/test-data/1.vcf
Unknown | 4497 lines | 4497 code | 0 blank | 0 comment | 0 complexity | 3376fb6a4047501810f1ea4531da476b MD5 | raw file
- ##fileformat=VCFv4.0
- #CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT chr10 chr11
- chr10 66922 . T A 15.1 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=60 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 131337 . A G 56.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 89,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 170654 . CTCT CTCTCTTTCT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 209855 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 217843 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 255907 . T G 19.1 . DP=45;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=18,6,0,9;MQ=49;PV4=0.00013,0.00033,0.033,0.2 PL:DP:SP:GT:GQ 49,0,255:33:39:0/1:52
- chr10 282021 . AC ACCTGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 282897 . C T 60 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 93,33,0:11:0:1/1:99
- chr10 292927 . C A 5.29 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 35,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 294953 . A G 11.3 . DP=20;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=50;PV4=1,0.13,0.27,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,27:6:0:0/1:30
- chr10 297512 . T TCTATAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 299253 . T C 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 300784 . G GTGTCTCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 302656 . C T 14.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 46,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 316660 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 323283 . A G 99 . DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,7,4,9;MQ=49;PV4=0.44,1.1e-05,0.0014,1 PL:DP:SP:GT:GQ 154,0,255:27:4:0/1:99
- chr10 329097 . C CTG 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 329425 . T C 34 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=48;PV4=1,0.38,0.18,0.012 PL:DP:SP:GT:GQ 64,0,54:9:0:0/1:57
- chr10 330706 . A T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 333917 . A C 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 41,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 364501 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 370384 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 373048 . T C 68 . DP=51;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=15,12,11,4;MQ=49;PV4=0.33,1.6e-13,0.054,1 PL:DP:SP:GT:GQ 98,0,255:42:5:0/1:99
- chr10 387060 . G A 34.1 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 67,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 388388 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 394714 . G A 20.1 . DP=23;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,2,1;MQ=47;PV4=0.4,1,0.043,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,0,28:5:4:0/1:31
- chr10 395266 . T C 6.79 . DP=15;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 395463 . G A 38 . DP=32;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,27;MQ=50;PV4=1,0.00028,0.37,1 PL:DP:SP:GT:GQ 71,53,0:28:0:1/1:99
- chr10 415897 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 427441 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 429977 . G A 20 . DP=24;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,4,7,2;MQ=50;PV4=1,1.1e-14,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,0,255:23:0:0/1:53
- chr10 430502 . C G 14.2 . DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,12,8,0;MQ=49;PV4=0.0013,0.00012,0.012,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,255:24:29:0/1:47
- chr10 436010 . A G 3.01 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,44:2:0:0/1:33
- chr10 443775 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 444997 . C T 7.77 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 445061 . C T 99 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,7;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 255,87,0:29:0:1/1:99
- chr10 459773 . A G 3.01 . DP=6;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=49;PV4=1,0.14,0.0034,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,83:5:0:0/1:33
- chr10 459940 . G A 36.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 69,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 468854 . TGGAG TCACTCAGAGAGGAG 12.7 . INDEL;DP=7;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 518547 . ACTCT ACT 99 . INDEL;DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 249,45,0:15:0:1/1:99
- chr10 533406 . A AGAGCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 537741 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 555578 . GAG GAGAAG 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 569693 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 602486 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 610506 . C A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 617928 . C G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 667505 . A T 4.77 . DP=2;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,36:2:0:0/1:34
- chr10 668181 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 706998 . G A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 731058 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 739952 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 752193 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 752862 . cc cCAc 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 758105 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 758483 . T TGTCTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 835606 . C T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 922988 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 941722 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 945698 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1042023 . a aAAC 52.2 . INDEL;DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 91,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 1043221 . T A 6.2 . DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,1,1;MQ=49;PV4=1,1,0.056,0.31 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,50:5:0:0/1:38
- chr10 1052950 . G A 83 . DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,10,0;MQ=48;PV4=1,8.3e-05,7.4e-07,1 PL:DP:SP:GT:GQ 113,0,228:26:0:0/1:99
- chr10 1056310 . G C 79 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=47;PV4=1,0.039,0.00012,0.43 PL:DP:SP:GT:GQ 109,0,126:9:0:0/1:99
- chr10 1061862 . A G 37 . DP=60;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,21,5,3;MQ=49;PV4=0.0056,3.9e-07,3e-06,1 PL:DP:SP:GT:GQ 67,0,255:31:22:0/1:70
- chr10 1070461 . C T 16.1 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=48;PV4=1,0.036,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 46,0,38:4:0:0/1:40
- chr10 1070710 . C G 99 . DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,13,1,18;MQ=48;PV4=1,4e-05,0.0011,1 PL:DP:SP:GT:GQ 147,0,215:33:0:0/1:99
- chr10 1076659 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1089274 . G C 3.07 . DP=4;AF1=0.5126;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,0.41,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,13:3:0:0/1:16
- chr10 1090111 . A G 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1110855 . a aCTAAGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1115494 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1128904 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1142208 . T C 64 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,1,0,33;MQ=49;PV4=0.057,0.013,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 97,46,0:35:0:1/1:99
- chr10 1150928 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1160913 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1167722 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1170304 . C G 99 . DP=40;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,14,4,11;MQ=48;PV4=0.68,3.3e-09,0.00038,0.49 PL:DP:SP:GT:GQ 171,0,255:32:2:0/1:99
- chr10 1195036 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1204080 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1204947 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1230744 . G A 3.57 . DP=5;AF1=0.5048;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=49;PV4=1,0.24,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,17:3:0:0/1:20
- chr10 1230968 . C T 8.64 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,0,3;MQ=49;PV4=0.1,0.00042,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,77:5:10:0/1:41
- chr10 1254961 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1263553 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1283529 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1310456 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1350849 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1352573 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1352644 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1353236 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1373459 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1421219 . A C 12.3 . DP=12;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.2,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,25:5:0:0/1:28
- chr10 1433275 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1489768 . G A 9.31 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 1489779 . A C,T 4.61 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 42,14,33,8,0,33:3:0:1/1:49
- chr10 1490725 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1497258 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1518317 . G GACGTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1523964 . a aCCT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1527079 . A C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1548264 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1558548 . TC TCGAC 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1605240 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1611361 . T G 3.55 . DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1623213 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1645868 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1651015 . G GTTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1695429 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1703265 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1711741 . C CCCTATTTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1721206 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1731544 . a aTATTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1737777 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1749500 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1761488 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1817221 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1852754 . G T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1852973 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1864370 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1898737 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1898746 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1914304 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1915241 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1924253 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1933036 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 1984951 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2017468 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2022889 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2036480 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2051564 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2053274 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2076529 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2095607 . AGGTG A 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2113136 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2114416 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2136360 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2197980 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2232715 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2241737 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2247878 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2337671 . A ACAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2355472 . g gCTACAGC 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2356045 . C CCTTAAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2372111 . gg gGCGTATg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2395355 . T G 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2407844 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2498965 . C CCTCTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2508018 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2520704 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2556292 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2588027 . T A 3.02 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2596929 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2624329 . G C 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2663483 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2663892 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2706224 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2714085 . G C 4.77 . DP=2;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,44:2:0:0/1:36
- chr10 2729351 . CTT CTTTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2734777 . A C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2742346 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2748997 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2751235 . a aTGACG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2756672 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2796523 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2842254 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2879429 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2899820 . A G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2919978 . T C 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2923945 . A T,G 3.41 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 36,10,31,4,0,31:3:0:1/1:49
- chr10 2929732 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2950233 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2952487 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2952601 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2955146 . a aGACGGAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2957192 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2963110 . G GACTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2964207 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 2985557 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3023958 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3054036 . T C 52.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 85,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 3056560 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3063846 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3068551 . T G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3075387 . AG AGAGG 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3080755 . c cTGAGT 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3101616 . A T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3112082 . T TCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3119862 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3120010 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3124516 . G A 5.29 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 35,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 3143643 . A C 11.3 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 3145906 . A C 60 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,6,0;MQ=47;PV4=1,0.0016,0.0043,1 PL:DP:SP:GT:GQ 90,0,174:13:0:0/1:93
- chr10 3146180 . C T 18 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 50,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 3149402 . A G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 165,33,0:11:0:1/1:99
- chr10 3150973 . C T 33.2 . DP=42;AF1=0.5263;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,3;MQ=49;PV4=1,0.29,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 63,0,10:5:0:0/1:13
- chr10 3155237 . A G 91 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 124,30,0:10:0:1/1:99
- chr10 3155540 . A G 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 132,30,0:10:0:1/1:99
- chr10 3155753 . G C 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,4;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 133,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 3158848 . C T 25.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 57,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 3159234 . G A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3161131 . C T 11.3 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 3168373 . G C 8.65 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3171995 . G T 3.01 . DP=8;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=50;PV4=1,0.00025,0.14,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,135:7:0:0/1:33
- chr10 3172229 . G A 24 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,4;MQ=48;PV4=1,0.0029,0.013,1 PL:DP:SP:GT:GQ 54,0,142:9:0:0/1:57
- chr10 3178815 . G C 39 . DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,11,0,5;MQ=49;PV4=1,8.8e-05,3.1e-07,1 PL:DP:SP:GT:GQ 69,0,255:17:0:0/1:72
- chr10 3191727 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3206365 . T C 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3212187 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3229964 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3238997 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3256461 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3266803 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3281251 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3302979 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3325037 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3364820 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3367318 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3370814 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3389660 . G GTCTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3390765 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3424524 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3434101 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3450171 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3451517 . G GGT 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3465444 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3473819 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3474112 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3486595 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3492888 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3499283 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3521236 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3526792 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3539155 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3584507 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3586349 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3590536 . AAGAGAGAG AAGAGAG 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3606942 . CT CATAAGT 3.81 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3643414 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3660946 . T A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3694363 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3694597 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3698288 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3711002 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3715278 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 3716521 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3720097 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3720385 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3743697 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3747686 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3753120 . tgga t 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3756309 . TAAG T 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3800996 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3812387 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3835047 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3851381 . T A 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3853849 . GTGT G 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3872341 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3873419 . A T 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3894179 . A C 3.54 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,42:2:0:0/1:34
- chr10 3907121 . GT GTT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3909411 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3911829 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3913900 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3931867 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3935971 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3938767 . C G 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3956629 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 3987365 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 3992909 . C G 12.3 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4014922 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4017381 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4031135 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4031735 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4034594 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4049052 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4049847 . C T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4053810 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4057160 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4069192 . T TGTGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4083656 . ct cTGCTTGAt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4129954 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4135785 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4171409 . cg cGTGATATCTGTg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4174241 . G GTTGTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4185639 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4233710 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4251583 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4276813 . g gTTTTCTCTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4294415 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4332523 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4360945 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4395806 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4395821 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4420491 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4453877 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4481483 . A G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4483673 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4495977 . T G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4561636 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4574896 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4577724 . T TCTCAACAAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4578308 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4581124 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4581619 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4613801 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4692001 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4711974 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4725899 . g gTGCAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4733335 . cG cGTAG 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4753253 . G A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4788010 . CGG CGGG 13.4 . INDEL;DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 52,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 4788081 . A ACTCCT 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 4811809 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4869585 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4885208 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4892308 . GC GCAAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4927603 . G C 7.8 . DP=9;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=48;PV4=1,0,0,0.44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,28:3:0:0/1:30
- chr10 4929976 . GT GTCT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 4958031 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5010913 . C T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5011048 . A C 4.77 . DP=6;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.016,0.22,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,40:4:0:0/1:35
- chr10 5014678 . G T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5016241 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5018287 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5019959 . G A 9.52 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=48;PV4=1,0.087,0.23,0.12 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,108:5:0:0/1:42
- chr10 5026052 . A G 26 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 58,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 5037772 . C A 39 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=45;PV4=1,1,0.055,0.41 PL:DP:SP:GT:GQ 69,0,64:6:0:0/1:66
- chr10 5038853 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5041028 . C A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5042852 . T A 13.2 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,2,0;MQ=47;PV4=0.067,0.086,0.0013,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,123:6:12:0/1:46
- chr10 5045884 . G GTAGACTT 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 5050761 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5050793 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5079812 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5092192 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5101028 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5112354 . A G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5123006 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5139685 . G A 50.1 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 83,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 5165443 . CT CTT 37.5 . INDEL;DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.26 PL:DP:SP:GT:GQ 75,0,110:9:0:0/1:78
- chr10 5165525 . G A 20.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 52,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 5165809 . tcac t 6.55 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,44:2:0:0/1:43
- chr10 5175847 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5177350 . G A 35.5 . DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 68,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 5190458 . ga gAa 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5200756 . C T 6.98 . DP=2;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,30:2:0:0/1:32
- chr10 5202060 . C T 20 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 52,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 5242346 . G A 97.1 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 130,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 5249377 . A T 21.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 53,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 5249770 . G A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5249973 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5260611 . TTCACT TT 33.5 . INDEL;DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,2,0;MQ=50;PV4=1,0.00027,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 71,0,160:7:0:0/1:74
- chr10 5260812 . A G 16.1 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 48,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 5260813 . GCC GCCCC 12.7 . INDEL;DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5283318 . aaataa aaa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5283974 . A C 7.8 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5319029 . A AGT 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 5320897 . C T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5349776 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5364097 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5366794 . G GTGAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5384423 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5385285 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5394537 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5402285 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5409210 . G C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5416124 . G T 11.3 . DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,5,1,3;MQ=49;PV4=1,0.13,0.009,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,152:12:0:0/1:44
- chr10 5416130 . C A 13.2 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,2,0,4;MQ=48;PV4=0.43,0.064,0.036,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,80:8:4:0/1:46
- chr10 5435918 . G A 18.1 . DP=53;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,10,9,2;MQ=50;PV4=0.25,3.8e-08,0.00094,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,255:34:6:0/1:51
- chr10 5436273 . C T 21 . DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=17,6,0,9;MQ=49;PV4=0.00018,2e-07,0.00093,1 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,255:32:37:0/1:54
- chr10 5436462 . T C 6.2 . DP=11;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=47;PV4=1,1,0.3,0.011 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,45:5:0:0/1:38
- chr10 5437365 . A G 16.1 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,8,1,4;MQ=49;PV4=0.6,0.00011,0.047,1 PL:DP:SP:GT:GQ 46,0,255:20:2:0/1:49
- chr10 5455799 . tgga t 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5459010 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5468709 . T C 14.2 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,4,0,4;MQ=50;PV4=1,0.056,0.013,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,128:9:0:0/1:47
- chr10 5471122 . T C 5.54 . DP=12;AF1=0.5128;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=47;PV4=1,1,0.33,0.077 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,13:3:0:0/1:16
- chr10 5471200 . C T 15.1 . DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 5471251 . T G 3.03 . DP=17;AF1=0.5029;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,0.077,0.33,0.071 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,19:3:0:0/1:22
- chr10 5473242 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5479131 . A ATTTGCCCGAGAACGGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5481451 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5499040 . AT ATT 99 . INDEL;DP=18;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,14;MQ=50;PV4=1,1,1,0.39 PL:DP:SP:GT:GQ 172,0,33:17:0:0/1:36
- chr10 5500026 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5504879 . c cCAG 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 5505591 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5542320 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5567366 . G A 92 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,4;MQ=47;PV4=0.44,0.00014,0.00085,1 PL:DP:SP:GT:GQ 122,0,61:9:4:0/1:64
- chr10 5571516 . C T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5577742 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5578608 . ac aCCGTTTc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5585992 . tac tACAGac 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5602993 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5607598 . T G 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5617452 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5637224 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5640419 . G T 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5640435 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5652173 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5652185 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5652880 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5667066 . C A 19.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 51,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 5682641 . C T 18.6 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 51,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 5683860 . A ANNNNNC 3.25 . INDEL;DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,88:4:0:0/1:41
- chr10 5688395 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5689917 . A T 6.98 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5690879 . G A 28 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,1,3;MQ=42;PV4=0.033,0.046,0.0014,0.43 PL:DP:SP:GT:GQ 58,0,149:10:15:0/1:61
- chr10 5693379 . A G 20.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 52,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 5720721 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5751578 . CTA CTAGTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5781628 . T G 29.5 . DP=28;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,3;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 62,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 5781969 . A T 99 . DP=51;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,23,22;MQ=48;PV4=1,0.3,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 254,113,0:46:0:1/1:99
- chr10 5788126 . ACT ACTCAGTGCTCT 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 5788608 . G C 70.5 . DP=32;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,8,0;MQ=48;PV4=1,1,0.17,1 PL:DP:SP:GT:GQ 103,12,0:9:0:1/1:72
- chr10 5789325 . T G 21 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,2,0,4;MQ=47;PV4=0.17,0.16,0.093,1 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,107:9:8:0/1:54
- chr10 5789966 . CCTGCCTCAGCTGCC CCTGCC 99 . INDEL;DP=49;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,18,6,7;MQ=50;PV4=0.48,0.0023,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,0,255:39:3:0/1:99
- chr10 5790420 . T C 99 . DP=51;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,17,25;MQ=49;PV4=0.42,0.046,0.29,1 PL:DP:SP:GT:GQ 237,97,0:43:0:1/1:99
- chr10 5790616 . A G 99 . DP=46;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,18,4,15;MQ=49;PV4=1,5e-14,0.00042,0.44 PL:DP:SP:GT:GQ 169,0,255:41:0:0/1:99
- chr10 5793899 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5793938 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5798782 . T A 7.59 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 5800811 . A C 25 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=48;PV4=1,0.038,0.17,1 PL:DP:SP:GT:GQ 55,0,59:6:0:0/1:57
- chr10 5803530 . AA AAGA 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5804531 . G A 29.1 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 62,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 5804633 . TTC TTCTC 99 . INDEL;DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=50;PV4=1,1,0.2,1 PL:DP:SP:GT:GQ 145,0,108:9:0:0/1:99
- chr10 5823705 . tg tGCGAGGAg 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5828019 . T C 3.54 . DP=10;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,0,2;MQ=49;PV4=0.4,1,0.026,0.25 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,50:5:4:0/1:34
- chr10 5828942 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5836286 . C T 12 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 5872773 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5874958 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5902105 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5917372 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5925820 . gg gGCTg 3.25 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,0,1;MQ=50;PV4=0.25,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,102:4:0:0/1:41
- chr10 5925971 . C A 41.5 . DP=45;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,1,8,0;MQ=49;PV4=0.11,0.077,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 70,0,1:9:0:1/1:5
- chr10 5929962 . G C 18.1 . DP=53;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,5,4,3;MQ=50;PV4=0.62,0.0016,0.073,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,191:15:2:0/1:51
- chr10 5938195 . TC TCGC 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5948657 . C T 63 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,10;MQ=49;PV4=1,4.9e-09,0.0028,1 PL:DP:SP:GT:GQ 93,0,199:19:0:0/1:96
- chr10 5953148 . A G 5.46 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=49;PV4=1,0.43,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,35:4:0:0/1:34
- chr10 5953588 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5967256 . A C 22 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,1,5,0;MQ=48;PV4=1,0.0077,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 52,0,119:10:0:0/1:55
- chr10 5971969 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5978411 . T C 3.54 . DP=34;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,0,3;MQ=50;PV4=0.4,0.05,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,37:5:0:0/1:33
- chr10 5982573 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 5989110 . C CTTA 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6013625 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6056837 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6060054 . G T 10.4 . DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,19,6,0;MQ=49;PV4=3e-05,9.3e-05,0.00041,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,255:26:45:0/1:43
- chr10 6062018 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6063674 . T C 99 . DP=35;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 183,87,0:29:0:1/1:99
- chr10 6091069 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6091333 . A G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6101041 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6111851 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6113666 . G A 8.64 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=48;PV4=1,0.26,0.0099,0.36 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,57:4:0:0/1:41
- chr10 6114328 . A T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6115635 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6124519 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6148059 . A G 10.5 . DP=11;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,12:3:0:0/1:15
- chr10 6154392 . T A,G 5.29 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 48,19,34,13,0,34:3:0:1/1:49
- chr10 6156118 . T C 92 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 125,39,0:13:0:1/1:99
- chr10 6156166 . A ACGGCCGGACC 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 6189871 . G T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6204234 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6211667 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6212611 . CAAAA CAA 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6258015 . T C 73 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,18,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 106,54,0:18:0:1/1:99
- chr10 6258052 . G A 97 . DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,18,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 130,54,0:18:0:1/1:99
- chr10 6258796 . T C 9.31 . DP=15;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 6258840 . GCCC GCC 78.7 . INDEL;DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,4;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 119,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 6259239 . G A 7.83 . DP=21;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=47;PV4=1,0.42,1,0.17 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,17:3:0:0/1:20
- chr10 6261704 . T C 14.2 . DP=30;AF1=0.5063;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,2;MQ=49;PV4=1,0.13,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,16:4:0:0/1:19
- chr10 6263171 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6267717 . C CAG 38.2 . INDEL;DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 77,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 6274422 . G GCAGACCC 7.38 . INDEL;DP=2;AF1=0.504;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,18:2:0:0/1:21
- chr10 6276570 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6313715 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6335597 . C T 3.54 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=48;PV4=1,0.023,0.2,0.12 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,106:5:0:0/1:34
- chr10 6335700 . G A 99 . DP=14;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,7,6;MQ=46;PV4=1,0.27,0.15,1 PL:DP:SP:GT:GQ 204,10,0:14:0:1/1:60
- chr10 6342380 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6366381 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6373367 . cg cGGGg 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6393908 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6459135 . G T 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6467722 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6472685 . T A 3.02 . DP=3;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,26:2:0:0/1:28
- chr10 6480173 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6480254 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6506384 . AA AACA 3.25 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,0.33,1,0.46 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,80:3:0:0/1:41
- chr10 6508703 . C G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6509248 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6521147 . G A 65 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 98,27,0:9:0:1/1:99
- chr10 6528054 . A G 4.77 . DP=15;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,3,1;MQ=48;PV4=0.14,0.0014,0.18,0.032 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,118:8:8:0/1:36
