|977;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.42857;ABR=6;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG
    149. 

  149. 20	67831	.	C	T	0.781	PASS	NS=371;DP=2294;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2281;AA=5;SR=1237|1044;SA=2|3;SB=0.4;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=4;SNP;TS
    150. 

  150. 20	67949	.	G	T	10.4	PASS	NS=366;DP=2315;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2282;AA=12;SR=1321|961;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    151. 

  151. 20	67976	.	T	A	0.679	PASS	NS=369;DP=2408;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2397;AA=6;SR=1299|1098;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    152. 

  152. 20	68015	.	C	T	0.113	PASS	NS=369;DP=2466;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2453;AA=5;SR=1313|1140;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.875;ABR=14;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    153. 

  153. 20	68055	.	A	G	0.102	PASS	NS=370;DP=2540;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2522;AA=5;SR=1296|1226;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    154. 

  154. 20	68075	.	T	C	0.0657	PASS	NS=370;DP=2582;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2562;AA=8;SR=1291|1271;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    155. 

  155. 20	68123	.	C	A	0.0592	PASS	NS=369;DP=2705;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2685;AA=13;SR=1300|1385;SA=11|2;SB=0.84615;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
    156. 

  156. 20	68182	.	A	T	99.0	PASS	NS=368;DP=2675;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2653;AA=10;SR=1458|1195;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.2;ABR=2;ABA=8;RUN=2;SNP;TV
    157. 

  157. 20	68190	.	T	C	0.109	PASS	NS=368;DP=2678;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2661;AA=5;SR=1481|1180;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
    158. 

  158. 20	68205	.	A	G	31.9	PASS	NS=369;DP=2686;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2672;AA=6;SR=1492|1180;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    159. 

  159. 20	68264	rs60878529	T	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2558;AC=98;AN=738;AF=0.13279;RA=2173;AA=376;SR=1055|1118;SA=202|174;SB=0.53723;AB=0.48951;ABR=280;ABA=292;RUN=1;SNP;TS
    160. 

  160. 20	68474	.	A	G	31.0	PASS	NS=370;DP=2532;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2507;AA=14;SR=1171|1336;SA=2|12;SB=0.14286;AB=0.58333;ABR=7;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
    161. 

  161. 20	68505	.	A	G	0.483	PASS	NS=369;DP=2490;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2477;AA=3;SR=1140|1337;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    162. 

  162. 20	68535	.	G	A	99.0	PASS	NS=369;DP=2573;AC=12;AN=738;AF=0.01626;RA=2503;AA=58;SR=1186|1317;SA=32|26;SB=0.55172;AB=0.50893;ABR=57;ABA=55;RUN=1;SNP;TS
    163. 

  163. 20	68618	.	G	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2561;AC=21;AN=736;AF=0.028533;RA=2451;AA=93;SR=1224|1227;SA=48|45;SB=0.51613;AB=0.45517;ABR=66;ABA=78;RUN=1;SNP;TS
    164. 

  164. 20	68657	.	C	A	3.85	PASS	NS=370;DP=2602;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2585;AA=9;SR=1214|1371;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    165. 

  165. 20	68660	.	C	A	99.0	PASS	NS=370;DP=2608;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2591;AA=14;SR=1221|1370;SA=8|6;SB=0.57143;AB=0.44;ABR=11;ABA=14;RUN=2;SNP;TV
    166. 

  166. 20	68664	.	A	C	0.0666	PASS	NS=370;DP=2602;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2571;AA=12;SR=1212|1359;SA=6|6;SB=0.5;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
    167. 

  167. 20	68667	.	T	G	99.0	PASS	NS=370;DP=2607;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2584;AA=15;SR=1201|1383;SA=5|10;SB=0.33333;AB=0.41176;ABR=7;ABA=10;RUN=2;SNP;TV
    168. 

  168. 20	68749	rs6086616	T	C	99.0	PASS	NS=368;DP=2323;AC=426;AN=736;AF=0.5788;RA=983;AA=1334;SR=457|526;SA=640|694;SB=0.47976;AB=0.47215;ABR=568;ABA=632;RUN=1;SNP;TS;CpG
    169. 

  169. 20	68799	.	T	C	1.55	PASS	NS=367;DP=2269;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2213;AA=15;SR=1064|1149;SA=14|1;SB=0.93333;AB=0.66667;ABR=8;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
    170. 

  170. 20	68815	.	C	T	0.275	PASS	NS=367;DP=2245;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2226;AA=3;SR=1051|1175;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    171. 

  171. 20	68826	.	A	T	2.17	PASS	NS=370;DP=2244;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2223;AA=5;SR=1043|1180;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    172. 

