PageRenderTime 15ms CodeModel.GetById 10ms app.highlight 1ms RepoModel.GetById 1ms app.codeStats 1ms

/test-data/s2fq_paired_R3.csfasta

https://bitbucket.org/cistrome/cistrome-harvard/
Unknown | 99 lines | 99 code | 0 blank | 0 comment | 0 complexity | dbb9f41c4bd368e26a49a69e831838de MD5 | raw file
 1# Mon Jan 19 06:35:55 2009 /share/apps/corona/bin/filter_fasta.pl --output=/data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/results.01/primary.20090119120505312 --name=0176_20090114_1_skmusc_cov_25_ --tag=R3 --minlength=25 --mask=1111111111111111111111111 --prefix=G /data/results/0176/0176_20090114_1/skmusc_cov_25/jobs/postPrimerSetPrimary.1512/rawseq 
 2# Cwd: /home/pipeline
 3# Title: 0176_20090114_1_skmusc_cov_25_
 4>1378_11_329_R3
 5G2233123221122322232333222
 6>1378_17_1788_R3
 7G3322232203232332312331032
 8>1378_25_2035_R3
 9G2232123122220222321323122
10>1378_28_770_R3
11G2223322202332212121232233
12>1378_33_1945_R3
13G2222222222222222222222222
14>1378_34_789_R3
15G3222133212330232020223323
16>1378_35_263_R3
17G2221222222222222222222222
18>1378_43_186_R3
19G3213022233322233321223222
20>1378_51_1671_R3
21G2223233233122032302123222
22>1378_56_324_R3
23G3213222320313002200323003
24>1378_56_773_R3
25G1313223122333122220232200
26>1378_62_2027_R3
27G2233221132211321123213212
28>1378_62_2029_R3
29G2221223232322321221323212
30>1378_67_1795_R3
31G1123211001201123113012202
32>1378_68_466_R3
33G1232310313202230002103323
34>1378_68_1692_R3
35G3323312033302231332113121
36>1378_80_664_R3
37G2323132123323031313223230
38>1378_85_1786_R3
39G3111302202123030112201202
40>1378_86_1011_R3
41G1022120322203033033330133
42>1378_86_1789_R3
43G1221102230130030003310010
44>1378_91_1596_R3
45G2213333310331223211333220
46>1378_94_1595_R3
47G3212223300111023011313221
48>1378_95_1039_R3
49G3233132321102232022301220
50>1378_95_1767_R3
51G2130033201122210021303300
52>1378_96_1037_R3
53G0132132221103332013301310
54>1378_96_1764_R3
55G3313332300111013302303331
56>1378_98_1574_R3
57G2022120232322222332333202
58>1378_107_1647_R3
59G3223132233130323322312013
60>1378_111_829_R3
61G2223133130322321300033023
62>1378_111_1900_R3
63G2210121133322213002112300
64>1378_112_1483_R3
65G3322023223232333213202110
66>1378_125_1287_R3
67G3320123222332311123202033
68>1378_126_468_R3
69G1000000122211222122013022
70>1378_127_664_R3
71G3312133321130323332331220
72>1378_129_463_R3
73G0000000000000000000000000
74>1378_129_875_R3
75G3201133301230332222233221
76>1378_140_1251_R3
77G3333113312323212321220232
78>1378_141_809_R3
79G3313123223331333333032323
80>1378_144_983_R3
81G2233123312322323012022232
82>1378_153_270_R3
83G2221123232122232302033220
84>1378_155_1689_R3
85G1121233122010002130210113
86>1378_157_1580_R3
87G3222033200222032303213022
88>1378_161_317_R3
89G2003110301110100002102211
90>1378_177_735_R3
91G2120211130001103202031220
92>1378_181_1684_R3
93G3333132332322333323322223
94>1378_187_1407_R3
95G3332223200031332312023220
96>1378_203_721_R3
97G1113330120310300011032011
98>1378_206_2039_R3
99G1111111111111111111111111