- chr10 6528069 . C A 14.2 . DP=8;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=46;PV4=1,0.065,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,28:4:0:0/1:31
- chr10 6533877 . A G 69 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 102,51,0:17:0:1/1:99
- chr10 6539240 . T A 21 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,5,1,4;MQ=48;PV4=1,1,0.07,0.23 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,77:11:0:0/1:54
- chr10 6593396 . ccc cCCCCGAcc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6614727 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6624197 . ATTG A 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6628630 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6646946 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6667778 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6682640 . T A 3.02 . DP=2;AF1=0.501;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,23:2:0:0/1:25
- chr10 6690643 . cta cTAACAta 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6691586 . A C,G 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,15,30,12,0,30:2:0:1/1:41
- chr10 6703009 . T A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6725954 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6730785 . TG TGGGAGGGGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6740930 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6754861 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6792845 . G T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6806667 . g gTTCCCC 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6888002 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6954245 . GT GTCAGTGGAGTCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6975121 . T TCTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6975390 . C A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 6993120 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7007341 . cca cCATACTca 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7015143 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7018447 . ac aCAGGc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7031669 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7046145 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7061643 . G C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7070475 . T A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7075395 . TA TAGAAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7085152 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7105859 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7123620 . A C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7125307 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7157289 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7173098 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7174159 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7196088 . ATCT ATCTCT 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,42:2:0:0/1:43
- chr10 7205605 . TTCT TTCTCTCTCT 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7206067 . A C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7214659 . TACACACACACA TACACACACA 44.5 . INDEL;DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,8,0,3;MQ=50;PV4=1,0.13,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 82,0,193:11:0:0/1:85
- chr10 7223321 . ag aGAAGTTGTGCTg 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7236802 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7239386 . C T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7285632 . A G 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,2,9;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 255,33,0:11:0:1/1:99
- chr10 7289044 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7313439 . tta tTAACta 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7318803 . T C 99 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,8,0;MQ=45;PV4=1,1,0.017,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 160,5,0:9:0:1/1:46
- chr10 7326305 . GT GTTTAT 7.42 . INDEL;DP=2;AF1=0.5101;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,14:2:0:0/1:17
- chr10 7361824 . cag cAGTGag 12.7 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7371582 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7375689 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7376814 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7408103 . GG GGGAAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7415769 . A AGTTAGAGGTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7417928 . CT CTTTCACGAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7423960 . T C 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 41,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 7431307 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7462134 . A G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7462539 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7503975 . C T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7527102 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7550321 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7567698 . a aGGGCG 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7596277 . CACG C 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7605077 . TCC TC 99 . INDEL;DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,6;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 255,51,0:17:0:1/1:99
- chr10 7605101 . A G 77.1 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,5,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 110,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 7608419 . T C 11.3 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,3;MQ=47;PV4=1,0.0074,0.028,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,164:9:0:0/1:44
- chr10 7618686 . T G 26.5 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 59,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 7627750 . CT CTAT 5.09 . INDEL;DP=3;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.042 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,20:3:0:0/1:23
- chr10 7638157 . A C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7641672 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7659790 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7677798 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7683289 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7692140 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7702304 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7763661 . A G 99 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,8;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 161,48,0:16:0:1/1:99
- chr10 7766565 . CG CGCGTGTCCCGCGCACGTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7770494 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7773976 . A G 99 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,21;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 255,66,0:22:0:1/1:99
- chr10 7785245 . T G 8.64 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,3;MQ=48;PV4=1,0.26,0.00019,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,117:10:0:0/1:41
- chr10 7786065 . CT CTCTTT 5.08 . INDEL;DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,1,0;MQ=49;PV4=1,1,1,0.17 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,61:3:0:0/1:44
- chr10 7788495 . T C 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 181,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 7801960 . T C 3.01 . DP=4;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,1;MQ=47;PV4=1,0.027,0.036,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,112:4:0:0/1:33
- chr10 7805774 . A ATCCAGGTTCTT 7.35 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 7805778 . TG TGTTCTTCTCG 5.08 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,0.48,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,68:3:0:0/1:44
- chr10 7809300 . AC ACGC 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7822169 . C A 9.52 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,4,0,4;MQ=49;PV4=0.21,0.027,0.0074,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,199:12:7:0/1:42
- chr10 7851888 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7852709 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7866268 . C G 99 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,2;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 252,75,0:25:0:1/1:99
- chr10 7866557 . T C 99 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 133,54,0:18:0:1/1:99
- chr10 7872431 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7875874 . G A 10.4 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,3,1,1;MQ=48;PV4=1,0.01,0.24,0.3 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,155:6:0:0/1:43
- chr10 7887601 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7891228 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7899325 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7923728 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7925890 . A T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7937957 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 7978533 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8006644 . A G 36 . DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,0,9;MQ=48;PV4=2e-06,3.5e-17,6.7e-07,1 PL:DP:SP:GT:GQ 66,0,230:22:57:0/1:69
- chr10 8006798 . A G 99 . DP=56;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=1,1,6,6;MQ=48;PV4=1,0.4,0.15,1 PL:DP:SP:GT:GQ 136,0,3:14:0:0/1:5
- chr10 8006885 . A G 11.3 . DP=32;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,5,0,6;MQ=49;PV4=0.0046,0.00081,0.015,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,255:23:23:0/1:44
- chr10 8044177 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8055615 . G C 40 . DP=3;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,0,0.41 PL:DP:SP:GT:GQ 70,0,30:3:0:0/1:33
- chr10 8077137 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8086696 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8093034 . G T 99 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,13,2;MQ=47;PV4=0.19,1,0.098,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 197,29,0:16:0:1/1:99
- chr10 8093185 . T C 99 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,7;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 146,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 8096732 . A T 3.02 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8108088 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8111409 . C T 15.9 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 47,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 8111621 . C T 19.1 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,2,0,4;MQ=49;PV4=0.43,0.12,0.13,1 PL:DP:SP:GT:GQ 49,0,84:7:0:0/1:52
- chr10 8114348 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8115497 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8115662 . A C 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 42,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 8155216 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8155269 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8172326 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8190833 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8201355 . A ACAGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8203309 . C A 5.46 . DP=7;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,1,2;MQ=49;PV4=0.14,0.002,0.067,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,127:7:8:0/1:37
- chr10 8211583 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8215968 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8234520 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8284765 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8284926 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8289417 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8309912 . t tCTGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8337290 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8345579 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8352236 . T A 4.77 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8367461 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8387158 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8393506 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8399328 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8448137 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8492037 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8541239 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8561586 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8572310 . ac aCCTc 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8585691 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8590004 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8595541 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8638759 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8658193 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8663011 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8664762 . G GAATACAA 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8677236 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8681979 . G C 7.09 . DP=2;AF1=0.5162;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,12:2:0:0/1:15
- chr10 8711664 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8739470 . G A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8739638 . G GAAC 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8759770 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8831961 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8836544 . CTC CTCTTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8857858 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8869670 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8885928 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8887331 . C A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8890480 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8892410 . AA AAAGTTTGCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8899512 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8957381 . T TAGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 8998393 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9003658 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9038727 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9060327 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9066319 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9090506 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9101007 . t tTTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9122324 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9124380 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9140496 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9178131 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9219755 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9226420 . ccgac cc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9230681 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9233338 . tg tGAGg 9.05 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 46,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9246071 . T TGGAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9264004 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9282465 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9308551 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9320741 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9329469 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9375811 . T TTG 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9381802 . AC ACCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9421092 . G GGA 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9431374 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9436847 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9445672 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9455377 . t tGTGTAACGGG 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9483577 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9541069 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9573300 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9577845 . ct cTCTt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9583624 . A C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9609998 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9674671 . g gCATTGA 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9707901 . tg tGCCGGTACGGg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9718567 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9765758 . A G 15.9 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 47,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 9776952 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9813131 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9823086 . tgg tGGCAgg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9854472 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9869585 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9876725 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9877633 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9931942 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9943942 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9982267 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 9984782 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10041367 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10076976 . ag aGTg 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10078799 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10087614 . T TGC 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10102236 . A T 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10105108 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10166311 . gcc gCCTCcc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10177963 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10192456 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10216139 . A C 7.8 . DP=2;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,32:2:0:0/1:34
- chr10 10236738 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10240336 . CAT CATGAT 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10287622 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10297026 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10326836 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10336308 . t tTC 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10366936 . attt a 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10386137 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10390135 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10394734 . C T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10413316 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10453431 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10500059 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10520185 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10563972 . A T 7.8 . DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,42:2:0:0/1:39
- chr10 10577142 . T A 7.8 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10579058 . ca cATTACTa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10595794 . t tCTAAGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10647722 . A G 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10661897 . A ATT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10718402 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10723449 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10728832 . C G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10761365 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10768080 . A G 28.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 60,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 10770717 . G A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10809234 . C T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10862463 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10894842 . A AGTC 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10908099 . G C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10909998 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10924603 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10924605 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 10963614 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11000097 . G C 3.05 . DP=2;AF1=0.5078;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,15:2:0:0/1:18
- chr10 11019815 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11038036 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11038048 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11047201 . G A 16.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 48,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 11068174 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11080269 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11084300 . GGA GGAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11150961 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11151506 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11155449 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11165556 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11165566 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11205256 . A AGCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11207285 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11208549 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11223563 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11258710 . G GCATGTATTCTC 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11266822 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11277624 . C T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11299654 . A C 7.59 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 11299735 . A T 26.3 . DP=50;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=0,1,6,0;MQ=49;PV4=0.14,0.089,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 56,0,9:7:0:0/1:12
- chr10 11300468 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11317245 . GT GTT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11330576 . C T 11.3 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 11356093 . TTTT TTTTGTTT 99 . INDEL;DP=42;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=1,2,11,15;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,15,15:29:0:1/1:10
- chr10 11356094 . TTT TTTGTT 99 . INDEL;DP=43;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,2,5,0;MQ=50;PV4=0.11,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 149,0,70:8:10:0/1:73
- chr10 11356095 . TT TTGT 25.5 . INDEL;DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,3,3,0;MQ=50;PV4=0.14,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 63,0,88:7:8:0/1:66
- chr10 11356097 . T TGGGG 25.5 . INDEL;DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,5,2,0;MQ=50;PV4=0.44,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 63,0,211:10:4:0/1:66
- chr10 11356712 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11361413 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11364839 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11368490 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11386437 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11394181 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11401659 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11402817 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11415052 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11419772 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11435630 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11504428 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11567686 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11621538 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11635951 . C G 3.01 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=45;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,37:2:0:0/1:32
- chr10 11658605 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11684393 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11706156 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11706183 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11711594 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11712722 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11723537 . A T 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 39,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 11733812 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11744873 . A ACTTCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11758942 . C A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11762095 . T A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11763302 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11783818 . ACCCCC ACCCCCCC 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11789250 . G A 71.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 104,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 11789382 . G A 99 . DP=57;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,30,20;MQ=49;PV4=0.41,0.21,0.29,1 PL:DP:SP:GT:GQ 251,127,0:51:0:1/1:99
- chr10 11789405 . G A 48 . DP=56;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,3,5;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 81,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 11789511 . C G 99 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,4,31;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 205,105,0:35:0:1/1:99
- chr10 11789553 . T C 6.98 . DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=49;PV4=1,0.089,1,0.49 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,72:7:0:0/1:39
- chr10 11797434 . GTT GT 27.5 . INDEL;DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,1,2;MQ=50;PV4=1,0.0086,1,0.022 PL:DP:SP:GT:GQ 65,0,82:6:0:0/1:68
- chr10 11797436 . T C 55.1 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 88,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 11797467 . G A 99 . DP=25;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,2,2,15;MQ=47;PV4=1,0.16,0.1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 153,0,2:19:0:0/1:3
- chr10 11805339 . C T 10.4 . DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,8,4,1;MQ=47;PV4=0.34,1.2e-08,0.025,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,255:21:5:0/1:43
- chr10 11805354 . A G 99 . DP=30;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,7,3;MQ=45;PV4=1,1,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 139,11,0:11:0:1/1:66
- chr10 11805357 . G A 84 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 117,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 11815591 . T A 8.65 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11835702 . t tCA 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11840006 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11854795 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11877945 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11884553 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11904683 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11915971 . A C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11928533 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11939877 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11942981 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11944672 . T TCG 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 11978499 . T G 49 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 82,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 11985670 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12009399 . T G 6.98 . DP=18;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,11,5,0;MQ=49;PV4=0.00097,4.5e-05,0.0016,0.25 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,239:17:30:0/1:39
- chr10 12011949 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12039782 . T TGGC 3.25 . INDEL;DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,77:4:0:0/1:41
- chr10 12076250 . CA CAGA 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12083993 . A C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12095914 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12100742 . AAAAAG AAAAAGAAAAG 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12106064 . tc tCGGGAc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12111935 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12112070 . TA TACA 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12123666 . C T 15.1 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,10,0,9;MQ=50;PV4=1,5.5e-11,0.15,1 PL:DP:SP:GT:GQ 45,0,211:19:0:0/1:48
- chr10 12139569 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12140030 . C G 32.4 . DP=20;AF1=0.5554;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=48;PV4=1,1,0.14,1 PL:DP:SP:GT:GQ 62,0,7:5:0:0/1:10
- chr10 12143105 . C G 42.1 . DP=44;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,3,1;MQ=48;PV4=0.4,0.31,0.18,1 PL:DP:SP:GT:GQ 72,0,12:5:0:0/1:15
- chr10 12149939 . C T 32.1 . DP=50;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,3;MQ=48;PV4=1,1,0.16,1 PL:DP:SP:GT:GQ 61,1,0:5:0:1/1:23
- chr10 12154676 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12160965 . C T 5.49 . DP=8;AF1=0.5049;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=49;PV4=1,1,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,17:5:0:0/1:20
- chr10 12160969 . T TGACGC 3.81 . INDEL;DP=9;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,26:2:0:0/1:29
- chr10 12162790 . GTCT GTCTCTGAGAGAGAGATCT 66.4 . INDEL;DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 106,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 12162796 . TGGGC TGACTCGGGC 7.35 . INDEL;DP=17;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12191616 . C G 6.2 . DP=23;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=8,4,0,3;MQ=48;PV4=0.077,0.029,1.4e-10,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,255:15:11:0/1:38
- chr10 12191620 . C A 32 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,1,0,7;MQ=48;PV4=0.00025,0.00053,0.0011,1 PL:DP:SP:GT:GQ 62,0,222:18:36:0/1:65
- chr10 12198019 . G A 99 . DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,8,0,10;MQ=46;PV4=1,0.043,6.9e-16,1 PL:DP:SP:GT:GQ 179,0,186:18:0:0/1:99
- chr10 12200092 . A G 5.46 . DP=15;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,2,0,3;MQ=48;PV4=1,0.47,1,0.42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,40:6:0:0/1:36
- chr10 12200125 . C T 45 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,6;MQ=48;PV4=1,0.028,0.029,1 PL:DP:SP:GT:GQ 75,0,125:12:0:0/1:78
- chr10 12202866 . A T 70 . DP=25;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,10,0;MQ=49;PV4=1,1.9e-11,0.018,1 PL:DP:SP:GT:GQ 100,0,220:21:0:0/1:99
- chr10 12206193 . G T 42 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,4,0;MQ=47;PV4=1,0.26,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 72,0,67:7:0:0/1:69
- chr10 12206361 . A C 5.46 . DP=46;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=5,15,7,0;MQ=49;PV4=0.00089,0.013,7.8e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,255:27:30:0/1:37
- chr10 12208532 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12209752 . T C 99 . DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,12,9,14;MQ=49;PV4=0.77,7.1e-16,0.22,1 PL:DP:SP:GT:GQ 142,0,255:45:1:0/1:99
- chr10 12221207 . GAA G 6.56 . INDEL;DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12221208 . A T 6.02 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 12238325 . TGGGAGGG TGGG 99 . INDEL;DP=24;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,6,0,9;MQ=50;PV4=0.44,0.4,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 193,0,174:16:0:0/1:99
- chr10 12268401 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12279328 . T A 18 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 50,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 12287655 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12290167 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12292286 . C G 99 . DP=32;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,11,1;MQ=47;PV4=1,5.7e-10,4.6e-06,1 PL:DP:SP:GT:GQ 171,0,217:23:0:0/1:99
- chr10 12292344 . A G 21 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,20,0,8;MQ=49;PV4=1,9.2e-11,3.1e-25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,255:29:0:0/1:54
- chr10 12333644 . g gCATGTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12410639 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12477471 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12505853 . A C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12578171 . T C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12580644 . G T 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12588497 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12595427 . G A 9.31 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 12615290 . G A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12630561 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12657593 . t tG 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12682308 . A C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12692614 . T C 4.77 . DP=2;AF1=0.5009;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,24:2:0:0/1:26
- chr10 12708720 . TAT TATCTATAGAT 7.37 . INDEL;DP=25;AF1=0.5032;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,19:2:0:0/1:22
- chr10 12708728 . T C 3.41 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 32,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 12708729 . T TCGCATAA 12.7 . INDEL;DP=18;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12712070 . G A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12712229 . A C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12730218 . T A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12744139 . AGC AGCTGGGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12748998 . G GT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12763184 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12793975 . T TCCAGAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12794757 . TA TACGTGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12807754 . A T 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12836121 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12848660 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12858045 . G A 99 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,6,0;MQ=47;PV4=1,6e-05,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 132,0,169:12:0:0/1:99
- chr10 12858409 . A G 46 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,4;MQ=48;PV4=1,0.027,0.007,0.19 PL:DP:SP:GT:GQ 76,0,146:9:0:0/1:79
- chr10 12867598 . C G 79 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,9,5,6;MQ=49;PV4=1,2.8e-08,0.12,1 PL:DP:SP:GT:GQ 109,0,255:27:0:0/1:99
- chr10 12872705 . G A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12891506 . G GGCCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12930147 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12956433 . A G 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 12993800 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13010164 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13069442 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13100381 . A G 41 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,2,5,0;MQ=47;PV4=0.17,0.11,0.35,0.16 PL:DP:SP:GT:GQ 71,0,101:9:8:0/1:74
- chr10 13111744 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13167674 . TTC TTCTCTCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13168705 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13171571 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13184970 . T TCAAATG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13192767 . aa aATTa 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13199247 . A C 6.2 . DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=46;PV4=1,0.056,1,0.068 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,34:3:0:0/1:34
- chr10 13201520 . A G 12 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 13201533 . T G,C 3.41 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 48,22,30,16,0,30:3:0:1/1:49
- chr10 13208106 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13214786 . G A 50.8 . DP=40;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,4;MQ=48;PV4=1,1,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 80,0,4:6:0:0/1:6
- chr10 13214812 . A G 20.1 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 53,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 13228110 . A G 7.81 . DP=13;AF1=0.5019;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=48;PV4=1,1,0.0057,0.44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,21:5:0:0/1:24
- chr10 13237015 . G A 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,20,0;MQ=47;PV4=1,1,0.13,1 PL:DP:SP:GT:GQ 155,40,0:21:0:1/1:99
- chr10 13239547 . A G 12 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 13246031 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13246190 . C T 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 150,30,0:10:0:1/1:99
- chr10 13250865 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13251324 . C G 6.2 . DP=18;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,10,0,4;MQ=48;PV4=1,0.17,0.038,0.31 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,180:15:0:0/1:38
- chr10 13268161 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13275514 . A G 33.4 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,8,0;MQ=50;PV4=1,1,0.37,1 PL:DP:SP:GT:GQ 66,13,0:9:0:1/1:65
- chr10 13276179 . A G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 154,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 13276310 . C CATGCCGCT 5.08 . INDEL;DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,72:3:0:0/1:44
- chr10 13308650 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13308665 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13313084 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13337588 . G A 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,19;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 164,57,0:19:0:1/1:99
- chr10 13340112 . T A 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 13340293 . A G 18.6 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 51,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 13352876 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13370315 . C T 7.11 . DP=25;AF1=0.5206;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=48;PV4=1,1,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,11:3:0:0/1:14
- chr10 13375906 . T C 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,3;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 141,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 13435101 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13481427 . T A 7.8 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,19,2,7;MQ=50;PV4=1,5.1e-12,0.1,0.035 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,255:36:0:0/1:40
- chr10 13485321 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13494594 . T C 99 . DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,19,1,15;MQ=48;PV4=0.62,4.9e-14,4e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 136,0,255:38:2:0/1:99
- chr10 13506501 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13541724 . TA TAAAACA 99 . INDEL;DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,1,7,1;MQ=50;PV4=1,0.14,0.074,0.0027 PL:DP:SP:GT:GQ 166,0,255:25:0:0/1:99
- chr10 13577625 . T G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13633835 . A G 25 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 57,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 13639435 . AC ACGC 8.19 . INDEL;DP=5;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13639766 . C T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13652830 . A G 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 34,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 13653554 . A G 33 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,4,0;MQ=47;PV4=1,0.0075,0.029,1 PL:DP:SP:GT:GQ 63,0,124:8:0:0/1:66
- chr10 13653675 . T C 73 . DP=53;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,2,0,16;MQ=48;PV4=5.1e-07,0.012,0.0041,1 PL:DP:SP:GT:GQ 103,0,214:31:63:0/1:99
- chr10 13658335 . G A 17.5 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,7,0;MQ=49;PV4=1,0.27,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 49,7,0:8:0:1/1:57
- chr10 13661689 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13676485 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13683189 . C T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13693883 . C T 75.4 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,13,0;MQ=48;PV4=1,0.16,1,0.056 PL:DP:SP:GT:GQ 108,13,0:14:0:1/1:65
- chr10 13709869 . T TACAGCCGG 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13743391 . C A 33 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,5,0,6;MQ=48;PV4=1,0.44,0.041,1 PL:DP:SP:GT:GQ 63,0,87:12:0:0/1:66
- chr10 13743517 . G A 51 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,7;MQ=49;PV4=1,0.016,0.028,1 PL:DP:SP:GT:GQ 81,0,153:14:0:0/1:84
- chr10 13750323 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13769800 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13782124 . A G 17.1 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 49,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 13782496 . G A 4.77 . DP=37;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,13,9,0;MQ=49;PV4=0.00046,1.3e-05,0.0015,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,255:26:33:0/1:36
- chr10 13782605 . G A 99 . DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,32;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 181,99,0:33:0:1/1:99