  172. 20	68926	.	T	C	0.43	PASS	NS=369;DP=2139;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2120;AA=4;SR=904|1216;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.61538;ABR=8;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    173. 

  173. 20	68975	.	C	G	1.62	PASS	NS=367;DP=2121;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2105;AA=4;SR=767|1338;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    174. 

  174. 20	68987	.	G	T	2.55	PASS	NS=369;DP=2074;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2059;AA=8;SR=732|1327;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    175. 

  175. 20	69049	.	T	A	0.201	PASS	NS=361;DP=2045;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2038;AA=5;SR=936|1102;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    176. 

  176. 20	69066	.	C	G	14.2	PASS	NS=360;DP=2078;AC=3;AN=720;AF=0.0041667;RA=2069;AA=8;SR=1074|995;SA=1|7;SB=0.125;AB=0.45455;ABR=5;ABA=6;RUN=2;SNP;TV
    177. 

  177. 20	69094	rs6039403	G	A	99.0	PASS	NS=362;DP=2092;AC=318;AN=724;AF=0.43923;RA=1227;AA=857;SR=691|536;SA=451|406;SB=0.52625;AB=0.49681;ABR=389;ABA=392;RUN=1;SNP;TS
    178. 

  178. 20	69130	.	C	A	11.5	PASS	NS=365;DP=2014;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2007;AA=3;SR=1082|925;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    179. 

  179. 20	69145	.	A	G	0.195	PASS	NS=367;DP=1999;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=1991;AA=5;SR=1033|958;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG
    180. 

  180. 20	69262	.	A	T	1.7	PASS	NS=365;DP=2053;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2047;AA=3;SR=1145|902;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
    181. 

  181. 20	69305	.	T	C	0.123	PASS	NS=367;DP=1964;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=1956;AA=3;SR=1101|855;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    182. 

  182. 20	69355	.	C	T	4.52	PASS	NS=367;DP=2009;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2000;AA=3;SR=970|1030;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
    183. 

  183. 20	69376	.	G	A	0.665	PASS	NS=367;DP=2085;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2077;AA=3;SR=1003|1074;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    184. 

  184. 20	69408	rs17685809	C	T	99.0	PASS	NS=366;DP=2154;AC=38;AN=732;AF=0.051913;RA=2013;AA=133;SR=894|1119;SA=60|73;SB=0.45113;AB=0.51685;ABR=138;ABA=128;RUN=1;SNP;TS;CpG
    185. 

  185. 20	69486	.	C	G	0.0652	PASS	NS=362;DP=1836;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1820;AA=2;SR=1092|728;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    186. 

  186. 20	69641	.	C	A	0.0576	PASS	NS=367;DP=2135;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2121;AA=8;SR=1038|1083;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.8125;ABR=13;ABA=3;RUN=3;SNP;TV
    187. 

  187. 20	69656	.	T	C	0.253	PASS	NS=366;DP=2096;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2090;AA=2;SR=1030|1060;SA=0|2;SB=0;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    188. 

  188. 20	69668	.	T	C	40.6	PASS	NS=365;DP=2114;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2104;AA=6;SR=1026|1078;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
    189. 

  189. 20	69707	.	T	A	0.375	PASS	NS=366;DP=2148;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2143;AA=2;SR=1011|1132;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
    190. 

  190. 20	69723	.	T	A	0.883	PASS	NS=363;DP=2037;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2026;AA=2;SR=945|1081;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    191. 

  191. 20	69752	.	A	C	1.31	PASS	NS=362;DP=1984;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1977;AA=2;SR=932|1045;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    192. 

  192. 20	69821	.	A	T	0.479	PASS	NS=364;DP=1967;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1960;AA=3;SR=958|1002;SA=3|0;SB=1;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=4;SNP;TV
    193. 

  193. 20	69835	.	A	G	0.671	PASS	NS=363;DP=1953;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1943;AA=5;SR=936|1007;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    194. 

  194. 20	69903	.	T	A	0.0459	PASS	NS=362;DP=1913;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1904;AA=5;SR=821|1083;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    195. 

  195. 20	69951	.	A	T	0.159	PASS	NS=354;DP=1819;AC=2;AN=708;AF=0.0028249;RA=1810;AA=8;SR=774|1036;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=4;SNP;TV
    196. 

  196. 20	69966	.	T	C	0.661	PASS	NS=351;DP=1768;AC=2;AN=702;AF=0.002849;RA=1762;AA=4;SR=773|989;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
    197. 