- chr10 13787542 . A ACCTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13799320 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13807847 . C A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13813428 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13815477 . C T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13844326 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13881094 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13977906 . ccattgcatca cca 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 13988387 . A T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14017839 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14022285 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14060134 . AACA AA 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14060693 . TTGT TT 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14066031 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14066050 . G C 4.13 . DP=2;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=40;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,24:2:0:0/1:26
- chr10 14082303 . G C 4.21 . DP=2;AF1=0.5161;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,12:2:0:0/1:15
- chr10 14094171 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14097213 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14156185 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14186341 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14241817 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14250789 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14256401 . C A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14258267 . CT CTGT 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14275204 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14289519 . tc tCCTCc 12.7 . INDEL;DP=5;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14303095 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14304355 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14320990 . T G 5.29 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 35,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 14351440 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14352328 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14356714 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14366050 . g gGGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14368231 . G T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14372063 . C T 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14381313 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14382066 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14410063 . C T 14.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14414202 . T A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14448005 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14462368 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14493970 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14497970 . C A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14503161 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14514863 . AG AGTTTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14519892 . G A 10.2 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 41,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 14519924 . A C 6.79 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 14529523 . t tGTCGCCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14563097 . A G 14.1 . DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 46,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 14572300 . A G 13.5 . DP=6;AF1=0.543;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=47;PV4=1,1,0.13,0.45 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,8:4:0:0/1:11
- chr10 14572306 . A T 6.02 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 14592635 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14611423 . C T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14632332 . A AGTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14635186 . T TGGTGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14637067 . C T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14663901 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14681467 . GGA GGAGA 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14693160 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14700381 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14765351 . T A 5.46 . DP=7;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,1,2;MQ=39;PV4=0.43,0.0073,0.17,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,113:7:0:0/1:37
- chr10 14819973 . G T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14852334 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14866927 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14868593 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14882003 . T G 4.77 . DP=12;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.4,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,29:4:0:0/1:31
- chr10 14882003 . TT TTCGCTGCGCT 7.35 . INDEL;DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 14905185 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14906395 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14934483 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14963547 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14967310 . GGAGA G 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14976727 . G C 47 . DP=13;AF1=0.5013;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,1,4;MQ=48;PV4=1,0.49,0.14,0.033 PL:DP:SP:GT:GQ 77,0,23:7:0:0/1:26
- chr10 14977939 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 14981932 . G C 15.9 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 47,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 14981942 . C G 16.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 48,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 15014418 . C G 44.1 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 77,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 15014440 . A G 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 155,48,0:16:0:1/1:99
- chr10 15014698 . C T 5.29 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 35,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 15014702 . A G 13.2 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 15023727 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15036531 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15057303 . g gCTGT 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15106379 . A G 32 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,7,0;MQ=49;PV4=1,3.8e-06,3.1e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 62,0,177:14:0:0/1:65
- chr10 15154974 . A G 13.9 . DP=14;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 45,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 15162964 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15166243 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15172078 . CAG CAGAG 3.25 . INDEL;DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.14 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,92:4:0:0/1:41
- chr10 15173312 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 15221517 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15234735 . TA TAAA 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15237355 . G T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15263100 . C T 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 164,36,0:12:0:1/1:99
- chr10 15267089 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15290696 . C T 28 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,12,0,4;MQ=49;PV4=1,0.18,7.5e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 58,0,228:17:0:0/1:61
- chr10 15322767 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15347616 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15360676 . CC CCCGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15372452 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15376859 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15388415 . T TCGAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15396186 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15396207 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15428900 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15449026 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15485529 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15486091 . A ACACT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15500468 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15511853 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15544750 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15573050 . A G 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 186,30,0:10:0:1/1:99
- chr10 15611877 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15640262 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15648243 . C T 15.2 . DP=32;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,3,1;MQ=50;PV4=0.4,0.019,0.34,1 PL:DP:SP:GT:GQ 45,0,17:5:0:0/1:20
- chr10 15655696 . T G 9.52 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,1;MQ=47;PV4=0.43,0.044,1,0.28 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,63:7:0:0/1:42
- chr10 15669756 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15685983 . A T 20.6 . DP=8;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,0;MQ=49;PV4=1,1,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,2,0:5:0:1/1:37
- chr10 15693266 . TGT TGTAGGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15697393 . A T 14.2 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,17,8,0;MQ=49;PV4=5.8e-06,0.00016,0.0053,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,246:26:52:0/1:47
- chr10 15713541 . T C 60.5 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 93,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 15713667 . C G 86 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 119,36,0:12:0:1/1:99
- chr10 15720866 . T A 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 45,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 15726159 . T G 24 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=49;PV4=1,0.1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 54,0,58:9:0:0/1:56
- chr10 15728269 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15729923 . C T 99 . DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,33,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 147,99,0:33:0:1/1:99
- chr10 15741312 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15752619 . G GGCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15760939 . A C 19.1 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,1,0,4;MQ=48;PV4=0.14,0.063,0.15,1 PL:DP:SP:GT:GQ 49,0,104:8:8:0/1:52
- chr10 15783293 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15801258 . TC TCCTCACCCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15804694 . a aATGTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15810275 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15810280 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15848318 . G T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15865282 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15874369 . A ATC 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15934887 . G A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15949600 . G T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15950296 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15985072 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 15989335 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16027306 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16033307 . ttctct tt 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16079971 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16095235 . a aTCAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16133005 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16143359 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16157798 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16160492 . ACTTT A 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16164486 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16280024 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16286037 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16302424 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16319885 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16320233 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16320495 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16326927 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16334786 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16355076 . T C 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16366063 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16366096 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16492175 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16494946 . A G 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16508921 . C G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16513396 . A G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16515744 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16526840 . G A 48 . DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 81,27,0:9:0:1/1:99
- chr10 16547058 . A G 53.2 . DP=46;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,1,6,0;MQ=47;PV4=0.14,1,0.027,1 PL:DP:SP:GT:GQ 82,0,2:7:0:0/1:3
- chr10 16556710 . T C 19.1 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,6,0,4;MQ=49;PV4=1,0.026,0.076,1 PL:DP:SP:GT:GQ 49,0,179:11:0:0/1:52
- chr10 16562600 . G A 33 . DP=58;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=9,8,6,3;MQ=50;PV4=0.68,2.8e-07,0.072,0.097 PL:DP:SP:GT:GQ 63,0,255:26:2:0/1:66
- chr10 16576504 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16601106 . a aTCGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16611152 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16613165 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16627346 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16642901 . G GGTTCTGGAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16736977 . T C 9.49 . DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 16748321 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16776447 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16797033 . A G 59 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,10;MQ=49;PV4=1,0.0019,0.099,1 PL:DP:SP:GT:GQ 89,0,99:14:0:0/1:92
- chr10 16797963 . ACTC AC 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16843978 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16853903 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16856556 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16887445 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16905881 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 16943371 . G C 46.3 . DP=58;AF1=0.543;CI95=0.5,1;DP4=0,1,4,2;MQ=50;PV4=0.43,0.007,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 76,0,8:7:0:0/1:11
- chr10 16967401 . C T 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 42,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 16970182 . G A 4.18 . DP=3;AF1=0.51;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,14:2:0:0/1:17
- chr10 16979751 . T A 23 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=9,5,0,7;MQ=49;PV4=0.0071,4.6e-05,0.014,1 PL:DP:SP:GT:GQ 53,0,255:21:21:0/1:56
- chr10 16997824 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17009881 . a aACCATATC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17024503 . G A 22.2 . DP=17;AF1=0.5207;CI95=0.5,1;DP4=0,1,3,1;MQ=49;PV4=0.4,0.12,0.34,1 PL:DP:SP:GT:GQ 52,0,11:5:0:0/1:14
- chr10 17024615 . A T 24.1 . DP=27;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=48;PV4=1,0.31,0.1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 54,0,16:4:0:0/1:19
- chr10 17030322 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17040063 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17075345 . T A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17086933 . A G 9.52 . DP=13;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,0.085,0.2,0.16 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,30:5:0:0/1:32
- chr10 17086940 . A T 3.55 . DP=14;AF1=0.5014;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=50;PV4=1,0.14,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,22:5:0:0/1:24
- chr10 17100244 . G C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17113105 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17130598 . TT TTGAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17131442 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17135012 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17151714 . CTCTTC CTC 4.42 . INDEL;DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,0,2;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,36:4:0:0/1:38
- chr10 17156151 . A G 6.2 . DP=25;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=2,7,2,2;MQ=49;PV4=0.53,0.0043,0.03,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,234:13:3:0/1:38
- chr10 17157630 . C T 99 . DP=44;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,9,4,23;MQ=49;PV4=1,4.7e-10,0.012,0.018 PL:DP:SP:GT:GQ 180,0,213:38:0:0/1:99
- chr10 17164366 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17168042 . AA AAACA 5.08 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,56:3:0:0/1:44
- chr10 17168563 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17168615 . T C 15.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 47,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 17174567 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17187287 . G T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17191011 . A G 3.54 . DP=4;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=49;PV4=1,0.17,0.21,0.48 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,62:4:0:0/1:34
- chr10 17196634 . TAAAA TATCAAAA 15.6 . INDEL;DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=50;PV4=1,0.42,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 53,0,41:3:0:0/1:44
- chr10 17196649 . G C 3.54 . DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=49;PV4=1,0.055,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,49:4:0:0/1:34
- chr10 17199419 . C G 63 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 95,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 17204139 . G A,T 36.5 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 75,18,64,6,0,64:5:0:1/1:72
- chr10 17204187 . G A 88.5 . DP=17;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,5,4;MQ=48;PV4=1,0.23,0.28,1 PL:DP:SP:GT:GQ 118,2,0:10:0:1/1:37
- chr10 17211231 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17216556 . C T 92 . DP=24;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 125,33,0:11:0:1/1:99
- chr10 17243372 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17272648 . G C 18.1 . DP=21;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,7,4,0;MQ=48;PV4=0.077,0.052,0.00011,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,255:15:11:0/1:51
- chr10 17279224 . AAC AACTACGGCAC 3.25 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,96:4:0:0/1:41
- chr10 17279270 . A C 8.64 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,1,1;MQ=48;PV4=1,0.2,0.0061,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,51:4:0:0/1:41
- chr10 17305039 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17305047 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17362106 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17365186 . A C 8.74 . DP=9;AF1=0.5128;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=46;PV4=1,1,0.042,0.14 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,13:3:0:0/1:16
- chr10 17421281 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17434240 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17476498 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17510921 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17512416 . G T 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17558790 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17560532 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17588152 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17601594 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17619958 . C T 3.64 . DP=7;AF1=0.5205;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=47;PV4=1,1,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,11:3:0:0/1:14
- chr10 17620792 . A T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17623189 . C T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17636403 . G C 11.3 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=49;PV4=1,0.065,0.065,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,110:7:0:0/1:44
- chr10 17645814 . C T 85 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,4,2;MQ=47;PV4=0.43,0.026,0.057,0.41 PL:DP:SP:GT:GQ 115,0,56:8:4:0/1:59
- chr10 17646088 . T C 3.54 . DP=14;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=49;PV4=1,0.077,0.079,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,77:6:0:0/1:34
- chr10 17653605 . G C 6.98 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17686334 . C T 39 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,3,3,1;MQ=48;PV4=0.57,0.094,0.051,1 PL:DP:SP:GT:GQ 69,0,165:10:2:0/1:72
- chr10 17718013 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17726972 . TT TTGCCCT 4.42 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=49;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,40:2:0:0/1:40
- chr10 17737028 . A G 10.4 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=9,2,6,0;MQ=50;PV4=0.51,0.01,4.5e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,203:17:3:0/1:43
- chr10 17747053 . G C 13.2 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,17,0,12;MQ=50;PV4=1,3.9e-10,0.39,0.21 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,255:30:0:0/1:46
- chr10 17773371 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17773389 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 17775063 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18138639 . A G 13.9 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 45,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 18231855 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18237298 . A G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18242304 . T C 99 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,15;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 255,69,0:23:0:1/1:99
- chr10 18251309 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18251345 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18254606 . C A 4.13 . DP=17;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,9,0,4;MQ=50;PV4=1,0.0027,0.007,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,231:14:0:0/1:35
- chr10 18274943 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18280016 . G A 6.98 . DP=10;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=48;PV4=1,1,0.065,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,29:4:0:0/1:31
- chr10 18285348 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18292428 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18292446 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18298932 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18315373 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18331799 . A C 12.3 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=49;PV4=1,1,0.074,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,43:6:0:0/1:42
- chr10 18340121 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18353726 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18405070 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18439747 . C T 51.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 84,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 18446561 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18454685 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18533770 . c cTT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18561887 . G T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18568160 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18596796 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18727725 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18737521 . c cTCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18774450 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18774471 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18789252 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18789671 . A C 9.31 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 18803915 . A C 6.98 . DP=15;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=2,2,3,0;MQ=49;PV4=0.43,0.11,0.065,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,80:7:4:0/1:39
- chr10 18823250 . T C 12 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 18828663 . G T 17.1 . DP=8;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,2;MQ=49;PV4=1,1,0.26,0.1 PL:DP:SP:GT:GQ 46,0,3:4:0:0/1:5
- chr10 18828721 . CAAA CAAAAA 99 . INDEL;DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 252,36,0:12:0:1/1:99
- chr10 18828723 . AAG AAGAG 96.5 . INDEL;DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 137,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 18836957 . C T 3.28 . DP=9;AF1=0.5716;CI95=0.5,1;DP4=0,1,2,0;MQ=49;PV4=0.33,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,6:3:0:0/1:8
- chr10 18837285 . T C 25.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 58,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 18868631 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18871213 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18872872 . C T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 18898916 . T C 6.98 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=48;PV4=1,0.45,0.048,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,37:4:0:0/1:36
- chr10 18903605 . A C 29 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 61,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 18931512 . T C 99 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,20;MQ=44;PV4=1,1,0.0023,1 PL:DP:SP:GT:GQ 222,47,0:21:0:1/1:99
- chr10 18937579 . AAAGAAG AAAGAAGAAG 19.5 . INDEL;DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=50;PV4=1,1,0.19,1 PL:DP:SP:GT:GQ 57,0,83:6:0:0/1:60
- chr10 18957647 . T G 99 . DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,18;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 164,57,0:19:0:1/1:99
- chr10 19010724 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19026387 . ACT A 3.25 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19026886 . G A 20 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,4;MQ=49;PV4=1,0.0055,0.092,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,0,161:10:0:0/1:53
- chr10 19027478 . G A 37 . DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,5,6,0;MQ=49;PV4=0.093,0.0039,1.2e-07,1 PL:DP:SP:GT:GQ 67,0,255:16:10:0/1:70
- chr10 19072792 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19072797 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19091591 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19139024 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19160979 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19176770 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19209487 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19293206 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19309467 . t tTGTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19311918 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19312899 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19351043 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19355861 . tt tTAGATTTTATGAGGt 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19408059 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19433630 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19436928 . C CAGTCG 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19528656 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19541152 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19633941 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19638462 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19658690 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19667147 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19694913 . T A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19794038 . G T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19808313 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19820714 . C A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19830942 . CAAAA CA 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19868214 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19894830 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19910989 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19921743 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19939805 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19985215 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 19995903 . T A 6.98 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20070047 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20093007 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20098326 . C G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20117318 . C T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20137292 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20162981 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20213524 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20213631 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20257782 . T TCTTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20258987 . C T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20261545 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20296454 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20354296 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20406347 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20406351 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20432411 . G A 58.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 91,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 20438863 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20446540 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20462052 . A AGTCGTCT 12.7 . INDEL;DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20486215 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20506418 . G A 99 . DP=55;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=18,11,11,12;MQ=48;PV4=0.4,5.8e-12,7.3e-17,1 PL:DP:SP:GT:GQ 207,0,255:52:4:0/1:99
- chr10 20511505 . T TTCAAACCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20534333 . A G 99 . DP=55;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=22,11,9,4;MQ=48;PV4=1,5.1e-06,2.8e-15,0.003 PL:DP:SP:GT:GQ 200,0,255:46:0:0/1:99
- chr10 20562026 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20568524 . T C 32 . DP=5;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,4,0;MQ=48;PV4=1,0.0054,0.16,1 PL:DP:SP:GT:GQ 62,0,33:5:0:0/1:36
- chr10 20573980 . A ACCTTGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20585605 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20604764 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20615538 . T G 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20631347 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20646547 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20668453 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20723668 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20732346 . C T 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 41,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 20740586 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20759294 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20782965 . T G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20813244 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20852075 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20879956 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20930737 . T G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20969525 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20970597 . C A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20985564 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 20992226 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21014889 . A T 4.77 . DP=2;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=44;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,27:2:0:0/1:29
- chr10 21018539 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21070217 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21091805 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21098688 . T G 3.54 . DP=12;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=49;PV4=1,0.16,0.01,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,101:9:0:0/1:34
- chr10 21104534 . A C 10.6 . DP=11;AF1=0.5263;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=48;PV4=1,0.28,1,0.47 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,10:4:0:0/1:13
- chr10 21104535 . A T 5.47 . DP=11;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=48;PV4=1,1,0.029,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,22:4:0:0/1:25
- chr10 21104613 . T C 11.3 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,16,2,3;MQ=50;PV4=0.12,8.5e-06,0.00013,0.41 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,255:22:9:0/1:44
- chr10 21115332 . T C 17.1 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,4,0;MQ=49;PV4=1,0.038,0.16,0.49 PL:DP:SP:GT:GQ 47,0,79:7:0:0/1:50
- chr10 21120116 . A G 58 . DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=17,0,12,0;MQ=49;PV4=1,1e-11,1e-10,1 PL:DP:SP:GT:GQ 88,0,239:29:0:0/1:91
- chr10 21137019 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21139216 . G A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21139294 . A ACGAACGCTTGC 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21141469 . T C 37 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 70,27,0:9:0:1/1:99
- chr10 21142950 . A T 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 21147133 . A T 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 21171173 . g gCGCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21172102 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21176945 . G A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21178780 . A G 3.54 . DP=20;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,1,2,0;MQ=49;PV4=1,0.35,0.00017,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,88:6:0:0/1:34
- chr10 21181442 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21182448 . G T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21205345 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21245697 . A G 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21255162 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21276302 . T G 4.77 . DP=2;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,44:2:0:0/1:36
- chr10 21277883 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21279703 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21319000 . G A 4.13 . DP=4;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=43;PV4=1,0.0068,0.026,0.077 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,41:3:0:0/1:34
- chr10 21319010 . A C 62 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,4;MQ=45;PV4=1,0.0093,0.023,0.27 PL:DP:SP:GT:GQ 92,0,74:6:0:0/1:77
- chr10 21319705 . G T 34 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,0,3;MQ=45;PV4=0.4,1,0.051,1 PL:DP:SP:GT:GQ 64,0,39:5:0:0/1:42
- chr10 21339698 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21350826 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21355042 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21378160 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21382589 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21386615 . GT GTCTGGTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21401765 . T C 21 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 53,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 21414892 . C G 99 . DP=35;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,3,28;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 201,93,0:31:0:1/1:99
- chr10 21430083 . T C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21435340 . ACACTC AC 99 . INDEL;DP=60;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,18,6,15;MQ=50;PV4=0.55,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,0,255:51:3:0/1:99
- chr10 21437445 . G A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21477647 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21515638 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21526523 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21549839 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21558102 . CT CTTAT 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21571385 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21615784 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21622030 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21661948 . G T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21677509 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21694896 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21705615 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21706830 . C A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21759405 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21760159 . C G 4.2 . DP=2;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,0,1;MQ=30;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,1,0:2:0:1/1:23
- chr10 21762607 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21812972 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21835046 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21854943 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21875209 . T TCACCCCACGGC 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21884323 . T A 6.2 . DP=13;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,0,3;MQ=49;PV4=0.4,0.19,0.1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,69:6:4:0/1:38
- chr10 21888311 . A C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21900476 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21917713 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21925020 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21926169 . t tTTGCCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21926525 . ag aGTGAGAGCg 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21931316 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21936402 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 21946613 . G A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22022400 . A AGC 5.08 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,46:3:0:0/1:43
- chr10 22040779 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22058925 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22063990 . G T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22088505 . t tCCTCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22159387 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22164027 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22169025 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22171185 . A C 6.21 . DP=9;AF1=0.5019;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.19,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,21:5:0:0/1:24
- chr10 22218112 . G C 9.6 . DP=6;AF1=0.5101;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=46;PV4=1,1,1,0.3 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,14:3:0:0/1:17
- chr10 22221587 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22233163 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22263133 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22275415 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22291745 . T A 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22315808 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22327530 . C T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22337752 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22339660 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22395260 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22411480 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22423574 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22427016 . c cGGATGAGA 3.81 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22443359 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22450408 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22458197 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22557442 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22558589 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22566299 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22601686 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22603667 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22607823 . A C 11.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 42,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 22617918 . AC ACCCC 5.09 . INDEL;DP=5;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.037 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,20:3:0:0/1:23
- chr10 22640349 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22649010 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22670883 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22671042 . A C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22717250 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22724525 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22727675 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22756805 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22768150 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22780773 . T TCATACTGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22796113 . A C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22803010 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22804175 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22830719 . G C 99 . DP=35;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=2,1,21,7;MQ=48;PV4=1,0.046,0.098,1 PL:DP:SP:GT:GQ 201,0,1:31:0:1/1:5
- chr10 22839628 . T C 40.3 . DP=18;AF1=0.543;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,1;MQ=48;PV4=1,0.31,0.28,1 PL:DP:SP:GT:GQ 70,0,8:6:0:0/1:11