  197. 20	70470	.	A	G	4.57	PASS	NS=359;DP=1690;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1681;AA=2;SR=1065|616;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    198. 

  198. 20	70490	.	C	T	0.934	PASS	NS=358;DP=1682;AC=5;AN=716;AF=0.0069832;RA=1665;AA=12;SR=962|703;SA=11|1;SB=0.91667;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=5;SNP;TS
    199. 

  199. 20	70604	.	A	T	0.698	PASS	NS=360;DP=1795;AC=2;AN=720;AF=0.0027778;RA=1776;AA=10;SR=1075|701;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=4;SNP;TV
    200. 

  200. 20	70611	.	G	A	0.143	PASS	NS=362;DP=1806;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1788;AA=5;SR=1077|711;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    201. 

  201. 20	70696	.	T	C	1.72	PASS	NS=365;DP=1849;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1839;AA=4;SR=983|856;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    202. 

  202. 20	70785	.	A	G	99.0	PASS	NS=368;DP=1990;AC=14;AN=736;AF=0.019022;RA=1938;AA=40;SR=1005|933;SA=20|20;SB=0.5;AB=0.51852;ABR=42;ABA=38;RUN=1;SNP;TS
    203. 

  203. 20	70804	.	C	T	4.03	PASS	NS=369;DP=2057;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2042;AA=5;SR=1069|973;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    204. 

  204. 20	70917	.	T	C	1.54	PASS	NS=369;DP=2193;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2182;AA=2;SR=1110|1072;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    205. 

  205. 20	70920	.	A	G	99.0	PASS	NS=368;DP=2172;AC=13;AN=736;AF=0.017663;RA=2121;AA=45;SR=1084|1037;SA=24|21;SB=0.53333;AB=0.38462;ABR=25;ABA=40;RUN=2;SNP;TS
    206. 

  206. 20	70980	rs60263736	G	A	99.0	PASS	NS=368;DP=2339;AC=39;AN=736;AF=0.052989;RA=2221;AA=106;SR=1223|998;SA=71|35;SB=0.66981;AB=0.57416;ABR=120;ABA=89;RUN=1;SNP;TS
    207. 

  207. 20	71013	.	A	C	0.0504	PASS	NS=371;DP=2390;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2371;AA=12;SR=1359|1012;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
    208. 

  208. 20	71015	.	T	C	0.569	PASS	NS=371;DP=2398;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2390;AA=5;SR=1364|1026;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
    209. 

  209. 20	71037	.	T	C	0.223	PASS	NS=369;DP=2289;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2279;AA=4;SR=1353|926;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    210. 

  210. 20	71079	rs6040382	C	T	99.0	PASS	NS=370;DP=2338;AC=60;AN=740;AF=0.081081;RA=2168;AA=166;SR=1421|747;SA=102|64;SB=0.61446;AB=0.53086;ABR=129;ABA=113;RUN=1;SNP;TS
    211. 

  211. 20	71093	rs6040395	G	A	99.0	PASS	NS=365;DP=2393;AC=93;AN=730;AF=0.1274;RA=2085;AA=299;SR=1382|703;SA=194|105;SB=0.64883;AB=0.5317;ABR=260;ABA=225;RUN=1;SNP;TS
    212. 

  212. 20	71281	.	G	A	66.6	PASS	NS=369;DP=2496;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2481;AA=11;SR=1273|1208;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.66667;ABR=12;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG
    213. 

  213. 20	71290	.	A	G	0.526	PASS	NS=368;DP=2466;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2448;AA=4;SR=1262|1186;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
    214. 

  214. 20	71454	.	T	C	0.691	PASS	NS=370;DP=2518;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2498;AA=5;SR=1203|1295;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    215. 

  215. 20	71543	.	A	G	1.37	PASS	NS=369;DP=2378;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2369;AA=6;SR=1023|1346;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG
    216. 

  216. 20	71549	.	G	T	99.0	PASS	NS=370;DP=2354;AC=49;AN=740;AF=0.066216;RA=2139;AA=210;SR=769|1370;SA=208|2;SB=0.99048;AB=0.68065;ABR=211;ABA=99;RUN=4;SNP;TV
    217. 

  217. 20	71726	.	C	A	5.19	PASS	NS=363;DP=2309;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2301;AA=3;SR=1162|1139;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    218. 

  218. 20	71809	.	G	A	27.3	PASS	NS=354;DP=1947;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1937;AA=3;SR=923|1014;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    219. 

  219. 20	71850	.	T	C	0.131	PASS	NS=358;DP=2062;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2055;AA=2;SR=1053|1002;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    220. 

  220. 20	71859	.	G	A	14.4	PASS	NS=355;DP=2030;AC=3;AN=710;AF=0.0042254;RA=2010;AA=7;SR=1055|955;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG
    221. 

  221. 20	71926	.	T	A	4.2	PASS	NS=336;DP=1791;AC=1;AN=672;AF=0.0014881;RA=1787;AA=2;SR=879|908;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    222. 

  222. 20	71929	.	T	A	0.237	PASS	NS=336;DP=1782;AC=1;AN=672;AF=0.0014881;RA=1773;AA=3;SR=875|898;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    223. 

  223. 20	72002	.	A	C	0.101	PASS	NS=340;DP=1976;AC=1;AN=680;AF=0.0014706;RA=1960;AA=10;SR=1100|860;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
    224. 

  224. 20	72036	.	G	A	99.0	PASS	NS=349;DP=2037;AC=6;AN=698;AF=0.008596;RA=2022;AA=11;SR=1106|916;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.60714;ABR=17;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG
    225. 

  225. 20	72206	.	T	G	1.43	PASS	NS=370;DP=2151;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2144;AA=4;SR=1129|1015;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    226. 

  226. 20	72287	.	A	G	0.0526	PASS	NS=369;DP=2216;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2210;AA=2;SR=1016|1194;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    227. 

  227. 20	72331	.	T	A	0.125	PASS	NS=367;DP=2265;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2246;AA=7;SR=1089|1157;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    228. 

  228. 20	72406	.	C	T	0.0949	PASS	NS=366;DP=2205;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2191;AA=2;SR=1075|1116;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    229. 

  229. 20	72570	.	C	A	2.37	PASS	NS=365;DP=1829;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1810;AA=13;SR=969|841;SA=6|7;SB=0.46154;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    230. 

  230. 20	72604	.	A	G	2.22	PASS	NS=363;DP=2084;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2079;AA=3;SR=1043|1036;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    231. 

  231. 20	72632	rs60387861	G	T	99.0	PASS	NS=367;DP=2170;AC=21;AN=734;AF=0.02861;RA=2099;AA=67;SR=1017|1082;SA=36|31;SB=0.53731;AB=0.54167;ABR=65;ABA=55;RUN=2;SNP;TV
    232. 

  232. 20	72665	.	G	A	99.0	PASS	NS=365;DP=2216;AC=3;AN=730;AF=0.0041096;RA=2198;AA=11;SR=1006|1192;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.5;ABR=10;ABA=10;RUN=2;SNP;TS
    233. 

  233. 20	72719	rs11698144	C	T	99.0	PASS	NS=360;DP=2045;AC=12;AN=720;AF=0.016667;RA=2005;AA=33;SR=968|1037;SA=19|14;SB=0.57576;AB=0.52174;ABR=36;ABA=32;RUN=3;SNP;TS
    234. 

  234. 20	72747	.	T	A	0.163	PASS	NS=368;DP=2073;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2062;AA=4;SR=1092|970;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    235. 

  235. 20	72771	.	A	T	1.48	PASS	NS=371;DP=2071;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2062;AA=3;SR=1149|913;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    236. 

  236. 20	72772	.	A	G	0.311	PASS	NS=371;DP=2065;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2051;AA=5;SR=1145|906;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    237. 

  237. 20	72815	.	T	C	25.8	PASS	NS=367;DP=2079;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2062;AA=8;SR=1133|929;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
    238. 

  238. 20	72820	.	C	A	3.07	PASS	NS=366;DP=2061;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2048;AA=5;SR=1097|951;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    239. 

  239. 20	72882	.	T	C	4.28	PASS	NS=369;DP=2031;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2013;AA=5;SR=914|1099;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    240. 

  240. 20	72887	.	A	G	2.42	PASS	NS=367;DP=2020;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2004;AA=6;SR=906|1098;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
    241. 

  241. 20	72890	.	A	G	1.25	PASS	NS=366;DP=2018;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2006;AA=3;SR=910|1096;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    242. 

  242. 20	72892	rs16987437	G	A	99.0	PASS	NS=365;DP=2011;AC=36;AN=730;AF=0.049315;RA=1913;AA=88;SR=863|1050;SA=43|45;SB=0.48864;AB=0.56647;ABR=98;ABA=73;RUN=5;SNP;TS
    243. 

  243. 20	72894	.	T	C	77.5	PASS	NS=365;DP=2035;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2010;AA=11;SR=921|1089;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG
    244. 

  244. 20	73014	.	C	G	12.4	PASS	NS=368;DP=2017;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1989;AA=3;SR=858|1131;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    245. 