- chr10 22842835 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22853322 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22855048 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22856946 . C T 91 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,7;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 124,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 22861474 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22862118 . A G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22870762 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22875295 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22896779 . C T 51 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 83,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 22898553 . T G 12.3 . DP=21;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,4,0;MQ=48;PV4=1,0.039,0.047,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,146:12:0:0/1:45
- chr10 22898556 . A C 23 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,4,0;MQ=47;PV4=1,0.039,0.024,1 PL:DP:SP:GT:GQ 53,0,106:8:0:0/1:56
- chr10 22939572 . C T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22942178 . G A 6.98 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22955961 . AAAAATA AA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 22956876 . A T 7.59 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 23009405 . AA AACTGTGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23012836 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23062705 . A C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23073724 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23079836 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23092095 . T C 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23109543 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23118486 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23191990 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23193496 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23242996 . t tTCCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23249104 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23291048 . T C 15.2 . DP=8;AF1=0.5128;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=48;PV4=1,0.21,0.11,0.35 PL:DP:SP:GT:GQ 45,0,13:4:0:0/1:16
- chr10 23296137 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23299017 . A G 7.89 . DP=2;AF1=0.5128;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,13:2:0:0/1:16
- chr10 23315954 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23341661 . a aTTCTCAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23381659 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23382132 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23409588 . A ATT 5.08 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.28 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,55:3:0:0/1:44
- chr10 23426671 . T G 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 45,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 23482850 . G A 39.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 72,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 23491503 . T TCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23518618 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23523618 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23547338 . T A 4.13 . DP=3;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,1,0;MQ=48;PV4=0.33,0.45,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,65:3:0:0/1:35
- chr10 23550940 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23552796 . G C 5.46 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23567713 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23640511 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23641087 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23661232 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23688543 . A C 4.61 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 34,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 23693234 . C A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23721107 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23737693 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23757819 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23765883 . G T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23777973 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23794669 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23837797 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23935282 . CTAGATTTTA CTA 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23946721 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23954899 . C T 7.8 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23964059 . A C 7.8 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23973908 . G T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23977060 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 23995677 . T G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24028158 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24037438 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24059678 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24090843 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24102755 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24106379 . T G 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24124860 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24164343 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24168266 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24169895 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24203975 . A T 6.98 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24233275 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24276673 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24283071 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24332573 . G A 12.3 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24345070 . C CTATTTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24345650 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24357819 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24373487 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24402613 . G T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24412046 . gc gCTATTTTc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24424210 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24467851 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24470332 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24483516 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24496177 . G A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24505055 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24527059 . G GGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24530360 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24564830 . C T 9.56 . DP=29;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=50;PV4=1,0.083,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,17:4:0:0/1:20
- chr10 24564859 . A G 13.2 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,5;MQ=49;PV4=1,2.7e-05,2.1e-05,0.068 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,215:16:0:0/1:46
- chr10 24643207 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24646710 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24672258 . C CAGTTCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24714580 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24727492 . C G 12.3 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,2;MQ=48;PV4=1,0.028,0.0038,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,153:7:0:0/1:45
- chr10 24740862 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24759438 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24762465 . A G 58 . DP=56;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,5,5,6;MQ=48;PV4=0.64,0.002,0.15,1 PL:DP:SP:GT:GQ 88,0,150:18:2:0/1:91
- chr10 24784206 . T C 3.01 . DP=10;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=49;PV4=1,0.36,0.0034,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,52:5:0:0/1:33
- chr10 24786291 . A G 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24802141 . T C 8.66 . DP=7;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=48;PV4=1,0.21,0.17,0.24 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,22:3:0:0/1:25
- chr10 24830554 . C CGCGCGA 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24849578 . C A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24849657 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24873369 . C G 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24873995 . C G 3.98 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 33,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 24878129 . G A 6.79 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 24880232 . C G 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24880712 . G A 25.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 58,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 24880899 . C G 3.59 . DP=3;AF1=0.51;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,14:2:0:0/1:17
- chr10 24884779 . GAAAAAAAA GAAAAAAA,GAAAAAAAAA 28.5 . INDEL;DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,3;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 69,39,70,0,28,67:14:0:1/1:99
- chr10 24889383 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24889901 . T G 94 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,19;MQ=47;PV4=1,0.38,0.15,1 PL:DP:SP:GT:GQ 127,33,0:20:0:1/1:99
- chr10 24896805 . T C 4.77 . DP=5;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=45;PV4=1,1,0.11,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,43:3:0:0/1:36
- chr10 24908430 . G T 5.46 . DP=13;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,3,0;MQ=50;PV4=1,0.011,1,0.0089 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,106:6:0:0/1:37
- chr10 24909712 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24915375 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24929228 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24949743 . G C 41 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 73,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 24949895 . G T 38 . DP=8;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,5,0;MQ=47;PV4=0.17,1.4e-05,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 68,0,32:6:0:0/1:35
- chr10 24949901 . C T 18.1 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,2,0;MQ=46;PV4=1,1,0.0057,0.41 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,69:5:0:0/1:51
- chr10 24959320 . T G 6.36 . DP=8;AF1=0.5262;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=49;PV4=1,0.28,0.33,0.11 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,10:4:0:0/1:13
- chr10 24964343 . G A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24982001 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 24989171 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25000133 . C T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25020356 . T G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25035761 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25049852 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25062338 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25074367 . g gACATA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25091751 . C A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25109228 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25142026 . T TTTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25145181 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25149612 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25152926 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25156443 . T TGA 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25175792 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25181296 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25195328 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25196566 . T TCTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25203253 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25232308 . G T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25242523 . C CTGTCTCTAAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25252099 . A T 4.13 . DP=2;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=45;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,36:2:0:0/1:34
- chr10 25281468 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25326618 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25373322 . G T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25388883 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25394178 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25407530 . TGG TGGGGG 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25414815 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25419172 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25433221 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25469239 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25481970 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25505099 . C T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25529710 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25565557 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25574194 . C A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25631568 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25656602 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25684768 . T C 24 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,2,0;MQ=48;PV4=1,0.015,0.00019,1 PL:DP:SP:GT:GQ 54,0,174:8:0:0/1:57
- chr10 25695747 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25700509 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25724296 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25733895 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25755678 . G C 30 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,5;MQ=49;PV4=1,0.1,0.0013,0.13 PL:DP:SP:GT:GQ 60,0,154:14:0:0/1:63
- chr10 25755716 . Tacacacacacacacacaca TACacacacacacacacacaca 12.7 . INDEL;DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25755732 . cacataca caca 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25789973 . ATGG ATGGTGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25797774 . tg tGGGg 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25802650 . t tGG 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25825969 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25861632 . C T 87 . DP=40;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,16,3,15;MQ=49;PV4=1,1.1e-15,0.014,1 PL:DP:SP:GT:GQ 117,0,255:38:0:0/1:99
- chr10 25862838 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25885765 . T G 3.01 . DP=19;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,4;MQ=49;PV4=1,0.23,0.00066,0.052 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,118:13:0:0/1:33
- chr10 25888180 . A G 95.4 . DP=43;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,9,2;MQ=48;PV4=0.25,0.45,0.19,1 PL:DP:SP:GT:GQ 128,13,0:12:0:1/1:65
- chr10 25916827 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25935332 . A ATTTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25942395 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25965204 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25969301 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25987085 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25991954 . gg gGCTATg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 25998967 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26081084 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26087479 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26093713 . C CTGAACAAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26097794 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26100643 . c cGTCGA 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26123606 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26154450 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26189856 . ata aTAGTta 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26285537 . A C 22 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 54,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 26304985 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26309385 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26310341 . GTT GTTCTCGGACTT 7.62 . INDEL;DP=2;AF1=0.543;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,8:2:0:0/1:11
- chr10 26324557 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26357650 . AC ACGTAGTGTC 5.79 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,44:2:0:0/1:43
- chr10 26357748 . G A 99 . DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,9,8,7;MQ=48;PV4=0.75,7.4e-08,7.6e-11,1 PL:DP:SP:GT:GQ 213,0,255:37:1:0/1:99
- chr10 26357885 . A ACGC 5.08 . INDEL;DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,57:3:0:0/1:44
- chr10 26360035 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26399950 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26414552 . AG AGCTG 7.57 . INDEL;DP=5;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,1;MQ=49;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,9:2:0:0/1:12
- chr10 26427899 . G GCC 5.08 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26443747 . T C 14.2 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,2,0,3;MQ=48;PV4=0.43,0.38,0.029,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,82:7:4:0/1:47
- chr10 26458830 . c cAGAGACCCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26460161 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26463130 . C A 61 . DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,11,2,14;MQ=50;PV4=0.0082,1.9e-16,0.014,1 PL:DP:SP:GT:GQ 91,0,255:41:21:0/1:94
- chr10 26463507 . A G 6.79 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 26463513 . T A 6.98 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=48;PV4=1,0.42,0.0061,0.051 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,38:4:0:0/1:37
- chr10 26510364 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26514979 . T A 3.01 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,44:2:0:0/1:33
- chr10 26534937 . C T 19.1 . DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,8,0,4;MQ=49;PV4=1,0.033,0.00074,1 PL:DP:SP:GT:GQ 49,0,239:14:0:0/1:52
- chr10 26534985 . A ACAGAGA 7.35 . INDEL;DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 26559732 . T G 49 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,9;MQ=49;PV4=1,0.027,0.037,1 PL:DP:SP:GT:GQ 79,0,67:13:0:0/1:70
- chr10 26562658 . T C 14.2 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,4;MQ=49;PV4=1,0.0016,0.33,0.01 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,113:10:0:0/1:47
- chr10 26567492 . ac aCCCGTCc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26583312 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26593934 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26598614 . G T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26676296 . T G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26676611 . G A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26681008 . C CATA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26696506 . A AAC 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26701154 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26723497 . A G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26735923 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26738081 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26754271 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26774337 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26781388 . G A 99 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 150,54,0:18:0:1/1:99
- chr10 26802653 . G A 29.4 . DP=10;AF1=0.5554;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=45;PV4=1,1,0.12,1 PL:DP:SP:GT:GQ 59,0,7:4:0:0/1:10
- chr10 26815521 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26830672 . T C 4.77 . DP=3;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,0.14,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,26:3:0:0/1:28
- chr10 26849292 . G C 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 26855591 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26877005 . AGC AGTGGC 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26877393 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26877700 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26910525 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26911761 . AT ATTT 3.25 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26948411 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26955910 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 26995907 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27007312 . CCTC CCTCTCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27009334 . A G 77 . DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,15,0,18;MQ=49;PV4=1,0.0004,0.0048,1 PL:DP:SP:GT:GQ 107,0,190:33:0:0/1:99
- chr10 27035296 . A T 8.64 . DP=25;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,11,5,0;MQ=49;PV4=0.00097,0.0046,0.12,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,217:17:30:0/1:41
- chr10 27035414 . G T 8.64 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,5;MQ=48;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,64:11:0:0/1:41
- chr10 27078026 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27082119 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27141395 . c cTCA 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27176042 . A ATATGGGCTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27176732 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27181324 . A T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27183981 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27192343 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27250908 . AC ACC 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27252564 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27266617 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27288586 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27298855 . AA AGTAGA 12.7 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27303852 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27311595 . C G 4.13 . DP=10;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,0,2;MQ=49;PV4=0.048,0.32,0.0026,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,115:7:13:0/1:35
- chr10 27322304 . AACC A 3.25 . INDEL;DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,2,0,1;MQ=50;PV4=1,0.42,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,103:4:0:0/1:41
- chr10 27333119 . CC CCAGATGTC 7.35 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 27352908 . A C 7.8 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27352923 . CTT CTTTT 5.08 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.17 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,70:3:0:0/1:44
- chr10 27355381 . T G 17.8 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 49,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 27364301 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27375559 . C T 38 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,7;MQ=49;PV4=1,0.00056,0,0.28 PL:DP:SP:GT:GQ 68,0,54:9:0:0/1:57
- chr10 27382586 . G C 28 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,1,2;MQ=42;PV4=0.4,0.13,0.015,1 PL:DP:SP:GT:GQ 58,0,90:6:4:0/1:61
- chr10 27388945 . AC ACTC 12.7 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27388949 . A ACTAGT 12.7 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27400861 . G A 3.55 . DP=8;AF1=0.5014;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,1,0.13 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,22:4:0:0/1:24
- chr10 27400862 . T C 54 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,5,0;MQ=47;PV4=1,0.43,0.24,1 PL:DP:SP:GT:GQ 84,0,54:8:0:0/1:57
- chr10 27400965 . T A 6.2 . DP=12;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,3,0,3;MQ=48;PV4=0.2,0.35,0.016,0.29 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,129:10:7:0/1:38
- chr10 27401056 . C T 38 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,5,0,5;MQ=49;PV4=0.47,0.0046,0.026,0.23 PL:DP:SP:GT:GQ 68,0,218:12:3:0/1:71
- chr10 27405096 . A G 30 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,7,0;MQ=50;PV4=0.3,3.3e-16,0.27,1 PL:DP:SP:GT:GQ 60,0,112:10:0:0/1:63
- chr10 27409555 . G A 22 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 54,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 27423744 . T C 13.2 . DP=21;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,5,1;MQ=50;PV4=0.35,1.8e-10,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,222:17:0:0/1:46
- chr10 27456003 . G A 23 . DP=27;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 55,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 27482685 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27493513 . T A 7.8 . DP=18;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,4;MQ=50;PV4=1,0.13,0.27,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,33:6:0:0/1:35
- chr10 27496624 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27506854 . C T 63.1 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 96,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 27520629 . T G 6.02 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 27535600 . T C 4.13 . DP=42;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=14,7,5,3;MQ=36;PV4=1,4.8e-05,0.28,0.068 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,252:29:0:0/1:35
- chr10 27536378 . GA GACA 3.25 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,1,0;MQ=45;PV4=1,1,1,0.17 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,37:3:0:0/1:37
- chr10 27536428 . T C 99 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,8;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 255,54,0:18:0:1/1:99
- chr10 27539507 . C T 4.13 . DP=27;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=7,7,3,1;MQ=49;PV4=0.59,1.8e-05,0.017,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,255:18:2:0/1:35
- chr10 27540670 . A C 18.1 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,1,0,3;MQ=47;PV4=0.14,1,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,73:7:8:0/1:51
- chr10 27546303 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27572205 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27577568 . G A 53.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 86,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 27579600 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27596223 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27598418 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27629880 . T C 29.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 61,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 27636782 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27654688 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27661241 . A AAGACTTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27687775 . T C 47.3 . DP=21;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 80,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 27687965 . A G 99 . DP=32;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,4,5,6;MQ=47;PV4=0.23,1,1.1e-12,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,0,255:26:6:0/1:99
- chr10 27692099 . A G 98.2 . DP=17;AF1=0.5207;CI95=0.5,1;DP4=1,0,12,0;MQ=47;PV4=1,0.0035,0.12,1 PL:DP:SP:GT:GQ 128,0,11:13:0:0/1:14
- chr10 27692205 . G A 14.2 . DP=46;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,14,5,2;MQ=49;PV4=0.22,1.5e-06,3.2e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,255:31:7:0/1:47
- chr10 27692279 . A C 43.3 . DP=41;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,4;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 76,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 27692371 . T G 91 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 124,42,0:14:0:1/1:99
- chr10 27692403 . C A 68.5 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 101,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 27700887 . G A 7.09 . DP=7;AF1=0.5162;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=49;PV4=1,0.14,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,12:4:0:0/1:15
- chr10 27702256 . GCCCCCC GCCCCCCC 48.9 . INDEL;DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,2,7;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 89,13,0:10:0:1/1:65
- chr10 27714898 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27725648 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27743051 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27746663 . G A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27771950 . G A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27775448 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27794202 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27822619 . TTCT TT 60.5 . INDEL;DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,3,0;MQ=50;PV4=1,0.32,1,0.34 PL:DP:SP:GT:GQ 98,0,144:8:0:0/1:99
- chr10 27857932 . G A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27895628 . A G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27899499 . C CCTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27915819 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27933701 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27944016 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27960297 . g gCTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 27964100 . T C 99 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,10,0;MQ=45;PV4=1,0.039,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 181,0,82:13:0:0/1:85
- chr10 28023747 . G C 15.1 . DP=24;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,6;MQ=49;PV4=1,0.034,0.27,1 PL:DP:SP:GT:GQ 45,0,126:12:0:0/1:48
- chr10 28024038 . A ATGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28041936 . t tGG 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28050697 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28076426 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28100895 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28111738 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28115604 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28138431 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28223886 . A C 40 . DP=26;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,7,0;MQ=48;PV4=1,1,0.0037,1 PL:DP:SP:GT:GQ 70,0,26:10:0:0/1:29
- chr10 28223896 . C T 6.98 . DP=26;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,5,0;MQ=49;PV4=1,0.0079,0.00024,0.41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,210:19:0:0/1:39
- chr10 28224075 . G A 99 . DP=49;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,17,5,11;MQ=48;PV4=0.75,0.00039,6e-10,1 PL:DP:SP:GT:GQ 215,0,255:43:1:0/1:99
- chr10 28228865 . A G 99 . DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,6,4,7;MQ=47;PV4=0.13,0.00015,1.7e-08,1 PL:DP:SP:GT:GQ 208,0,255:31:9:0/1:99
- chr10 28233120 . A C 39 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,6,0;MQ=48;PV4=1,0.00034,0.068,1 PL:DP:SP:GT:GQ 69,0,136:11:0:0/1:72
- chr10 28268132 . c cCCTCGGAAGGG 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28268146 . G C 4.13 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,0,1;MQ=47;PV4=1,1,0,0.17 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,29:3:0:0/1:30
- chr10 28281725 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28293616 . A G 7.94 . DP=2;AF1=0.5206;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,11:2:0:0/1:14
- chr10 28296883 . A G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28335272 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28345418 . T C 48.1 . DP=50;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,4;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 81,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 28346033 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28347457 . T G 24 . DP=32;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,0,7;MQ=49;PV4=1.3e-05,0.00098,0.0037,0.07 PL:DP:SP:GT:GQ 54,0,197:20:49:0/1:57
- chr10 28349707 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28372269 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28409614 . C T,G 44 . DP=26;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,23;MQ=49;PV4=1,0.0037,0.18,1 PL:DP:SP:GT:GQ 148,81,93,72,0,120:24:0:1/1:63
- chr10 28423989 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28424010 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28424243 . G C 18.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 50,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 28438835 . TCTGCACT TCT 99 . INDEL;DP=9;AF1=0.508;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,7,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 184,0,15:9:0:0/1:18
- chr10 28495301 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28501685 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28509185 . T TGTACATC 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28566207 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28599615 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28604345 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28649437 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28651677 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28653257 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28660854 . g gAAGAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28695563 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28695655 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28697330 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28705236 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28725226 . A G 4.13 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,2,0,2;MQ=34;PV4=1,9.2e-05,1,0.017 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,61:5:0:0/1:35
- chr10 28739829 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28742624 . t tTAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28776787 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28846505 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28849741 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28878641 . A ATAGTAT 5.08 . INDEL;DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,73:3:0:0/1:44
- chr10 28878643 . T TACGTGCG 7.35 . INDEL;DP=11;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,29:2:0:0/1:32
- chr10 28879477 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28879779 . T A 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 41,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 28904977 . TAACAA TAA 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 28928558 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28948138 . A ACGGCGTGCAC 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=48;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,40:2:0:0/1:42
- chr10 28953509 . tg tGCCGACAg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28971009 . C G 4.23 . DP=10;AF1=0.5205;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=46;PV4=1,1,0.28,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,11:4:0:0/1:14
- chr10 28980658 . cc cCGc 6.56 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 28986296 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29052613 . GGA GGAACATGA 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29083956 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29084099 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29093841 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29106417 . C G 7.8 . DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=45;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,35:2:0:0/1:36
- chr10 29160998 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29191656 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29191664 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29199021 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29199030 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29234587 . gc gCGGAAATACc 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29276689 . ttc tTCAGGACCAtc 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29276857 . G T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29285078 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29285093 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29290434 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29290895 . T A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29336403 . C T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29348351 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29356371 . aag aAGTCag 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29430408 . C T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29450642 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29452690 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29454157 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29483889 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29507765 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29519469 . g gGGC 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 29530035 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29539915 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29559085 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29580743 . G A 4.77 . DP=6;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=48;PV4=1,1,0,0.45 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,58:3:0:0/1:36
- chr10 29599294 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29607747 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29645924 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29710689 . AC ACTC 3.25 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.48 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,101:4:0:0/1:41
- chr10 29741672 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29747417 . C T 8.44 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 29747618 . T A 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 149,45,0:15:0:1/1:99
- chr10 29754609 . T C 7.19 . DP=4;AF1=0.5335;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,9:3:0:0/1:12
- chr10 29759167 . CGG CG 39.5 . INDEL;DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=50;PV4=1,0.00066,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 77,0,87:9:0:0/1:80
- chr10 29759169 . GT G 15.6 . INDEL;DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,8,0;MQ=50;PV4=1,5.6e-05,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 53,0,81:12:0:0/1:56
- chr10 29760209 . C T 81 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 114,36,0:12:0:1/1:99
- chr10 29773804 . G GGC 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,43:2:0:0/1:43
- chr10 29783908 . A G 36 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,3,0;MQ=47;PV4=0.1,0.32,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 66,0,50:5:10:0/1:53
- chr10 29784114 . T C 4.13 . DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=48;PV4=1,1,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,32:3:0:0/1:32
- chr10 29791839 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29822032 . C T 99 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,11,6;MQ=49;PV4=1,6.3e-06,0.29,0.47 PL:DP:SP:GT:GQ 137,7,0:18:0:1/1:57
- chr10 29839787 . A G 82 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,8,7,5;MQ=49;PV4=1,1.2e-12,0.011,1 PL:DP:SP:GT:GQ 112,0,255:31:0:0/1:99
- chr10 29839864 . A C 99 . DP=42;AF1=1;CI95=1,1;DP4=2,0,19,16;MQ=47;PV4=0.5,1,0.39,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,75,0:37:3:1/1:99
- chr10 29844206 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29845359 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29855816 . G A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29889831 . T TTCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29895387 . t tAGACATTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29896626 . C A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29910283 . C CGAGTTTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29919045 . T A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29921156 . T C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29925913 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29940540 . A T 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 29999426 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30026739 . g gCGTGT 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30033737 . T G 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30037434 . G GGTGCCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30046412 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30050175 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30054757 . G T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30072066 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30118929 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30124912 . T TCC 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30127347 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30140239 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30155679 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30176262 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30204435 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30209756 . A C 6.98 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30210343 . tctc tCTCGAGGCctc 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30216046 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30237399 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30239732 . A C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30240255 . C T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30255183 . C CGGGAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30258081 . C G 4.77 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30258121 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30274476 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30316072 . C G 99 . DP=40;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,7,6,12;MQ=48;PV4=0.18,4.1e-09,1.6e-07,1 PL:DP:SP:GT:GQ 218,0,255:35:7:0/1:99
- chr10 30317685 . A T 6.98 . DP=25;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=10,5,0,5;MQ=49;PV4=0.033,0.21,0.024,0.12 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,209:20:15:0/1:39
- chr10 30325997 . C A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30345850 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30363733 . t tGGCCCAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30373017 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30382564 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30398459 . T A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 30398499 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30407091 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30414155 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30414643 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30432174 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30435257 . tcact tCACTACTGGcact 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30449482 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30463645 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30466340 . TTC TTCATAGAGGCTC 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30469332 . GAATTTC G 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30469376 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30488485 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30488912 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30522173 . T TGTTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30572761 . a aAATG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30609054 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30609658 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30611459 . C A 5.46 . DP=20;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=9,2,0,5;MQ=49;PV4=0.0048,0.0032,0.14,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,231:16:23:0/1:37
- chr10 30613176 . g gCCCAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30617792 . GA GAAA 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30629082 . C T 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 34,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 30646971 . CT CTTACTATAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30654785 . G GACGAAGC 7.35 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,42:2:0:0/1:43
- chr10 30657670 . A C 12.3 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,0,2;MQ=45;PV4=1,0.24,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,65:4:0:0/1:45
- chr10 30669367 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 30669430 . G A 8.44 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 30669878 . G C 38.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 70,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 30669952 . A T 6.55 . DP=2;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,1;MQ=30;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,1:2:0:1/1:5
- chr10 30682317 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30711201 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30740530 . A T 19 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 51,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 30749895 . G A 50 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,3,0,5;MQ=48;PV4=0.44,0.038,0.014,0.35 PL:DP:SP:GT:GQ 80,0,116:9:0:0/1:83
- chr10 30767146 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30767773 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30785897 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30806124 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30812680 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30818863 . AG AGGCGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30831066 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30856181 . gtctt gTCTtctt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30861203 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30861208 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30862111 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30866024 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30875171 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30900802 . C T 7.8 . DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,44:2:0:0/1:39
- chr10 30912354 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30915994 . A T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30918668 . G T 55 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,8;MQ=47;PV4=1,0.00091,0.076,1 PL:DP:SP:GT:GQ 85,0,83:11:0:0/1:84
- chr10 30940579 . A T 8.65 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30944881 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30966282 . C CATGCTAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30978288 . C CACAAT 7.46 . INDEL;DP=2;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,0;MQ=48;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,12:2:0:0/1:15
- chr10 30984774 . C A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30985081 . G A 53 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 86,42,0:14:0:1/1:99
- chr10 30985990 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 30986253 . G A 6.98 . DP=4;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,44:2:0:0/1:38
- chr10 30993448 . G A 34 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 66,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 30998358 . GAT GATAT 5.11 . INDEL;DP=11;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=49;PV4=1,1,1,0.24 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,17:3:0:0/1:20
- chr10 31005821 . A G 3.01 . DP=7;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=45;PV4=1,1,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,46:3:0:0/1:33
- chr10 31005822 . C T 16.3 . DP=7;AF1=0.5263;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,1,0.29 PL:DP:SP:GT:GQ 46,0,10:3:0:0/1:13
- chr10 31016165 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31032764 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31071408 . C T 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31089738 . ca cAGGGa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31093803 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31112732 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31134557 . T C 5.46 . DP=11;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,3;MQ=49;PV4=1,0.00059,0.043,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,170:9:0:0/1:37
- chr10 31137100 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31144153 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31194971 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31209090 . A C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31246634 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31258118 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31259590 . TA TAGACGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31262929 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31276314 . A T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31310642 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31317281 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31371060 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31409249 . C T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31424171 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31443901 . T TCTAAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31444562 . t tCGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31448285 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31480439 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31499998 . C CCCTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31508956 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31520483 . ttca t 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31567677 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31568601 . C T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31572145 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31580319 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31581189 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31591487 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31597995 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31601921 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31610346 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31634971 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31638243 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31639872 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31646567 . TA TATTGTAAAA 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31681055 . T TTCAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31706798 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31707184 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31803516 . G A 17.7 . DP=10;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,1;MQ=47;PV4=1,1,0.4,1 PL:DP:SP:GT:GQ 47,0,5:4:0:0/1:7
- chr10 31804022 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31809515 . G T 12.3 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,6,0,6;MQ=49;PV4=0.014,0.0022,0.0014,0.33 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,255:23:19:0/1:45
- chr10 31810289 . A C 3.01 . DP=28;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=3,14,5,0;MQ=49;PV4=0.0021,0.016,0.0032,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,255:22:27:0/1:33
- chr10 31859556 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31883050 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31917189 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31917344 . A C 17.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 31917546 . T A 3.57 . DP=7;AF1=0.5048;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,0.24,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,17:3:0:0/1:20
- chr10 31919729 . G A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 31924186 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32001764 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32031141 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32041079 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32079212 . a aGAGAGAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32096439 . G T 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32103166 . A T 4.14 . DP=19;AF1=0.5014;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.15,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,22:4:0:0/1:25
- chr10 32103171 . G A 8.64 . DP=21;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,4,0;MQ=47;PV4=1,0.013,0.31,0.065 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,65:7:0:0/1:41
- chr10 32112242 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32115133 . A G 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 32141460 . T C 70.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 103,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 32157745 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32160753 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32180365 . T A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32197505 . T G 27 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,2,0,7;MQ=49;PV4=0.00031,0.00016,0.0043,0.49 PL:DP:SP:GT:GQ 57,0,255:21:35:0/1:60
- chr10 32204519 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32264492 . A G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32290211 . t tGCTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32307049 . G A 82.6 . DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,9;MQ=47;PV4=1,1,0.48,1 PL:DP:SP:GT:GQ 115,11,0:10:0:1/1:66
- chr10 32315698 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32324951 . C T 8.65 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32326558 . ATGT ACTTGT 5.11 . INDEL;DP=5;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=49;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,17:2:0:0/1:20
- chr10 32344736 . CG CGTG 12.7 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32379291 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32390152 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32399317 . C T 57.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 90,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 32399487 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32501005 . A T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32502906 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32517672 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32575793 . A G 99 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,9;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 188,30,0:10:0:1/1:99
- chr10 32621379 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32692473 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32724393 . aaga aa 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32726281 . tcaa t 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32735805 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32735896 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32742256 . T G 42.3 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 75,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 32745248 . A C 19.1 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,8,0,5;MQ=47;PV4=1,9.6e-05,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 49,0,179:13:0:0/1:52
- chr10 32745262 . T C 74 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,5;MQ=46;PV4=1,0.16,0.0054,1 PL:DP:SP:GT:GQ 104,0,158:12:0:0/1:99
- chr10 32749831 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32751901 . G A 13 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 44,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 32800536 . G C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 44,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 32804925 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32807487 . G C 7.81 . DP=11;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=50;PV4=1,1,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,20:5:0:0/1:23
- chr10 32839297 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32860841 . TT TTCAGAT 5.08 . INDEL;DP=7;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.33 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,31:3:0:0/1:34
- chr10 32890341 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32952347 . C G 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 32952365 . G C 7.8 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 32983966 . T TAAAAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33015855 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 33029519 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33038105 . t tCAC 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33085705 . taag tAAGAaag 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33089383 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33113632 . C T 5.51 . DP=2;AF1=0.5079;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,15:2:0:0/1:18
- chr10 33115117 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33119453 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33123824 . G C 19 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 51,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 33143396 . G A 4.81 . DP=13;AF1=0.5079;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,2;MQ=49;PV4=0.33,0.44,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,15:3:0:0/1:18
- chr10 33145334 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33145928 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33148070 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33148573 . C A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33152548 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33190620 . A G 3.54 . DP=6;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=46;PV4=1,0.016,0.14,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,30:3:0:0/1:30
- chr10 33200782 . C T 91 . DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,7,11,4;MQ=49;PV4=0.049,1.5e-06,0.058,1 PL:DP:SP:GT:GQ 121,0,249:25:13:0/1:99
- chr10 33209266 . G T 99 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,12;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 232,54,0:18:0:1/1:99
- chr10 33226033 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33233751 . C G 5.46 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33285892 . g gCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33292963 . AA AAAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33303714 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33318275 . T TACTGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33335752 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33346584 . T G 3.01 . DP=10;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,2,0;MQ=43;PV4=1,0.12,1,0.3 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,48:4:0:0/1:33
- chr10 33364433 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33377110 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33384037 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33469181 . A G 55 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=9,5,6,1;MQ=48;PV4=0.61,0.00041,0.015,0.39 PL:DP:SP:GT:GQ 85,0,255:21:2:0/1:88
- chr10 33471761 . gcacacacacacacacacacacacacacac gcacacacacacacacacacacacacac 5.08 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33475282 . C T 92 . DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,12,5,9;MQ=49;PV4=1,8.9e-08,0.031,0.45 PL:DP:SP:GT:GQ 122,0,255:34:0:0/1:99
- chr10 33510614 . G A 51.8 . DP=17;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=1,0,7,0;MQ=48;PV4=1,0.17,0.091,1 PL:DP:SP:GT:GQ 81,0,4:8:0:0/1:6
- chr10 33510663 . G A 99 . DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,1,25,14;MQ=49;PV4=1,1,0.22,1 PL:DP:SP:GT:GQ 242,80,0:41:0:1/1:99
- chr10 33510768 . G A 68 . DP=45;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,1,4,3;MQ=49;PV4=1,0.15,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 97,0,3:8:0:0/1:5
- chr10 33551333 . aa aACTCa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33552696 . A G 77.8 . DP=62;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=1,1,16,3;MQ=49;PV4=0.35,0.0032,0.27,0.38 PL:DP:SP:GT:GQ 107,0,4:21:5:0/1:6
- chr10 33566180 . A T 3.01 . DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,30:2:0:0/1:30
- chr10 33581447 . AAG AAGGCCAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33619562 . C T 13 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 44,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 33679163 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33680953 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33688437 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33704864 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33745011 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33772539 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33779045 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33793557 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33793577 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33811251 . G T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33816055 . ca cAAGTAGa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33846170 . T TGTGCAGACTCAG 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33856097 . CT CTGTAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33886304 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33921529 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33921748 . A ATGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33940618 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33953462 . c cACA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33957586 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33957592 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33970415 . G GGGAGT 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 33985959 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34022963 . aa aAGAGa 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34027178 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34037782 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34077189 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34077433 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34120975 . GA GAGGAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34155205 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34263230 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34277429 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34305605 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34336428 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34346099 . T A 3.02 . DP=2;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,27:2:0:0/1:28
- chr10 34385456 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34400305 . C A 3.54 . DP=27;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,14,5,0;MQ=49;PV4=0.00039,0.0001,0.26,0.17 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,250:20:34:0/1:34
- chr10 34405844 . A C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34408745 . A C 93 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 126,30,0:10:0:1/1:99
- chr10 34424917 . C G 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34467671 . AAA AAATAA 9.94 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34476224 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34492722 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34502059 . ct cTTCGt 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34508702 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34510912 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34528178 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34598285 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34603449 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34620220 . C T 99 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,4,1,7;MQ=47;PV4=1,0.069,0.0033,0.44 PL:DP:SP:GT:GQ 166,0,149:13:0:0/1:99
- chr10 34637858 . A ACT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34641925 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34642719 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34648017 . G A 20.1 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=46;PV4=1,0.29,0.059,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,0,42:5:0:0/1:44
- chr10 34648022 . G A 11.3 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.11,0.011,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,56:6:0:0/1:44
- chr10 34666840 . CTGGAAATGGAA CTGGAA 7.35 . INDEL;DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 34685371 . G A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34686175 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34688287 . G A 99 . DP=50;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,1,22,20;MQ=48;PV4=1,0.043,0.043,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,70,0:44:0:1/1:99
- chr10 34795202 . TC TCGCATAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34832501 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34860661 . A C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34881684 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34888960 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34892821 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34892829 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34948451 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34964725 . A G 33 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=47;PV4=1,0.023,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 63,0,80:4:0:0/1:66
- chr10 34973192 . G C 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 34975586 . C A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35020367 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35032751 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35033774 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35075060 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35135850 . t tGGGAGTCGACCAATC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35162419 . T G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35182174 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35211799 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35264234 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35320028 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35321297 . T TCC 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35321414 . C T 99 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,15,7,10;MQ=48;PV4=0.48,1.1e-05,5.1e-11,0.032 PL:DP:SP:GT:GQ 227,0,255:37:3:0/1:99
- chr10 35324076 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35390907 . g gTAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35402077 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35437239 . ATTT ATTTT 78.5 . INDEL;DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,7,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.3 PL:DP:SP:GT:GQ 116,0,46:10:0:0/1:49
- chr10 35447721 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35481270 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35489790 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35490529 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35496669 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35497694 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35500610 . G T 37 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,3,1,5;MQ=47;PV4=1,0.34,0.18,0.02 PL:DP:SP:GT:GQ 67,0,65:10:0:0/1:66
- chr10 35515710 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35524932 . c cTT 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35578862 . TT TTTCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35579757 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35592328 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35599488 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35612605 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35636553 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35640926 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35660812 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35661341 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35672794 . T C 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35679072 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35682167 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35715145 . ac aCTc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35737225 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35741294 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35772402 . G A 33.5 . DP=17;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,4;MQ=49;PV4=0.33,1,0.35,1 PL:DP:SP:GT:GQ 63,2,0:6:0:1/1:37
- chr10 35805284 . A C 43.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 76,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 35805292 . A C 6.79 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 35825055 . T A 25.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 57,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 35841699 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35849787 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35896573 . C G 7.8 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,5,3,2;MQ=49;PV4=1,0.00063,0.0017,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,255:21:0:0/1:40
- chr10 35896957 . G A 47 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,4,3,2;MQ=49;PV4=0.57,0.12,0.0019,0.26 PL:DP:SP:GT:GQ 77,0,141:11:2:0/1:80
- chr10 35916812 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35930156 . C A 13.2 . DP=8;AF1=0.5012;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,4;MQ=48;PV4=1,0.077,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,23:5:0:0/1:26
- chr10 35932534 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35939575 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35949655 . ct cTCATt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35954103 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35961919 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35975741 . G A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 35986246 . AA AAGCTCCCA 5.08 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=49;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,69:3:0:0/1:44
- chr10 36001484 . C CG 4.42 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36004723 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36048239 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36048325 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36061113 . c cTCGGCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36062718 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36090010 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36095237 . GAA GAAGAAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36099878 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36109092 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36161639 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36201619 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36229604 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36237351 . G A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36243380 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36312704 . c cGCTAGTGA 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 36341543 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36362344 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36394201 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36401357 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36435558 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36476779 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36487659 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36487671 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36501855 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36575379 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36576304 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36584592 . at aTCGTGCt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36617356 . a aTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36704557 . C G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36744306 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36774593 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36812362 . C T 26.1 . DP=4;AF1=0.508;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,1;MQ=45;PV4=1,1,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 56,0,15:3:0:0/1:18
- chr10 36844958 . T TATAGGAAAAC 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36873622 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36897766 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36917282 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36932165 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36950857 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 36969325 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37012400 . T C 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37040999 . tgg tGGCGTGgg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37071858 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37076675 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37109440 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37111515 . CA CAGTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37123899 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37129537 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37150017 . GA GAGCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37155429 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37156838 . G C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37193832 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37220931 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37274043 . G A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37293525 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37325174 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37342964 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37344593 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37365872 . ag aGAGg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37383784 . A C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37399312 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37400015 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37400474 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37414826 . G A 4.83 . DP=8;AF1=0.51;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=49;PV4=1,1,0,0.18 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,14:3:0:0/1:17
- chr10 37438777 . G C 13 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 44,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 37455643 . TAAAAA TAAAAAAA 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37508381 . G GTGTAA 3.25 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,1,0;MQ=50;PV4=0.25,1,1,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,114:4:0:0/1:41
- chr10 37537105 . GA GAAA 3.81 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37546319 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37554685 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37554693 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37582979 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37583351 . a aGCTCCTAT 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37631071 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37631894 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37670280 . C A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37721461 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37766047 . G T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37779455 . c cCA 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37787952 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37824960 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37841266 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37890590 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37899950 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37954419 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37989659 . gg gGTATCATTg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37992909 . G GTT 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 37993621 . A C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38024750 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38038459 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38041731 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38042313 . T A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38060527 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38065888 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38108101 . T A 7.8 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,2;MQ=48;PV4=0.33,0,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,41:3:0:0/1:39
- chr10 38109805 . A G 18.1 . DP=4;AF1=0.504;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=49;PV4=1,0.24,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,18:4:0:0/1:21
- chr10 38121983 . A G 7.8 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,11,5,0;MQ=49;PV4=0.00097,0.069,0.46,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,175:17:30:0/1:40
- chr10 38134087 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38140254 . t tCACTCAGAGAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38167867 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38167875 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38172407 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38195174 . t tCC 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38215980 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38232051 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38244388 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38246545 . A G 4.77 . DP=22;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,8,0,3;MQ=49;PV4=1,0.0085,0.0012,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,189:11:0:0/1:36
- chr10 38306228 . T C 14.1 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 46,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 38343260 . G A 78 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,9,0;MQ=48;PV4=1,0.18,0.046,0.36 PL:DP:SP:GT:GQ 108,0,46:12:0:0/1:49
- chr10 38343351 . C G 9.52 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,0,2;MQ=48;PV4=0.33,0.039,0.13,0.088 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,79:4:5:0/1:42
- chr10 38343591 . T C 15.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 47,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 38344124 . C G 48 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,5,2,7;MQ=39;PV4=0.35,0.45,0.00022,1 PL:DP:SP:GT:GQ 78,0,202:19:5:0/1:81
- chr10 38344700 . C G 10.5 . DP=15;AF1=0.5128;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,1;MQ=26;PV4=1,0.33,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,13:3:0:0/1:16
- chr10 38345186 . C CTCAAT 5.08 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.28 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,83:3:0:0/1:44
- chr10 38369770 . ACTCT ACT 99 . INDEL;DP=11;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,8;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 174,0,22:10:0:0/1:25
- chr10 38385574 . T G 8.65 . DP=11;AF1=0.5012;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,5;MQ=49;PV4=1,0.013,0.25,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,23:7:0:0/1:26
- chr10 38385639 . G C 6.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38397536 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38406536 . A AGTC 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38420624 . C A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38421929 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38464723 . T A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38464886 . T C 23 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 55,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 38466941 . A G 5.29 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 35,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 38475579 . T C 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38486447 . G A 6.98 . DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,2,0;MQ=47;PV4=0.33,0.068,0.23,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,41:3:0:0/1:38
- chr10 38498027 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38537070 . A G 26.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 58,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 38561825 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38599101 . CTT CTTT 21.3 . INDEL;DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 60,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 38658853 . A C,T 6.4 . DP=7;AF1=0.5335;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,4,25,13,0,38:4:0:0/1:12
- chr10 38871788 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38897584 . G A 7.59 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 38909099 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38909111 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38934239 . A T 7.81 . DP=5;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,3;MQ=48;PV4=0.25,0.031,1,0.18 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,20:4:0:0/1:23
- chr10 38941010 . ta tAAGTGGGa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38944447 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38978114 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38986462 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 38989987 . T G 15.9 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 47,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 39011138 . G A 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 39119414 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42378441 . G A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42383985 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42384737 . C T 3.41 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=16 PL:DP:SP:GT:GQ 32,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 42389892 . C A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42394484 . T C 5.05 . DP=3;AF1=0.5553;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,1;MQ=30;PV4=1,0.0073,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,7:3:0:0/1:10
- chr10 42396883 . A C 10.5 . DP=18;AF1=0.5101;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,2;MQ=35;PV4=1,0.22,0.15,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,14:4:0:0/1:17
- chr10 42424342 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42443761 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42451586 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42495754 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42495991 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42508370 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42515435 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42515581 . G A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42529727 . t tTCCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42534887 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42621092 . attt at 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42630809 . c cGAGGACTGT 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42668969 . c cAACATTCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42678350 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42742932 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42742936 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42772221 . A G 14.2 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,1,2;MQ=49;PV4=1,0.00097,0.27,0.47 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,76:5:0:0/1:47
- chr10 42780589 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42881308 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42900083 . A T 3.57 . DP=3;AF1=0.5062;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,1;MQ=47;PV4=1,0.11,1,0.46 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,16:3:0:0/1:19
- chr10 42918346 . a aTT 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42949730 . G A 3.06 . DP=7;AF1=0.5099;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=44;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,14:2:0:0/1:17