  245. 20	73136	.	T	A	5.76	PASS	NS=282;DP=784;AC=3;AN=564;AF=0.0053191;RA=758;AA=7;SR=402|356;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    246. 

  246. 20	73268	.	G	T	0.0695	PASS	NS=346;DP=1716;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1710;AA=4;SR=1061|649;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
    247. 

  247. 20	73369	.	C	T	5.68	PASS	NS=365;DP=1955;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1943;AA=6;SR=800|1143;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=4;SNP;TS
    248. 

  248. 20	73416	.	C	T	0.0527	PASS	NS=362;DP=1908;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1894;AA=3;SR=937|957;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    249. 

  249. 20	73431	.	C	G	1.76	PASS	NS=363;DP=1863;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1856;AA=3;SR=950|906;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    250. 

  250. 20	73719	.	C	A	99.0	PASS	NS=277;DP=997;AC=18;AN=554;AF=0.032491;RA=964;AA=30;SR=443|521;SA=18|12;SB=0.6;AB=0.40909;ABR=9;ABA=13;RUN=1;SNP;TV
    251. 

  251. 20	73767	.	A	G	3.17	PASS	NS=284;DP=893;AC=1;AN=568;AF=0.0017606;RA=883;AA=3;SR=402|481;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
    252. 

  252. 20	73852	.	T	G	99.0	PASS	NS=335;DP=1416;AC=7;AN=670;AF=0.010448;RA=1377;AA=28;SR=855|522;SA=8|20;SB=0.28571;AB=0.375;ABR=9;ABA=15;RUN=2;SNP;TV
    253. 

  253. 20	73858	.	C	T	96.7	PASS	NS=341;DP=1497;AC=9;AN=682;AF=0.013196;RA=1483;AA=13;SR=916|567;SA=8|5;SB=0.61538;AB=0.64516;ABR=20;ABA=11;RUN=1;SNP;TS
    254. 

  254. 20	73888	.	G	A	0.0568	PASS	NS=351;DP=1692;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1679;AA=4;SR=945|734;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    255. 

  255. 20	73957	.	G	A	13.1	PASS	NS=368;DP=2167;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2158;AA=3;SR=1176|982;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
    256. 

  256. 20	74009	.	C	T	3.44	PASS	NS=369;DP=2230;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2224;AA=2;SR=1283|941;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    257. 

  257. 20	74053	.	A	T	6.52	PASS	NS=366;DP=2231;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2219;AA=4;SR=1326|893;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    258. 

  258. 20	74073	.	T	A	0.0672	PASS	NS=365;DP=2246;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2237;AA=2;SR=1302|935;SA=2|0;SB=1;AB=0.4;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    259. 

  259. 20	74142	.	A	G	0.849	PASS	NS=370;DP=2293;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2273;AA=7;SR=1239|1034;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    260. 

  260. 20	74232	.	T	C	0.106	PASS	NS=366;DP=2368;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2348;AA=6;SR=1206|1142;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    261. 

  261. 20	74247	.	T	C	99.0	PASS	NS=365;DP=2372;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2353;AA=9;SR=1194|1159;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.3;ABR=3;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG
    262. 

  262. 20	74281	.	C	T	3.59	PASS	NS=366;DP=2430;AC=2;AN=732;AF=0.0027322;RA=2418;AA=5;SR=1176|1242;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TS
    263. 

  263. 20	74297	.	A	T	0.214	PASS	NS=367;DP=2402;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2379;AA=5;SR=1148|1231;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    264. 

  264. 20	74347	rs6135141	G	A	99.0	PASS	NS=371;DP=2504;AC=76;AN=742;AF=0.10243;RA=2237;AA=253;SR=1152|1085;SA=127|126;SB=0.50198;AB=0.52459;ABR=224;ABA=203;RUN=1;SNP;TS
    265. 

  265. 20	74355	.	G	T	0.613	PASS	NS=368;DP=2548;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2530;AA=9;SR=1322|1208;SA=5|4;SB=0.55556;AB=0.8125;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    266. 

  266. 20	74545	.	T	A	1.96	PASS	NS=361;DP=2030;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2012;AA=12;SR=933|1079;SA=4|8;SB=0.33333;AB=0.55;ABR=11;ABA=9;RUN=1;SNP;TV
    267. 

  267. 20	74595	.	G	C	0.696	PASS	NS=364;DP=2054;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2046;AA=4;SR=1037|1009;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    268. 

  268. 20	74617	.	A	G	4.15	PASS	NS=365;DP=2159;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2139;AA=6;SR=1030|1109;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    269. 