- chr10 42961699 . G GTACTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42976227 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 42987856 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43011426 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43062089 . t tGGGGC 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43062370 . C CATT 7.46 . INDEL;DP=7;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,12:2:0:0/1:15
- chr10 43068222 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43079863 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43088919 . T G 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,7,12;MQ=39;PV4=0.4,0.00023,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 169,43,0:20:0:1/1:99
- chr10 43089965 . G A 40 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,2;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 72,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 43110771 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43118982 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43140452 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43154505 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43155500 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43159907 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43166888 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43193149 . TC TCCTGACC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43205315 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43209943 . G A 99 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,2,5;MQ=42;PV4=1,1,0.42,0.15 PL:DP:SP:GT:GQ 170,7,0:8:0:1/1:57
- chr10 43209944 . T C 19.1 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,4,1,1;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 49,0,138:8:0:0/1:52
- chr10 43211236 . C G 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43213996 . A C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43227793 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43232105 . A G 3.56 . DP=3;AF1=0.5038;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,0.32,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,18:3:0:0/1:21
- chr10 43240676 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43240686 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43254205 . T A 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43270792 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43280639 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43281009 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43285781 . T A 3.01 . DP=12;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,2,0;MQ=49;PV4=0.33,0.05,0.33,0.33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,34:3:0:0/1:32
- chr10 43285916 . C T 4.13 . DP=2;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,43:2:0:0/1:35
- chr10 43305256 . C T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43312964 . C G 4.84 . DP=5;AF1=0.5127;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,13:2:0:0/1:16
- chr10 43319197 . G A 18.1 . DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,5,8,3;MQ=32;PV4=1,3.5e-11,0.003,0.32 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,255:32:0:0/1:51
- chr10 43324391 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43354252 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43369352 . A G 46.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 78,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 43372868 . A AAGAGT 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43381270 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43386651 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43390965 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43411070 . t tCGGGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43452326 . cc cCCTAc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43460671 . C G 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43465747 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43478601 . tcacatgc tc 9.05 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 46,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43489494 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43500774 . T A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43533359 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43541490 . G T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43560153 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43581361 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43586506 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43590531 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43602118 . T C 3.01 . DP=3;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=47;PV4=1,0.23,0.042,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,79:3:0:0/1:33
- chr10 43604370 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43606687 . A G 99 . DP=56;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,7,16,10;MQ=46;PV4=0.039,0.45,0.0054,0.39 PL:DP:SP:GT:GQ 255,0,74:34:14:0/1:77
- chr10 43609690 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43617515 . T C 12.3 . DP=30;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,14,0,4;MQ=49;PV4=1,0.23,7.3e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,167:18:0:0/1:45
- chr10 43658410 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43671495 . C T 7.19 . DP=7;AF1=0.5335;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,9:3:0:0/1:12
- chr10 43674252 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43686061 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43691691 . C T 76 . DP=27;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,3;MQ=48;PV4=0.46,0.46,0.094,1 PL:DP:SP:GT:GQ 106,0,26:8:3:0/1:29
- chr10 43694363 . C CA 70.5 . INDEL;DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,15,0;MQ=50;PV4=1,1,0.4,1 PL:DP:SP:GT:GQ 111,31,0:16:0:1/1:99
- chr10 43694394 . A C 21 . DP=24;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,7,0;MQ=49;PV4=1,0.034,0.28,0.32 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,129:17:0:0/1:54
- chr10 43696086 . C T 7.59 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 43703904 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43711436 . G T 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43752619 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43753532 . C T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43817396 . ag aGCg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43833850 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43833857 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43839782 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43869097 . C A 38.8 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 70,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 43872550 . G GAGAGGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43875938 . c cTT 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43882160 . G T 4.13 . DP=24;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,4,4,0;MQ=48;PV4=0.076,0.029,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,163:10:11:0/1:35
- chr10 43883342 . T A 43 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,10,0,12;MQ=49;PV4=0.48,3.3e-10,0.005,1 PL:DP:SP:GT:GQ 73,0,249:23:0:0/1:76
- chr10 43904754 . GC GCCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43949736 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43968020 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 43988321 . t tGAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44019949 . C G 22 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 54,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 44019972 . A G 42.1 . DP=7;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,1;MQ=47;PV4=1,1,0.098,0.078 PL:DP:SP:GT:GQ 71,1,0:5:0:1/1:23
- chr10 44052457 . A G 18.1 . DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,16,3,3;MQ=46;PV4=0.29,0.0011,0.0022,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,255:26:5:0/1:51
- chr10 44053408 . A G 3.01 . DP=32;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,6,0;MQ=49;PV4=7.4e-06,0.00019,9.9e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,226:24:51:0/1:33
- chr10 44054256 . T G 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44069453 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44080017 . T A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44080671 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44089268 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44099918 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44100369 . T TCG 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,38:2:0:0/1:40
- chr10 44100941 . A C 4.77 . DP=3;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,0.11,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,41:3:0:0/1:35
- chr10 44101391 . G A 34.2 . DP=10;AF1=0.5207;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,3;MQ=49;PV4=1,0.26,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 64,0,11:5:0:0/1:14
- chr10 44104137 . G T 17.1 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,3,5,0;MQ=48;PV4=0.23,0.083,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 47,0,129:13:6:0/1:50
- chr10 44104568 . A T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44137058 . g gCT 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44159000 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44223273 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44228919 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44236046 . G C 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44239515 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44239873 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44241461 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44274912 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44283455 . C CAT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44295410 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44304643 . G T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44376797 . AC ACAGGACAGGTGC 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44386300 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44390258 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44400139 . A ATAGCTGTCC 7.36 . INDEL;DP=2;AF1=0.501;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,24:2:0:0/1:27
- chr10 44418365 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44421163 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44477505 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44478843 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44501317 . CCG C 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44553371 . C CTTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44561179 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44580917 . T G 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44599243 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44601178 . G T 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44611150 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44611183 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44618473 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44666904 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44676362 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44692139 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44692169 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44692954 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44703344 . c cGGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44735750 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44735806 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44783392 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44813794 . A G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44847630 . t tTCAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44853859 . T C 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44866267 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44895656 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44898983 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44906595 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44906626 . T A 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44934663 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44955009 . TT TTCTTCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 44963983 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45005486 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45039380 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45057369 . ga gACGAa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45082413 . C A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45083749 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45103768 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45119007 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45135599 . A C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45143690 . T A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45157480 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45185736 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45207743 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45249128 . C A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45251803 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45320058 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45321780 . G A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45331944 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45357413 . A T 32.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 64,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 45363773 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45376575 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45380126 . aa aATTAACCa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45386177 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45389704 . T C 43.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 75,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 45391509 . G T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45401177 . C A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45401687 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45423282 . C G 25 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=48;PV4=1,0.064,0.065,1 PL:DP:SP:GT:GQ 55,0,113:7:0:0/1:58
- chr10 45429564 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45430699 . A G 48 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=47;PV4=1,0.0034,0.026,0.36 PL:DP:SP:GT:GQ 78,0,107:7:0:0/1:81
- chr10 45454570 . T TGAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45476265 . G T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45490821 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45496119 . A T 7.5 . DP=23;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,1;MQ=49;PV4=1,1,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,5:3:0:0/1:7
- chr10 45499565 . T C 4.61 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 34,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 45500458 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45517126 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45531309 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45554315 . T A 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45602500 . G A 42.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 74,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 45608933 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45622885 . C T 33.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 65,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 45629683 . G C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45637078 . C T 94.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,3;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 127,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 45637163 . T A 3.01 . DP=3;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,0.017,0.17,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,41:3:0:0/1:33
- chr10 45638239 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45644160 . G GCA 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,37:2:0:0/1:39
- chr10 45644923 . T A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45647012 . A T 17.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 49,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 45649852 . tt tTGt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45665031 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45676536 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45710533 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45731301 . C T 38 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,5,0;MQ=48;PV4=1,0.012,0.049,1 PL:DP:SP:GT:GQ 68,0,133:11:0:0/1:71
- chr10 45737350 . A T 13.6 . DP=5;AF1=0.5554;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.22,0.31 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,7:4:0:0/1:10
- chr10 45772951 . cacaa c 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45787780 . CA CAGTGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45792000 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45792003 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45799378 . CT CCCTT 12.7 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45799379 . TGT TGTAGT 4.42 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45804740 . GCT GCTCACT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45808324 . tg tGAg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45821687 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45879266 . A T 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45879334 . C T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45882860 . GTTTTT GT 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45907569 . CG CGTG 7.35 . INDEL;DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,38:2:0:0/1:40
- chr10 45911521 . g gTTCAGTAC 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45924023 . G A 92.5 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 125,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 45924333 . T C 3.54 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=49;PV4=1,0.33,0.0034,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,67:5:0:0/1:34
- chr10 45935954 . T A 4.13 . DP=27;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,5,0,4;MQ=46;PV4=0.49,0.17,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,150:12:3:0/1:35
- chr10 45935955 . C G 24 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=9,7,0,5;MQ=47;PV4=0.045,0.12,0.0077,0.5 PL:DP:SP:GT:GQ 54,0,255:21:13:0/1:57
- chr10 45941209 . CTG CTGTG 12.7 . INDEL;DP=9;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45956643 . T G 21.1 . DP=9;AF1=0.504;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=48;PV4=1,1,0.23,0.061 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,18:6:0:0/1:21
- chr10 45959845 . G GT 3.25 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45961424 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45964741 . A G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45966681 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45980109 . G GGCCATCT 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45982239 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 45988742 . A ACAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46015159 . t tGTCCGG 9.05 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 46,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46057661 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46076841 . A T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46081072 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46083766 . ACCTCC AC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46090892 . T TGTAGTGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46098391 . G T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46103646 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46113625 . CA CAGGA 5.08 . INDEL;DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,82:3:0:0/1:44
- chr10 46113638 . AT ATCCGAGTCGGT 5.08 . INDEL;DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,38:3:0:0/1:39
- chr10 46113639 . TGA TGAGA 3.8 . INDEL;DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,59:3:0:0/1:42
- chr10 46134054 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46144015 . T A 4.13 . DP=20;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,2,0,4;MQ=48;PV4=0.43,0.32,0.027,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,55:7:0:0/1:35
- chr10 46202388 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46202539 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46217148 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46221477 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46261311 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46315109 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46914737 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46948835 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46956469 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46969458 . G GTAGACCACGTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46971576 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46972162 . ac aCCAGc 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46974426 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46976166 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46993338 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46998346 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46998719 . GTCACTCACT GTCACT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 46998795 . A G 43 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,7,0;MQ=49;PV4=1,2.1e-05,0.093,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 73,0,177:14:0:0/1:76
- chr10 46998894 . G A 99 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,13,0,17;MQ=48;PV4=1,3.8e-16,3.8e-06,0.3 PL:DP:SP:GT:GQ 132,0,221:30:0:0/1:99
- chr10 46999198 . G T 8.64 . DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,1;MQ=49;PV4=1,0.0076,0,0.33 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,41:3:0:0/1:39
- chr10 46999377 . G A,T 21 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 59,15,50,6,0,50:4:0:1/1:63
- chr10 46999382 . G A 3.54 . DP=12;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,4,0;MQ=47;PV4=0.43,1,0.021,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,57:7:0:0/1:34
- chr10 46999465 . A G 6.2 . DP=23;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,4;MQ=49;PV4=1,0.0026,0.00045,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,210:15:0:0/1:38
- chr10 46999577 . G T 6.2 . DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=10,1,1,3;MQ=49;PV4=0.033,3.9e-05,0.011,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,255:15:15:0/1:38
- chr10 46999591 . CATGAGGGAG CATGAGGGAGATGAGGGAG 99 . INDEL;DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,5;MQ=50;PV4=0.44,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 206,11,0:9:0:1/1:66
- chr10 46999604 . A G 7.8 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,3,2;MQ=50;PV4=0.15,0.0019,0.17,0.18 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,164:12:8:0/1:40
- chr10 46999747 . T C 20 . DP=71;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=17,20,1,9;MQ=49;PV4=0.065,3.2e-05,8.5e-11,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,0,255:47:12:0/1:53
- chr10 47000004 . T C 99 . DP=33;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,1,11,8;MQ=47;PV4=1,1,0.13,1 PL:DP:SP:GT:GQ 217,17,0:21:0:1/1:85
- chr10 47005264 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47014681 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47038485 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47056793 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47087474 . C T 18.6 . DP=78;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,6;MQ=49;PV4=1,0.039,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,6:7:0:0/1:8
- chr10 47087501 . C T 99 . DP=71;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=17,17,7,19;MQ=48;PV4=0.11,2.6e-09,5.6e-11,1 PL:DP:SP:GT:GQ 248,0,255:60:10:0/1:99
- chr10 47087608 . T C 99 . DP=44;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=1,1,3,9;MQ=48;PV4=0.51,1,0.096,1 PL:DP:SP:GT:GQ 128,0,2:14:3:0/1:3
- chr10 47087680 . C T 99 . DP=35;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,18;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 255,81,0:27:0:1/1:99
- chr10 47087731 . C T 99 . DP=62;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,34,21;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 255,166,0:55:0:1/1:99
- chr10 47087830 . G A 35.5 . DP=81;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,1,3,3;MQ=50;PV4=1,0.16,0.36,1 PL:DP:SP:GT:GQ 64,0,1:7:0:1/1:5
- chr10 47094419 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47094855 . acacccc ac 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47097816 . c cGGTCTTG 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47119108 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47124144 . T G 63 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,2;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 95,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 47127875 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47130982 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47133818 . G A 12.3 . DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,5,2,4;MQ=22;PV4=1,0.004,0.076,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,81:13:0:0/1:45
- chr10 47141259 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47144848 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47151301 . G T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47162137 . G C 4.13 . DP=11;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,4,3,0;MQ=49;PV4=0.2,0.081,0.032,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,185:10:7:0/1:35
- chr10 47166232 . G A 27 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,1,3,2;MQ=48;PV4=1,0.026,0.099,0.2 PL:DP:SP:GT:GQ 57,0,121:9:0:0/1:60
- chr10 47167115 . G A 15.1 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,1;MQ=48;PV4=1,0.22,1,0.25 PL:DP:SP:GT:GQ 45,0,65:6:0:0/1:48
- chr10 47193197 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47193206 . C CCT 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47533679 . a aTT 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47537768 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47567381 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47589755 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47596044 . TG TGAGAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47610244 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47663830 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47664230 . GA GACTCCTCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47701205 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47703041 . G A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 47728608 . T C 47 . DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,4,3,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 77,0,78:16:0:0/1:77
- chr10 48126719 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48153406 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48190102 . C T 3.54 . DP=2;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=41;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,28:2:0:0/1:29
- chr10 48255408 . G GCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48318048 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48318892 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48319262 . CT CTCTT 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48331324 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48373600 . C A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48384075 . T C 53 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,6;MQ=48;PV4=1,0.0031,0.00077,1 PL:DP:SP:GT:GQ 83,0,171:13:0:0/1:86
- chr10 48386110 . T C 99 . DP=21;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,1,13;MQ=48;PV4=1,4.7e-07,0.00011,1 PL:DP:SP:GT:GQ 144,0,145:20:0:0/1:99
- chr10 48386149 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48388547 . C T 9.52 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.16,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,37:4:0:0/1:38
- chr10 48390890 . G A 28 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,5,0,5;MQ=49;PV4=1,0.0014,0.0048,0.022 PL:DP:SP:GT:GQ 58,0,167:11:0:0/1:61
- chr10 48391278 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48408389 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48414570 . A G 24 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,13,0,6;MQ=49;PV4=1,6.6e-06,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 54,0,227:19:0:0/1:57
- chr10 48420419 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48426091 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48431294 . AG AGTCTGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48431630 . T TGAC 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48454342 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48459939 . T TAGTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48475954 . A G 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48479559 . C T 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48488556 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48499042 . TCT TCTGACT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48511458 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48512018 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48540053 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48560126 . TT TTTAT 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48588530 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48592883 . A C 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 39,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 48651019 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 48651488 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49199692 . AAATC A 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49393736 . T G 4.13 . DP=14;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.096,0.37 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,47:5:0:0/1:35
- chr10 49408308 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49426735 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49450443 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49478882 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49493630 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49537656 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49549436 . aact aACTGACCact 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49552505 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49568296 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49613043 . TT TAAGGAT 9.94 . INDEL;DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49614419 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49632396 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49639932 . ct cTGTGCTCAt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49646005 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49649842 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49654342 . C T 41 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 73,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 49654403 . C T 83 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 116,51,0:17:0:1/1:99
- chr10 49661341 . A G 99 . DP=32;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,7;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 242,87,0:29:0:1/1:99
- chr10 49666348 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49667713 . G A 17.1 . DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 49,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 49667795 . T C 55.1 . DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 88,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 49687085 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49687594 . G A 7.59 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 49720206 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49748830 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49754491 . A T 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 44,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 49760281 . A C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49764654 . G A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49779004 . C CTTCACTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49790972 . C T 31 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=48;PV4=1,0.088,0.016,0.33 PL:DP:SP:GT:GQ 61,0,94:6:0:0/1:64
- chr10 49794358 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49812913 . C A 4.18 . DP=6;AF1=0.51;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,0.33,0.23,0.33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,14:3:0:0/1:17
- chr10 49823925 . C T 7.8 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49828914 . CAC CACGCTTATGGAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49862396 . C G 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49863042 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49871487 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49879482 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49884974 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49893296 . C CGA 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49901001 . C CAGTAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49914313 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49932611 . G C 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49932799 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49942260 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49946785 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49952907 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49960023 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49960282 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49969353 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49971979 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49972309 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 49999675 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50000783 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50008478 . CA CAATTTTGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50024289 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50041563 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50085477 . A G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50095232 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50104844 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50121784 . T C 63 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,2,10,1;MQ=49;PV4=1,7e-12,0.01,1 PL:DP:SP:GT:GQ 93,0,255:25:0:0/1:96
- chr10 50151003 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50170048 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50171908 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50189124 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50191543 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50196258 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50196963 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50221496 . C A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50227785 . T C 46.5 . DP=37;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 79,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 50227927 . C A 33.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 66,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 50262104 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50263483 . A AGTCGCGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50278385 . G T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50292054 . CTT CTTTCCTCGATTT 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50299331 . G GT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50311745 . T C 6.2 . DP=18;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,4,0;MQ=49;PV4=1,0.1,0.00019,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,142:14:0:0/1:38
- chr10 50313012 . ag aGGg 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50313372 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50313567 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50368313 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50391621 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50409807 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50413409 . G A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50418957 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50440197 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50461759 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50463994 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50490333 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50510576 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50527891 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50532869 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50557057 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50559443 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50574798 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50574807 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50576422 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50588349 . A T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50620540 . C A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50634525 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50648909 . A AGTCCTC 5.08 . INDEL;DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=34;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,30:3:0:0/1:33
- chr10 50666784 . A ACTTCTGG 4.46 . INDEL;DP=6;AF1=0.508;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,15:3:0:0/1:18
- chr10 50667544 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50678252 . A T 3.01 . DP=19;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,1,2;MQ=48;PV4=0.067,0.14,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,126:10:12:0/1:33
- chr10 50678317 . C G 81 . DP=83;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,16,3;MQ=49;PV4=0.47,0.001,0.12,1 PL:DP:SP:GT:GQ 111,0,31:22:3:0/1:34
- chr10 50679040 . T G 17.1 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,0,4;MQ=49;PV4=0.0048,0.025,0.03,1 PL:DP:SP:GT:GQ 47,0,149:10:23:0/1:50
- chr10 50679878 . T C 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50691360 . T C 65 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 98,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 50708114 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50712789 . TCTG T 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50717628 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50724016 . C T 5.29 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 35,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 50741083 . A G 49.3 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 82,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 50743577 . C A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50762600 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50792515 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50810610 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50820345 . C A 99 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,9,4;MQ=48;PV4=0.36,0.15,0.22,1 PL:DP:SP:GT:GQ 152,14,0:14:0:1/1:70
- chr10 50828506 . G A 15.3 . DP=14;AF1=0.5207;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,0;MQ=47;PV4=1,0.16,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 45,0,11:5:0:0/1:14
- chr10 50838972 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50841099 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50852223 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50856120 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50856652 . G A 54.5 . DP=10;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,5;MQ=47;PV4=1,1,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 84,2,0:6:0:1/1:37
- chr10 50856659 . TCTG T 7.42 . INDEL;DP=8;AF1=0.5101;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,14:2:0:0/1:17
- chr10 50857973 . GG GGTTACATTTTTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50863051 . A C 49 . DP=14;AF1=0.5032;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,6,0;MQ=47;PV4=1,1,0.023,0.23 PL:DP:SP:GT:GQ 79,0,19:8:0:0/1:22
- chr10 50863147 . T C 95 . DP=46;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 128,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 50863565 . C T 26 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=48;PV4=1,0.067,0.3,0.29 PL:DP:SP:GT:GQ 56,0,38:4:0:0/1:41
- chr10 50870751 . A G 18.1 . DP=44;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,2,0,8;MQ=49;PV4=9.2e-05,0.00029,7.3e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,252:23:40:0/1:51
- chr10 50890496 . g gATCGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50901809 . T G 52 . DP=29;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=1,0,0,8;MQ=48;PV4=0.11,0.36,0.17,1 PL:DP:SP:GT:GQ 82,3,0:9:0:1/1:41
- chr10 50902684 . C T 99 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,30;MQ=46;PV4=1,1,0.088,1 PL:DP:SP:GT:GQ 187,77,0:31:0:1/1:99
- chr10 50909290 . G A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50916484 . A G 54.1 . DP=68;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,1,19,0;MQ=49;PV4=0.095,0.31,0.19,1 PL:DP:SP:GT:GQ 87,19,0:21:0:1/1:76
- chr10 50916542 . C T 68.8 . DP=57;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,2,8;MQ=49;PV4=1,0.23,0.31,1 PL:DP:SP:GT:GQ 101,10,0:11:0:1/1:60
- chr10 50921374 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50936620 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50944009 . T C 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 182,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 50947918 . A G 35.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 68,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 50955061 . CC CCCCCGC 7.46 . INDEL;DP=17;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,12:2:0:0/1:15