  269. 20	74651	.	T	G	55.6	PASS	NS=367;DP=2262;AC=3;AN=734;AF=0.0040872;RA=2241;AA=12;SR=985|1256;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.46154;ABR=6;ABA=7;RUN=1;SNP;TV
    270. 

  270. 20	74747	.	C	T	0.125	PASS	NS=355;DP=2085;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=2069;AA=10;SR=1059|1010;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=2;SNP;TS
    271. 

  271. 20	74776	.	T	C	0.0648	PASS	NS=357;DP=2083;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2066;AA=5;SR=1096|970;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    272. 

  272. 20	74801	.	T	C	0.234	PASS	NS=361;DP=1925;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1921;AA=2;SR=960|961;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    273. 

  273. 20	74873	.	T	A	0.0536	PASS	NS=337;DP=1479;AC=2;AN=674;AF=0.0029674;RA=1470;AA=4;SR=610|860;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TV
    274. 

  274. 20	74885	.	C	A	0.412	PASS	NS=342;DP=1549;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1540;AA=4;SR=692|848;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=5;SNP;TV
    275. 

  275. 20	74995	.	T	A	0.177	PASS	NS=365;DP=2238;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2203;AA=16;SR=1233|970;SA=14|2;SB=0.875;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
    276. 

  276. 20	75003	.	T	A	0.703	PASS	NS=365;DP=2252;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2235;AA=3;SR=1241|994;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    277. 

  277. 20	75026	.	G	A	6.27	PASS	NS=361;DP=2078;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2063;AA=9;SR=1109|954;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=6;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
    278. 

  278. 20	75040	.	T	C	2.13	PASS	NS=367;DP=2087;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2076;AA=3;SR=1074|1002;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    279. 

  279. 20	75245	.	T	A	3.0	PASS	NS=363;DP=2162;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2150;AA=3;SR=1018|1132;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    280. 

  280. 20	75254	rs892665	C	A	99.0	PASS	NS=362;DP=2018;AC=255;AN=724;AF=0.35221;RA=1339;AA=657;SR=615|724;SA=345|312;SB=0.52511;AB=0.52083;ABR=450;ABA=401;RUN=2;SNP;TV
    281. 

  281. 20	75280	.	A	G	0.0778	PASS	NS=350;DP=1862;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1823;AA=17;SR=786|1037;SA=0|17;SB=0;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
    282. 

  282. 20	75389	.	C	T	2.19	PASS	NS=361;DP=2144;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2136;AA=4;SR=1054|1082;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    283. 

  283. 20	75514	.	C	T	0.116	PASS	NS=369;DP=2263;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2248;AA=7;SR=1190|1058;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS
    284. 

  284. 20	75516	.	A	G	99.0	PASS	NS=369;DP=2296;AC=5;AN=738;AF=0.0067751;RA=2273;AA=14;SR=1217|1056;SA=3|11;SB=0.21429;AB=0.42105;ABR=8;ABA=11;RUN=1;SNP;TS
    285. 

  285. 20	75691	.	C	G	1.39	PASS	NS=370;DP=2164;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2149;AA=6;SR=933|1216;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    286. 

  286. 20	75729	.	C	G	99.0	PASS	NS=368;DP=2200;AC=13;AN=736;AF=0.017663;RA=2156;AA=37;SR=1063|1093;SA=19|18;SB=0.51351;AB=0.50667;ABR=38;ABA=36;RUN=1;SNP;TV
    287. 

  287. 20	75790	.	G	T	0.37	PASS	NS=366;DP=2147;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2139;AA=5;SR=1124|1015;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=4;SNP;TV
    288. 

  288. 20	75813	.	G	T	45.2	PASS	NS=367;DP=2170;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2155;AA=11;SR=1100|1055;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=2;SNP;TV
    289. 

  289. 20	75880	.	G	A	4.19	PASS	NS=369;DP=2153;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2139;AA=7;SR=1037|1102;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=3;SNP;TS
    290. 

  290. 20	75999	.	T	C	99.0	PASS	NS=371;DP=2394;AC=21;AN=742;AF=0.028302;RA=2315;AA=63;SR=1290|1025;SA=41|22;SB=0.65079;AB=0.50794;ABR=64;ABA=61;RUN=1;SNP;TS
    291. 

  291. 20	76282	.	G	A	2.2	PASS	NS=370;DP=2122;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2113;AA=2;SR=1137|976;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    292. 

  292. 20	76316	.	T	G	0.0522	PASS	NS=353;DP=2029;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2019;AA=6;SR=1099|920;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
    293. 

  293. 20	76317	.	A	T	0.0577	PASS	NS=353;DP=2039;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2028;AA=4;SR=1106|922;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TV
    294. 

  294. 20	76388	.	G	A	99.0	PASS	NS=371;DP=2615;AC=3;AN=742;AF=0.0040431;RA=2588;AA=14;SR=1183|1405;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.54167;ABR=13;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG
    295. 

  295. 20	76407	.	C	T	0.047	PASS	NS=369;DP=2638;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2620;AA=7;SR=1141|1479;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=3;SNP;TS
    296. 

  296. 20	76477	.	G	T	0.0468	PASS	NS=369;DP=2510;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2495;AA=8;SR=1108|1387;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.83333;ABR=5;ABA=1;RUN=1;SNP;TV
    297. 

  297. 20	76519	.	T	C	55.2	PASS	NS=367;DP=2405;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2395;AA=6;SR=1135|1260;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS
    298. 

  298. 20	76526	.	G	A	97.7	PASS	NS=365;DP=2372;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2355;AA=6;SR=1100|1255;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.625;ABR=10;ABA=6;RUN=1;SNP;TS
    299. 

  299. 20	76559	.	G	A	0.0519	PASS	NS=366;DP=2361;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2351;AA=3;SR=1069|1282;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    300. 

  300. 20	76614	.	T	C	0.355	PASS	NS=364;DP=2186;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2180;AA=2;SR=1061|1119;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    301. 

  301. 20	76631	.	T	A	0.135	PASS	NS=362;DP=2146;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2138;AA=4;SR=1088|1050;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    302. 

  302. 20	76668	.	T	C	0.299	PASS	NS=370;DP=2308;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2288;AA=7;SR=1196|1092;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    303. 

  303. 20	76669	.	T	A	3.27	PASS	NS=370;DP=2325;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2319;AA=3;SR=1215|1104;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    304. 

  304. 20	76689	.	T	C	14.1	PASS	NS=369;DP=2386;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2371;AA=7;SR=1247|1124;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS
    305. 

  305. 20	76796	.	T	C	18.7	PASS	NS=368;DP=2408;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2393;AA=9;SR=1269|1124;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.76667;ABR=23;ABA=7;RUN=1;SNP;TS
    306. 

  306. 20	76801	.	G	A	1.02	PASS	NS=364;DP=2385;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2372;AA=4;SR=1252|1120;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    307. 

  307. 20	76915	.	A	G	99.0	PASS	NS=366;DP=2285;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2256;AA=11;SR=1262|994;SA=8|3;SB=0.72727;AB=0.5;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS
    308. 

  308. 20	76920	.	G	A	65.7	PASS	NS=367;DP=2288;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2276;AA=7;SR=1297|979;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.58824;ABR=10;ABA=7;RUN=2;SNP;TS
    309. 

  309. 20	76934	.	A	G	40.7	PASS	NS=368;DP=2253;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2238;AA=6;SR=1276|962;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS
    310. 

  310. 20	76962	rs6111385	T	C	99.0	PASS	NS=369;DP=2127;AC=599;AN=738;AF=0.81165;RA=436;AA=1670;SR=226|210;SA=898|772;SB=0.53772;AB=0.51024;ABR=299;ABA=281;RUN=2;SNP;TS;CpG
    311. 

  311. 20	77013	rs45528036	C	T	47.1	PASS	NS=370;DP=2371;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2361;AA=5;SR=1049|1312;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.57143;ABR=8;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG
    312. 

  312. 20	77025	.	A	G	99.0	PASS	NS=370;DP=2398;AC=4;AN=740;AF=0.0054054;RA=2351;AA=24;SR=1035|1316;SA=5|19;SB=0.20833;AB=0.57143;ABR=24;ABA=18;RUN=1;SNP;TS;CpG
    313. 

  313. 20	77115	.	A	G	0.997	PASS	NS=371;DP=2355;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2344;AA=4;SR=1291|1053;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    314. 

  314. 20	77225	.	T	C	0.928	PASS	NS=366;DP=2199;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2192;AA=3;SR=986|1206;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    315. 

  315. 20	77264	.	C	T	0.0587	PASS	NS=369;DP=2275;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2261;AA=5;SR=1054|1207;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS
    316. 

  316. 20	77327	.	G	T	24.8	PASS	NS=367;DP=2294;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2282;AA=10;SR=1172|1110;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.6875;ABR=11;ABA=5;RUN=2;SNP;TV
    317. 

  317. 20	77393	.	G	A	32.7	PASS	NS=367;DP=2297;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2277;AA=11;SR=1261|1016;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=3;SNP;TS;CpG
    318. 