- chr10 50971535 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 50980097 . T A,G 16.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 59,17,47,11,0,47:3:0:1/1:49
- chr10 50991686 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51011952 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51023268 . TG TGTGG 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,25:2:0:0/1:28
- chr10 51052856 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51059525 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51118047 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51362108 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51374389 . G C 6.2 . DP=5;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,1,1;MQ=48;PV4=0.4,0.045,0.12,0.39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,99:5:0:0/1:38
- chr10 51378214 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51381775 . T G 16.1 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,3,0;MQ=47;PV4=0.4,0.19,0.11,0.077 PL:DP:SP:GT:GQ 46,0,46:5:0:0/1:46
- chr10 51383614 . G C 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 51384373 . A G 13.2 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51384388 . GTTAA GTTAACTTAA 4.42 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51384392 . AAG AAGGCCAG 7.35 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 51388556 . T TAC 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51396109 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51503381 . T TACC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51511273 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51515620 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51532367 . A G 38 . DP=21;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,6,1,6;MQ=35;PV4=0.34,8.9e-05,0.0047,0.32 PL:DP:SP:GT:GQ 68,0,219:17:5:0/1:71
- chr10 51549496 . T C 55 . DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=9,0,10,0;MQ=48;PV4=1,1.2e-07,8.1e-16,1 PL:DP:SP:GT:GQ 85,0,196:19:0:0/1:88
- chr10 51549545 . G T 97 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 130,39,0:13:0:1/1:99
- chr10 51563835 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51583018 . CATT C 54.5 . INDEL;DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=50;PV4=1,0.00031,0.1,0.33 PL:DP:SP:GT:GQ 92,0,189:11:0:0/1:95
- chr10 51610365 . TT TTGT 12.7 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51610507 . C T 3.54 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,0.046,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,41:3:0:0/1:34
- chr10 51613231 . T C 7.8 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,1,1;MQ=48;PV4=1,0.16,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,66:4:0:0/1:40
- chr10 51620350 . T C 4.13 . DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,0,2;MQ=48;PV4=0.33,0.05,0.092,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,72:4:5:0/1:35
- chr10 51629295 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51644038 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51650246 . G A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51676639 . aa aAATCGTGTa 9.05 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 46,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51677212 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51679838 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51682365 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51685245 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51738537 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 51768674 . CAAA CA 15.6 . INDEL;DP=5;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=2,0,1,2;MQ=32;PV4=0.4,0.15,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 52,0,3:5:4:0/1:5
- chr10 51786463 . G A 6.02 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 51787710 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52005242 . C CTCCTTT 3.25 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.22 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,107:4:0:0/1:41
- chr10 52007620 . a aGTACAGT 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52031581 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52067059 . ATCT AT 4.42 . INDEL;DP=24;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,4,3,0;MQ=50;PV4=0.24,1,1,0.4 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,132:11:6:0/1:43
- chr10 52067074 . T G 26 . DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,1,0,6;MQ=46;PV4=0.033,0.025,0.17,0.46 PL:DP:SP:GT:GQ 56,0,72:10:15:0/1:59
- chr10 52067075 . T G 20 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,6,0,5;MQ=47;PV4=0.23,0.19,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,0,174:15:6:0/1:53
- chr10 52072803 . T G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52076422 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52091852 . a aGAAGTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52121065 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52142114 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52146509 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52157658 . A ACTAGGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52210039 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52213868 . G C 5.47 . DP=2;AF1=0.5007;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,25:2:0:0/1:27
- chr10 52267179 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52274303 . C A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52276837 . A AATT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52314980 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52326199 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52346890 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52364905 . C CT 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52385653 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52390407 . G C 11.3 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=48;PV4=1,0.38,0.16,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,93:6:0:0/1:44
- chr10 52390836 . A G 65.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,4;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 98,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 52400608 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52411197 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52419433 . G C,T 3.41 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 42,16,31,10,0,31:3:0:1/1:49
- chr10 52438942 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52486716 . G GGCC 3.25 . INDEL;DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.34 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,80:4:0:0/1:41
- chr10 52486792 . G A 36 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,2,1;MQ=48;PV4=1,0.06,0.068,1 PL:DP:SP:GT:GQ 66,0,73:5:0:0/1:68
- chr10 52502787 . tgtgcgtgcgtgcgtgcgtg tgtgcgtgcgtgcgtg 5.08 . INDEL;DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,5;MQ=32;PV4=1,1,0.048,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,94:11:0:0/1:44
- chr10 52505273 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52506074 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52553649 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52566594 . G C 99 . DP=73;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=17,25,15,13;MQ=48;PV4=0.33,1.4e-14,5.7e-16,1 PL:DP:SP:GT:GQ 253,0,255:70:5:0/1:99
- chr10 52576068 . G A 97 . DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,31;MQ=48;PV4=1,1,0.19,1 PL:DP:SP:GT:GQ 130,79,0:32:0:1/1:99
- chr10 52593210 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52604764 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52619758 . T A 3.55 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=47;PV4=1,1,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,26:4:0:0/1:28
- chr10 52620815 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52638515 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52646304 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52646978 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52650361 . A AAATTTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52669948 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52674322 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52684875 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52691160 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52775286 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52805500 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52861101 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52887108 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52891444 . A ATCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52902274 . g gCTGACC 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52911674 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52932813 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 52969600 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53063556 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53068694 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53088211 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53143038 . G C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53156863 . t tAAATTAAC 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53171754 . C CGG 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53182209 . CCT CCTAAACT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53206469 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53206474 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53227627 . T G 3.98 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 33,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 53279059 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53297488 . a aTCACTCGACTCACTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53308080 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53343623 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53360727 . G T 5.46 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53398853 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53408380 . C CCGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53417659 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53417886 . C T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53422219 . TG TGATCCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53438703 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53457421 . A G 3.01 . DP=21;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=49;PV4=1,0.25,0.037,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,65:5:0:0/1:33
- chr10 53462957 . aata aATata 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53492814 . T G 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53593551 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53620305 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53629139 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53662270 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53666283 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53699869 . C A 10.4 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53719492 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53739361 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53753112 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53758793 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53764987 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53767895 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53770946 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53816889 . G C 5.46 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53817077 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53819444 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53886171 . t tTCCTGAAAC 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53895379 . A ACTGTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53903748 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53910290 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53910309 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 53965920 . A T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54021363 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54032269 . A G 32 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,8,0,11;MQ=50;PV4=1,3.6e-16,0.18,1 PL:DP:SP:GT:GQ 62,0,189:19:0:0/1:65
- chr10 54041759 . T TAACAACAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54060043 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54069505 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54148888 . C A 47 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 80,33,0:11:0:1/1:99
- chr10 54171074 . AC ACCC 6.55 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,40:2:0:0/1:41
- chr10 54198253 . C T 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54198907 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54221969 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54240122 . caa cAAAaa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54258423 . tct tCTCATACct 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54262016 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54278577 . a aGG 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54330007 . GTTTTT GTTTTTTT 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54351043 . G A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54359378 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54380104 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54380375 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54389841 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54435325 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54458439 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54463840 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54474588 . T C 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54480153 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54512618 . TGCAGTC T 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54513379 . ta tAGTGa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54528266 . G C 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,2;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 190,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 54528298 . G C 96 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 129,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 54528353 . C G 69.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 102,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 54530636 . A G 10.2 . DP=13;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=49;PV4=1,1,0.24,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,4:4:0:0/1:6
- chr10 54548708 . T C 9.53 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54578598 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54596759 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54654033 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54666460 . G T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54674396 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54677033 . A AGT 3.25 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54677683 . G A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54683843 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54714977 . tgaa tGAATAgaa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54826592 . T TCCGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54866275 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54869796 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54880850 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54885272 . C CGAGCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54885341 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54885350 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54920991 . T TCGTAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54927684 . AGT AGTCTTGT 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54938997 . C T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54955102 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 54966229 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55003777 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55007597 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55011177 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55012422 . tga tGAGTTCTGga 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55020162 . G A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55062508 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55104797 . c cTATA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55122639 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55150676 . tgtggt tgt 5.8 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55242189 . ta tACa 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55303712 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55343940 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55389450 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 55403276 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55411325 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55425031 . aat aATCCTat 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55436299 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55447073 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55481535 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55506732 . a aGAAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55539078 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55568880 . C G 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 55582905 . G T 55.1 . DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,5;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 88,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 55617054 . T C 35 . DP=21;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,6;MQ=49;PV4=1,0.19,0.097,1 PL:DP:SP:GT:GQ 65,0,22:8:0:0/1:25
- chr10 55643054 . CA CAATATGGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55719652 . C T 56 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 89,27,0:9:0:1/1:99
- chr10 55720489 . G GATCTGAAGACTGTA 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55721679 . T G 13 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 44,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 55757997 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55779909 . G C 35 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,8,0;MQ=49;PV4=1,0.0018,0.047,0.41 PL:DP:SP:GT:GQ 65,0,106:15:0:0/1:68
- chr10 55782196 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55782991 . C T 42 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=49;PV4=1,7.3e-05,0.023,0.49 PL:DP:SP:GT:GQ 72,0,132:9:0:0/1:75
- chr10 55893518 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55911601 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55924765 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55938318 . A ACAGAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55955444 . T G 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 220,54,0:18:0:1/1:99
- chr10 55980073 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 55990923 . T C 6.98 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56026915 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56029516 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56038509 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56045466 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56047358 . T TCA 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56050369 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56094727 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56094737 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56100959 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56129066 . A G 43 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=48;PV4=1,0.093,0.027,0.23 PL:DP:SP:GT:GQ 73,0,97:9:0:0/1:76
- chr10 56141189 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56171592 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56188435 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56188485 . A C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56219670 . TT TTACATAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56244889 . AT ATTGTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56248862 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56271612 . AA AATGGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56287569 . T C 80 . DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,1,5,2;MQ=48;PV4=1,0.047,0.00093,0.35 PL:DP:SP:GT:GQ 110,0,153:14:0:0/1:99
- chr10 56287689 . A C 16.1 . DP=14;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 48,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 56300684 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56301556 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56310053 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56374517 . C T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56399546 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56403219 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56437620 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56437633 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56444029 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56472510 . T A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56473789 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56510130 . TT TTTCAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56538467 . C A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56541456 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56628184 . T C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56693376 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56702663 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56767962 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56770523 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56807321 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56840259 . G A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56847051 . T TTAG 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56848425 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56903981 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56963272 . g gCC 9.05 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 46,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56972063 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56983342 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 56984145 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57018227 . A G 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57044209 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57050326 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57093281 . G T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57104106 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57164947 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57164954 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57206158 . G T,C 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 46,18,31,15,0,31:2:0:1/1:41
- chr10 57206560 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57224742 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57273633 . A ACCGGTGTGG 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57283077 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57283095 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57345114 . A AGCGAGAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57427218 . C CAAACGTTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57427259 . A C 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57433589 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57437377 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57450039 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57514504 . G T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57587744 . C A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57618044 . C A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57638703 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57768431 . GCT G 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57785494 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57798043 . cagaga caga 9.05 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 46,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57828560 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57834675 . AA AAATCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57836769 . G A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57884344 . tc tCTGCTAGCGTCc 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57962283 . T G 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 57986270 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58002958 . t tGTCTAGG 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58047027 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58056289 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58118458 . A C 7.8 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,1,0,5;MQ=49;PV4=0.00039,0.006,0.012,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,238:20:34:0/1:40
- chr10 58118630 . T C 6.33 . DP=48;AF1=0.5206;CI95=0.5,1;DP4=0,1,2,1;MQ=50;PV4=1,0.021,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,11:4:0:0/1:14
- chr10 58119976 . G A 49.1 . DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,5;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 82,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 58120988 . C A 55 . DP=40;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,23,1,7;MQ=48;PV4=1,4e-06,2.6e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 85,0,255:36:0:0/1:88
- chr10 58137797 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58152746 . T C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58190497 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58237045 . TT TTCAGTCCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58289254 . t tGG 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58296043 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58316378 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58362159 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58381243 . G T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58425293 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58428951 . g gAGACTGA 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58458475 . C CGTCCAGGGTTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58511227 . C A 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58514798 . TCtct TCTCTACtct 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58606573 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58606768 . t tTATA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58667494 . a aTC 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58682099 . CCTTTA C 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58684651 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58688414 . gg gGTGTAACg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58711866 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58716548 . A G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58719064 . C G 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58757911 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58775391 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58784593 . A C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58784692 . t tGGCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58805037 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58873812 . CTACTTGG C 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58895439 . c cAGGGCCGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58897984 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58955004 . CTAACT C 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58961153 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58963872 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 58996140 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59015063 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59027763 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59066266 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59104155 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59113519 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59138064 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59150702 . CT CTGAAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59176615 . T G 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59222037 . C T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59225619 . C A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59241230 . A AGAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59272498 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59276578 . ag aGCg 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59348187 . a aCTTGCTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59350671 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59384292 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59409575 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59434994 . A AACTCATACC 9.05 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 46,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59441447 . A T 4.8 . DP=3;AF1=0.5062;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,0.26,0.23,0.44 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,16:3:0:0/1:19
- chr10 59496132 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59499258 . C G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59511633 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59523527 . G A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59533993 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59535213 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59595571 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59617927 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59652840 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59675969 . G GAGGCCGAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59680886 . g gAGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59750203 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59767938 . CA CAGAGTGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59845324 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59873087 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59875795 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59948078 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59951636 . G C 7.8 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59956043 . T TATG 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59958956 . C A 14.2 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=49;PV4=1,0.021,0.092,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,99:6:0:0/1:47
- chr10 59965761 . A G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59980002 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 59984326 . A C 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 59999546 . G T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60027213 . C G 17.1 . DP=9;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,3;MQ=46;PV4=0.25,0.026,0.1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 47,0,32:4:0:0/1:35
- chr10 60036815 . A G 55 . DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,7,0;MQ=49;PV4=1,2.6e-05,0.061,1 PL:DP:SP:GT:GQ 85,0,147:12:0:0/1:88
- chr10 60036961 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60063738 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60080219 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60091347 . CCT CCTCT 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60124520 . T G 7.85 . DP=6;AF1=0.508;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=44;PV4=1,1,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,15:3:0:0/1:18
- chr10 60124530 . G C 5.46 . DP=9;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=47;PV4=1,0.013,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,131:6:0:0/1:37
- chr10 60127793 . T G 6.02 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 60128470 . G A 7.59 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 60128474 . C G 22 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,1;MQ=49;PV4=1,0.25,0.07,0.069 PL:DP:SP:GT:GQ 52,0,67:6:0:0/1:55
- chr10 60141943 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60146076 . C T 6.98 . DP=11;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=47;PV4=1,0.087,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,31:3:0:0/1:33
- chr10 60146081 . T A,G 5.29 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 45,16,34,10,0,34:3:0:1/1:49
- chr10 60148606 . TT TCTCTTGGT 5.09 . INDEL;DP=9;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,20:3:0:0/1:23
- chr10 60206169 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60206264 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60235696 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60237878 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60273189 . ACGGCCGGCCGG ACGGCCGG 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60310156 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60322917 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60338911 . G A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60383162 . ACT ACTTCT 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60397511 . A G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60410887 . g gTCAAGTGCGGGCGGA 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60423915 . G T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60425966 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60515252 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60521389 . GT GTGTCTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60542330 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60559910 . A G 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 37,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 60562252 . AC ACTC 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60563062 . G C 22 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,6;MQ=50;PV4=1,4.6e-13,1,0.38 PL:DP:SP:GT:GQ 52,0,102:9:0:0/1:55
- chr10 60612887 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60642629 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60650515 . T A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60673194 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60692494 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60718566 . CT CTCAATTTCTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60729663 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60767341 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60797364 . G T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60818478 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60837797 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60839743 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60840745 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60848772 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60848788 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60873443 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60883204 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60897975 . CA CAAA 5.08 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.23 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,77:3:0:0/1:44
- chr10 60905529 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60920725 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60937151 . AA AAGA 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60985996 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60987012 . C A 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 60996453 . G A 69 . DP=24;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=49;PV4=1,1,0.2,1 PL:DP:SP:GT:GQ 102,25,0:14:0:1/1:99
- chr10 60996454 . T C 44 . DP=24;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,6;MQ=48;PV4=1,0.21,0.0063,0.24 PL:DP:SP:GT:GQ 74,0,111:13:0:0/1:77
- chr10 61005244 . G C 99 . DP=40;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,5,22;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 230,81,0:27:0:1/1:99
- chr10 61011286 . C T 3.54 . DP=3;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=48;PV4=1,0.38,0,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,71:3:0:0/1:34
- chr10 61047529 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61062538 . T C 51 . DP=21;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=9,0,10,0;MQ=49;PV4=1,6.4e-06,0.081,1 PL:DP:SP:GT:GQ 81,0,190:19:0:0/1:84
- chr10 61075720 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61079827 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61083689 . CAG CAGTTAG 38.7 . INDEL;DP=28;AF1=0.5263;CI95=0.5,1;DP4=3,0,17,0;MQ=50;PV4=1,0.0041,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 76,0,10:20:0:0/1:13
- chr10 61083690 . AG AGTTGG 99 . INDEL;DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,19,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 235,0,37:23:0:0/1:40
- chr10 61114221 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61122268 . TG TTAG,TGTTAG 99 . INDEL;DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 242,47,204,23,0,201:9:0:1/1:96
- chr10 61135422 . aag aAGGag 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61147791 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61149934 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61150029 . a aGGGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61211853 . C G 6.98 . DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=41;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,34:2:0:0/1:35
- chr10 61267873 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61274360 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61304196 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61311416 . TAAA TAA 46.5 . INDEL;DP=5;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,3;MQ=50;PV4=0.4,0.18,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 84,0,16:5:0:0/1:19
- chr10 61317423 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61321730 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61323292 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61323303 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61346065 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61363799 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61388421 . G A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61395859 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61400896 . C A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61419418 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61424464 . TGT TGTGAGGCAGGGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61438266 . T TCCCGAAAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61443790 . CATGAT C 31.5 . INDEL;DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,9,0;MQ=50;PV4=1,4.1e-13,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 69,0,130:15:0:0/1:72
- chr10 61443791 . ATGATGT AT 99 . INDEL;DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,5,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 150,0,145:12:0:0/1:99
- chr10 61445020 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61460488 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61485881 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61552774 . C T 65.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 98,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 61552878 . G A 4.77 . DP=16;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,3;MQ=50;PV4=1,0.0038,0.34,0.25 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,31:5:0:0/1:32
- chr10 61554656 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61559913 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61563994 . GCATTT G 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61605201 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61615695 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61626698 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61635204 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61665886 . C A 7.59 . DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 61669558 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61695487 . G T 3.54 . DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,32:2:0:0/1:31
- chr10 61703035 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61717196 . tt tTGAt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61729814 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61745781 . CT CTAGCTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61769643 . T A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61802577 . TCC TCCC 99 . INDEL;DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 187,39,0:13:0:1/1:99
- chr10 61803480 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61808999 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61815335 . C A,G 58.1 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 91,21,83,0,4,83:8:0:1/1:84
- chr10 61815817 . T G 21 . DP=14;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=49;PV4=1,1,0.0035,0.4 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,35:7:0:0/1:38
- chr10 61819049 . T G 99 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 149,51,0:17:0:1/1:99
- chr10 61833499 . G A 81 . DP=14;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,1,5;MQ=46;PV4=1,0.47,0.095,0.37 PL:DP:SP:GT:GQ 111,0,31:8:0:0/1:34
- chr10 61851446 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61868628 . T C 5.46 . DP=25;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,14,5,0;MQ=48;PV4=0.00039,6.8e-05,0.00061,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,251:20:34:0/1:37
- chr10 61873922 . T TCAGCC 7.38 . INDEL;DP=3;AF1=0.504;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,18:2:0:0/1:21
- chr10 61881050 . G T 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61932651 . C A 3.54 . DP=15;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=7,2,4,0;MQ=50;PV4=1,0.039,0.0093,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,211:13:0:0/1:34
- chr10 61932898 . T A 26 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,1,0,6;MQ=49;PV4=0.015,0.006,0.0006,1 PL:DP:SP:GT:GQ 56,0,145:12:18:0/1:59