  318. 20	77484	.	A	T	0.241	PASS	NS=369;DP=2290;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2283;AA=5;SR=1203|1080;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    319. 

  319. 20	77499	.	G	T	0.058	PASS	NS=369;DP=2269;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2260;AA=4;SR=1216|1044;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    320. 

  320. 20	77655	.	T	C	0.0462	PASS	NS=371;DP=2542;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2533;AA=3;SR=1188|1345;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
    321. 

  321. 20	77816	.	G	A	99.0	PASS	NS=369;DP=2224;AC=16;AN=738;AF=0.02168;RA=2161;AA=45;SR=1004|1157;SA=21|24;SB=0.46667;AB=0.53571;ABR=45;ABA=37;RUN=1;SNP;TS
    322. 

  322. 20	77870	.	A	G	0.0585	PASS	NS=368;DP=2214;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2176;AA=15;SR=836|1340;SA=3|12;SB=0.2;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    323. 

  323. 20	77871	.	C	T	28.8	PASS	NS=368;DP=2215;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2200;AA=11;SR=831|1369;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.75;ABR=9;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG
    324. 

  324. 20	77884	.	T	C	2.39	PASS	NS=369;DP=2325;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2308;AA=4;SR=832|1476;SA=3|1;SB=0.75;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG
    325. 

  325. 20	77890	.	T	C	13.2	PASS	NS=369;DP=2347;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2324;AA=5;SR=842|1482;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    326. 

  326. 20	78254	rs57707252	C	T	99.0	PASS	NS=345;DP=1534;AC=11;AN=690;AF=0.015942;RA=1494;AA=34;SR=751|743;SA=18|16;SB=0.52941;AB=0.58824;ABR=50;ABA=34;RUN=1;SNP;TS
    327. 

  327. 20	78255	.	C	A	0.0735	PASS	NS=347;DP=1551;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1538;AA=6;SR=774|764;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    328. 

  328. 20	78266	.	T	A	0.136	PASS	NS=354;DP=1640;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1632;AA=4;SR=840|792;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    329. 

  329. 20	78455	.	G	A	99.0	PASS	NS=342;DP=1209;AC=3;AN=684;AF=0.004386;RA=1190;AA=12;SR=657|533;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.45;ABR=9;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG
    330. 

  330. 20	78515	.	G	A	15.5	PASS	NS=201;DP=435;AC=1;AN=402;AF=0.0024876;RA=429;AA=2;SR=37|392;SA=0|2;SB=0;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG
    331. 

  331. 20	78691	.	T	G	0.408	PASS	NS=164;DP=352;AC=1;AN=328;AF=0.0030488;RA=346;AA=3;SR=10|336;SA=0|3;SB=0;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV
    332. 

  332. 20	79234	rs6045990	T	C	99.0	PASS	NS=185;DP=299;AC=221;AN=370;AF=0.5973;RA=126;AA=171;SR=83|43;SA=113|58;SB=0.66082;AB=0.57447;ABR=27;ABA=20;RUN=1;SNP;TS
    333. 

  333. 20	79509	.	A	G	6.23	PASS	NS=341;DP=1250;AC=1;AN=682;AF=0.0014663;RA=1242;AA=3;SR=618|624;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS
    334. 

  334. 20	79697	.	A	G	6.18	PASS	NS=129;DP=195;AC=1;AN=258;AF=0.003876;RA=191;AA=2;SR=53|138;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS
    335. 

  335. 20	79749	.	A	T	0.0964	PASS	NS=158;DP=301;AC=2;AN=316;AF=0.0063291;RA=290;AA=3;SR=117|173;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TV
    336. 

  336. 20	79969	.	T	G	6.07	PASS	NS=214;DP=647;AC=1;AN=428;AF=0.0023364;RA=643;AA=2;SR=615|28;SA=2|0;SB=1;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TV
    337. 

  337. 20	80071	rs6046657	G	A	99.0	PASS	NS=299;DP=809;AC=271;AN=598;AF=0.45318;RA=473;AA=335;SR=453|20;SA=325|10;SB=0.97015;AB=0.53559;ABR=158;ABA=137;RUN=1;SNP;TS
    338. 

  338. 20	80079	.	G	A	27.1	PASS	NS=316;DP=898;AC=7;AN=632;AF=0.011076;RA=888;AA=8;SR=851|37;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.73333;ABR=22;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG
    339. 

  339. 20	80095	.	A	G	0.0807	PASS	NS=324;DP=1080;AC=3;AN=648;AF=0.0046296;RA=1063;AA=7;SR=935|128;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=2…
    340.

Large files files are truncated, but you can click here to view the full file