- chr10 61954728 . G GGTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61981768 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61983598 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61984464 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 61987179 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62023124 . A G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62075856 . T TCCAGGACCGA 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62134348 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62149298 . A T 22 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,6,0,6;MQ=48;PV4=1,0.24,0.13,0.43 PL:DP:SP:GT:GQ 52,0,114:13:0:0/1:55
- chr10 62161615 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62170502 . G T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62191056 . ca cAAAa 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62213555 . TGT TGTCGGCGGGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62253950 . A T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62270896 . A G 58.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,3;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 91,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 62292865 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62293910 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62354614 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62371485 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62409299 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62432727 . G GCAGAAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62444260 . G C 4.77 . DP=14;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,2,0;MQ=49;PV4=1,0.14,0.019,0.34 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,69:4:0:0/1:36
- chr10 62511198 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62515649 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62536309 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62538789 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62544394 . a aCACCCTTG 9.94 . INDEL;DP=4;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62547446 . AAGATAGA AAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62548056 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62551888 . T C 4 . DP=7;AF1=0.6241;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,1,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,4:3:0:0/1:6
- chr10 62552102 . C G 4.77 . DP=8;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=46;PV4=1,0.049,0.29,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,60:4:0:0/1:36
- chr10 62552869 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62553763 . A G 86 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 119,30,0:10:0:1/1:99
- chr10 62567662 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62586976 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62606133 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62634029 . T TCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62677221 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62701621 . AA AACA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62760031 . T TCTCTCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62789037 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62794334 . gccttcc gcc 3.25 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,2,1,0;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,50:4:0:0/1:41
- chr10 62818299 . G C 41.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 73,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 62847818 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62860480 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62895703 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 62918436 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63001707 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63031689 . a aCC 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63045200 . T TAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63061873 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63104320 . ac aCCCc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63106386 . G C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63146297 . T C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63173823 . AG AGCCCACTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63182262 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63221288 . ACC ACCCC 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63235284 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63246872 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63284095 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63306445 . C T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63309218 . G C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63348139 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63379518 . A G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63403314 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63415052 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63426338 . G GACTCTCTGAGA 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63457041 . C G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63460739 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63463451 . G GTACGCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63468360 . A C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63495819 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63508178 . T TCTATTTAAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63512959 . t tGAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63513726 . GG GGTACACCTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63518225 . GA GAACTCTCTTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63520528 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63528952 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63549264 . CAAA C 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63565787 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63574929 . A T 12 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 63591106 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63593843 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63614031 . A G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63621976 . T C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63650113 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63652467 . g gTAACACGGAACGGA 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63658357 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63675210 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63692739 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63701990 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63703080 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63713158 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63730615 . TT TTCTCTTTGGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63806507 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63821073 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63824104 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63835020 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63835599 . G T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63848271 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63889416 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63890261 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63907527 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63958112 . T C 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,14;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 175,45,0:15:0:1/1:99
- chr10 63977069 . A T 10.2 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 41,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 63990895 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 63995983 . C T 94.8 . DP=15;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,2,9;MQ=48;PV4=1,0.27,0.22,1 PL:DP:SP:GT:GQ 127,10,0:12:0:1/1:60
- chr10 64005711 . C T 81.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 114,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 64010721 . t tAG 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64034519 . A AAAGGACCTCATTTC 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64038421 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64051164 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64052520 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64066395 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64117528 . t tAAGAAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64135376 . T TGCAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64159333 . G T 47.3 . DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 80,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 64167301 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64174449 . C T 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 64193764 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64225887 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64226970 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64269296 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64299711 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64342059 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64345501 . C CGGAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64375627 . G T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64377746 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64414787 . a aAG 5.08 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.38 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,83:3:0:0/1:44
- chr10 64415184 . A G 99 . DP=46;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,32,11;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 248,129,0:43:0:1/1:99
- chr10 64480121 . cca cCAATca 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64482642 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64484231 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64501053 . G A 3.54 . DP=4;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,1,0;MQ=48;PV4=1,1,0,0.42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,109:4:0:0/1:34
- chr10 64508091 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64522357 . C T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64573771 . C T 99 . DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,23;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 233,69,0:23:0:1/1:99
- chr10 64604771 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64624449 . G T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64637923 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64638789 . T TCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64651962 . T TAG 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64698607 . G GTCACTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64717309 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64717776 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64762268 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64779563 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64783988 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64793933 . a aAGGGTCAACC 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64797593 . A T 5.29 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 64802638 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64826075 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64833216 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64835044 . GT GTGCGGGGAT 3.81 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64835759 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64851043 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64927247 . C T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64927823 . C G 64.2 . DP=33;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,6,1;MQ=49;PV4=1,1,0.38,1 PL:DP:SP:GT:GQ 96,8,0:8:0:1/1:56
- chr10 64931548 . T TACGGTGCCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64953311 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64956072 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64960105 . A AGTAGGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64967445 . A T 99 . DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,17;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 246,120,0:40:0:1/1:99
- chr10 64969044 . A G 6.2 . DP=21;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,7;MQ=49;PV4=1,0.099,0.11,0.035 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,52:10:0:0/1:38
- chr10 64971149 . c cAAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64974537 . A T 45 . DP=58;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,7;MQ=49;PV4=0.22,0.16,0.29,1 PL:DP:SP:GT:GQ 75,3,0:9:0:1/1:41
- chr10 64974805 . GTCT GTCTCT 9.94 . INDEL;DP=5;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64974806 . TC TCGGC 12.7 . INDEL;DP=5;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 64977091 . C G 20 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,1,5;MQ=48;PV4=1,0.0063,0.19,1 PL:DP:SP:GT:GQ 50,0,121:11:0:0/1:53
- chr10 64977098 . A C 4.18 . DP=9;AF1=0.51;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=47;PV4=1,0.33,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,14:3:0:0/1:17
- chr10 65064511 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65091664 . G T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65119723 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65157847 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65164985 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65177349 . A ATCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65187315 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65187461 . C G,T 35 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 75,17,64,8,0,64:4:0:1/1:63
- chr10 65190093 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65191254 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65202282 . T TCCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65261533 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65268615 . C A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65271683 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65278034 . ac aCAGGAAAATc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65306223 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65314995 . C CGCTACT 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65394230 . A G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65394396 . T G 3.01 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=45;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,41:2:0:0/1:33
- chr10 65444395 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65447674 . A G 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65464957 . T TCTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65480670 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65484481 . ACAAGCATT A 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65487533 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65503789 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65590005 . T TTCGCCCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65635400 . g gGTTCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65656518 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65658505 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65669796 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65713058 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65729539 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65729549 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65731897 . a aCCCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65759820 . T G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65763161 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65765061 . C T 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65765096 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65800840 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65825190 . C T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65826980 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65878025 . A G 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 47,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 65920042 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65934710 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65960343 . CA CAGTGGA 9.15 . INDEL;DP=2;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 45,1,0:2:0:1/1:23
- chr10 65991890 . G T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65994891 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65996463 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65998090 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 65998100 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66004970 . ca cAAAa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66014438 . G GCGCGGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66025205 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66029334 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66029353 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66052641 . T G 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66067759 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66072643 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66074579 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66092599 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66258165 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66301546 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66403693 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66403980 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66404486 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66420848 . ac aCGAGc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66446804 . A G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66476178 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66497599 . A C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66513270 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66538896 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66591190 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66600609 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66618363 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66660428 . G C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66702852 . A AGGGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66726629 . G T 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66783222 . G C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66802731 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66897772 . attttttt att 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66904314 . G A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66929672 . tt tTCt 7.35 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,40:2:0:0/1:42
- chr10 66956997 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66961970 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66978656 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 66994350 . G T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67050070 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67058950 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67070954 . T C 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67076213 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67156490 . TT TTTCTCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67182544 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67200445 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67233312 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67366586 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67374890 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67377968 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67423164 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67537692 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67560481 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67566065 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67604139 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67605319 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67610034 . G A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67617331 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67640537 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67651762 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67653918 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67664435 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67664612 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67727695 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67739454 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67745735 . C G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67750467 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67751746 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67752355 . t tATTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67859075 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67935751 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67989635 . c cGG 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 67999488 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68067183 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68075387 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68084447 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68084455 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68096587 . t tTCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68160724 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68170100 . T TCAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68172583 . AAAACTTGAAA AAAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68238185 . tg tGCCAAAGg 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68259363 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68307459 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68362003 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68431757 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68467846 . C CTGTCCCCGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68476376 . C T 8.65 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68495199 . tt tTGCGAAGt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68499571 . T A 3.02 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68512804 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68524803 . GA GACACCCCCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68532371 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68539531 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68615212 . A ACCGTGTCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68653396 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68686432 . T C 26 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 58,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 68688238 . C G 12.3 . DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,10,0,4;MQ=48;PV4=1,0.1,0.0067,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,161:14:0:0/1:45
- chr10 68688243 . A C 11.3 . DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=46;PV4=1,0.41,0.074,0.47 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,48:6:0:0/1:43
- chr10 68720242 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68748599 . CT CTACGTGCTTT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68791118 . C A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68811077 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68852676 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68857397 . T G 99 . DP=60;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=15,15,13,12;MQ=49;PV4=1,1.6e-18,5.1e-07,1 PL:DP:SP:GT:GQ 224,0,255:55:0:0/1:99
- chr10 68902063 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68931758 . C A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68941282 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 68984539 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69024876 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69040036 . a aCATGCCTGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69099870 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69111677 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69115122 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69120787 . aa aAACTa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69127383 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69141513 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69163946 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69186601 . TG TGAG 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69216224 . AAATAT A 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69258113 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69258118 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69281495 . C G 4.61 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 34,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 69299371 . T C 3.54 . DP=21;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=9,2,0,4;MQ=49;PV4=0.011,0.036,0.0093,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,217:15:20:0/1:34
- chr10 69319559 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69389493 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69407167 . T G 4.13 . DP=15;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,3,0;MQ=49;PV4=1,0.063,0.37,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,147:10:0:0/1:35
- chr10 69407327 . A G 4.77 . DP=11;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=49;PV4=1,0.11,0.48,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,91:7:0:0/1:36
- chr10 69467603 . C A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69510918 . CA CAA 3.25 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69528983 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69529858 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69565429 . CTCTTTCTTTCTTTCT CTCTTTCTTTCT 7.35 . INDEL;DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 69575814 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69583206 . G A 6.23 . DP=5;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=50;PV4=1,0.029,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,17:4:0:0/1:20
- chr10 69621932 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69627866 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69665828 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69672671 . T C 18.1 . DP=32;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,4,0,6;MQ=49;PV4=0.035,0.016,0.094,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,227:17:15:0/1:51
- chr10 69773841 . G A 8.76 . DP=24;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=49;PV4=1,0.27,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,12:4:0:0/1:15
- chr10 69778327 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69808543 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69831080 . A G 14.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69837577 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69855133 . AT ATAGCGGGGCCCT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69863007 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69881212 . T C 47 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,3,7,0;MQ=48;PV4=0.07,0.11,0.0045,1 PL:DP:SP:GT:GQ 77,0,123:13:12:0/1:80
- chr10 69881217 . G A 3.01 . DP=26;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=4,1,2,0;MQ=48;PV4=1,0.47,1.5e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,95:7:0:0/1:33
- chr10 69910184 . CT CTCCAGTGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69926660 . g gAC 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 69934467 . A G 32.1 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 65,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 69935235 . T C 39.5 . DP=30;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,3;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 72,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 69948844 . T C 15.6 . DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 48,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 69955148 . TA TACTGTGGCA 7.46 . INDEL;DP=4;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,12:2:0:0/1:15
- chr10 69969986 . C T 99 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,19,0;MQ=47;PV4=1,1,0.19,1 PL:DP:SP:GT:GQ 155,43,0:20:0:1/1:99
- chr10 70028791 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70035805 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70045069 . GCA GCATCA 7.35 . INDEL;DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 70045197 . TCCCC TCCC 7.15 . INDEL;DP=14;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 70051928 . A G 99 . DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,9,5,8;MQ=48;PV4=0.31,0.013,5.8e-34,1 PL:DP:SP:GT:GQ 251,0,255:35:5:0/1:99
- chr10 70056620 . aa aAGAATGTGTa 12.7 . INDEL;DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70075667 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70093223 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70108057 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70108061 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70123804 . T C 25 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,2,7,0;MQ=49;PV4=0.47,0.14,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 55,0,121:15:3:0/1:58
- chr10 70143774 . C T 46 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,1,3;MQ=47;PV4=1,0.002,0.064,1 PL:DP:SP:GT:GQ 76,0,82:6:0:0/1:78
- chr10 70157322 . a aCAC 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70252483 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70259121 . CTTTTTTT CTTT 10.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70266400 . A G,C 6.79 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 46,15,36,9,0,36:3:0:1/1:49
- chr10 70304269 . G A 12 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 70332320 . A G 12.3 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,1,0,4;MQ=47;PV4=0.048,0.056,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,134:10:13:0/1:45
- chr10 70332672 . T A 99 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,2,16;MQ=45;PV4=1,1,1.2e-10,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,0,111:24:0:0/1:99
- chr10 70332862 . C T 99 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=9,7,9,4;MQ=47;PV4=0.7,2.6e-06,1.5e-23,0.18 PL:DP:SP:GT:GQ 255,0,255:29:2:0/1:99
- chr10 70390096 . tgt tGTACAAAgt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70392137 . A G 34 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=48;PV4=1,1,0.00041,1 PL:DP:SP:GT:GQ 64,0,67:7:0:0/1:65
- chr10 70392361 . G GGTTCCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70394184 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70404212 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70405855 . A G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,7,4;MQ=48;PV4=0.42,0.25,0.19,1 PL:DP:SP:GT:GQ 160,7,0:12:0:1/1:57
- chr10 70406072 . C G 5.46 . DP=14;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,4,0,3;MQ=48;PV4=1,0.22,0.029,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,100:8:0:0/1:37
- chr10 70435652 . G A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70459361 . TC TCTCC 12.7 . INDEL;DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70459362 . CATCAA CTGGATCAA 12.7 . INDEL;DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70471271 . c cTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70485134 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70502288 . G A 99 . DP=76;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=15,24,17,15;MQ=48;PV4=0.24,4.1e-24,1.9e-13,0.2 PL:DP:SP:GT:GQ 235,0,255:71:6:0/1:99
- chr10 70513318 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70515287 . C G 3.01 . DP=20;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=2,3,1,3;MQ=48;PV4=1,0.23,0.19,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,103:9:0:0/1:33
- chr10 70515291 . A T 3.34 . DP=20;AF1=0.5937;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.33,0.12 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,5:3:0:0/1:7
- chr10 70525591 . G A 4.84 . DP=6;AF1=0.5127;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=50;PV4=1,0.18,0.33,0.31 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,13:4:0:0/1:16
- chr10 70526280 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70532329 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70546394 . A G 21 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,4,0;MQ=49;PV4=0.029,0.016,0.014,1 PL:DP:SP:GT:GQ 51,0,64:7:15:0/1:54
- chr10 70547700 . ATAA ATAAGTAA 7.35 . INDEL;DP=13;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,32:2:0:0/1:35
- chr10 70601417 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70615452 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70641614 . C CGCG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70641860 . T C 99 . DP=24;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,10;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 133,33,0:11:0:1/1:99
- chr10 70641952 . T C 3.01 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,34:2:0:0/1:32
- chr10 70646193 . C T 3.54 . DP=40;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,15,5,0;MQ=49;PV4=0.0017,0.06,1.5e-05,0.36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,249:23:28:0/1:34
- chr10 70654222 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70660695 . G GACT 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70677662 . C CAA 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70694171 . T A 11.3 . DP=14;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,5;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,29:8:0:0/1:32
- chr10 70702908 . A T 4.13 . DP=8;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=47;PV4=1,1,0.11,0.053 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,30:4:0:0/1:31
- chr10 70725128 . A G 99 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,9,3;MQ=45;PV4=0.31,1,0.039,1 PL:DP:SP:GT:GQ 236,22,0:13:0:1/1:88
- chr10 70735339 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70742348 . AA AAGA 3.25 . INDEL;DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.17 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,80:4:0:0/1:41
- chr10 70748716 . TGG TGCCAGG 7.41 . INDEL;DP=13;AF1=0.508;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,15:2:0:0/1:18
- chr10 70754598 . TC TCGAACC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70783075 . T C 27 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 59,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 70791162 . C T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70861890 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70866554 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70886697 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70917355 . c cTGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70928380 . A C 19.1 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,2,0,6;MQ=49;PV4=0.007,0.0015,0.00032,1 PL:DP:SP:GT:GQ 49,0,226:16:22:0/1:52
- chr10 70935110 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70939153 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70944600 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70949240 . TTG TTGTATG 3.25 . INDEL;DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.19 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,71:4:0:0/1:41
- chr10 70953065 . A G 3.02 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 70962142 . CC CCCGC 5.08 . INDEL;DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,83:3:0:0/1:44
- chr10 70962148 . TG TGTCTGTACAG 7.46 . INDEL;DP=9;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,12:2:0:0/1:15
- chr10 70992635 . G A 27 . DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,13,7,4;MQ=50;PV4=0.5,7.4e-15,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 57,0,255:37:3:0/1:60
- chr10 70992664 . C T 78 . DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,0,23;MQ=49;PV4=0.042,1,0.31,1 PL:DP:SP:GT:GQ 111,56,0:24:0:1/1:99
- chr10 70992716 . G A 66 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,9,0,13;MQ=49;PV4=0.2,2.3e-05,0.062,1 PL:DP:SP:GT:GQ 96,0,230:24:7:0/1:99
- chr10 70992912 . A T 99 . DP=55;AF1=1;CI95=1,1;DP4=3,0,13,30;MQ=48;PV4=0.037,1,0.037,1 PL:DP:SP:GT:GQ 239,70,0:46:14:1/1:99
- chr10 70992949 . T A 42 . DP=32;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,13;MQ=48;PV4=1,0.00021,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 72,0,55:16:0:0/1:58
- chr10 71007107 . C A 28 . DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,7,0;MQ=49;PV4=1,0.047,0.0056,1 PL:DP:SP:GT:GQ 58,0,137:19:0:0/1:61
- chr10 71010026 . T C 8.44 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 39,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 71011846 . C A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71016947 . C G 20.6 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 53,12,0:4:0:1/1:72
- chr10 71018660 . T C 19.1 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,0,4;MQ=47;PV4=0.14,1,0.028,1 PL:DP:SP:GT:GQ 49,0,50:7:8:0/1:49
- chr10 71026510 . C A 36.5 . DP=54;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,5,1;MQ=50;PV4=0.29,0.44,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 66,2,0:7:0:1/1:37
- chr10 71028763 . AGCGTCACC A 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71055496 . G A 50 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,6;MQ=49;PV4=1,0.00019,0.067,1 PL:DP:SP:GT:GQ 80,0,121:10:0:0/1:83
- chr10 71060610 . A G 87.2 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,12;MQ=48;PV4=1,0.25,0.2,1 PL:DP:SP:GT:GQ 119,8,0:13:0:1/1:56
- chr10 71093058 . A ACT 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71100938 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71113854 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71120421 . CC CCCTGTAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71144130 . T G 9.52 . DP=51;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,4,0,8;MQ=49;PV4=3.6e-05,0.013,9.8e-08,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,255:33:44:0/1:42
- chr10 71144702 . G A 62 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 95,33,0:11:0:1/1:99
- chr10 71170707 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71174655 . tcacacacacacac tcacacacacac 4.11 . INDEL;DP=3;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,0;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,6:2:0:0/1:8
- chr10 71175644 . ct cTGt 5.08 . INDEL;DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=49;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,51:3:0:0/1:44
- chr10 71175645 . T A 23.3 . DP=6;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=48;PV4=1,1,0.065,0.39 PL:DP:SP:GT:GQ 53,0,9:4:0:0/1:12
- chr10 71223229 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71224168 . G GCCAGGGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71241910 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71245297 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71277313 . TG TGTGCTGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71326723 . A G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71333046 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71392557 . C T 55.1 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 88,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 71437565 . A G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71439390 . C CATCTACA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71467691 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71499514 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71503988 . T G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71508036 . ta tAACGACCCa 6.56 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71509209 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71512287 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71535239 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71553737 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71556945 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71583923 . A T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71635215 . C T 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71653389 . T TTTGGGAACA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71661072 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71663357 . T TCCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71665792 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71665820 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71720872 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71730541 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71736762 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71770443 . A T 6.98 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71830728 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71851127 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71859747 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71862745 . A G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71868763 . G A 76 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 109,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 71868822 . A C 29 . DP=23;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,4,0;MQ=49;PV4=0.33,0.49,0.16,1 PL:DP:SP:GT:GQ 59,0,30:6:0:0/1:33
- chr10 71876382 . C T 69.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 102,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 71880755 . TAA TA 14.4 . INDEL;DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 53,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 71880757 . A C 4.11 . DP=26;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 34,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 71885543 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71885928 . T TCAGGATGCTGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71905167 . G A 4.13 . DP=2;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,44:2:0:0/1:35
- chr10 71915062 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71915152 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71921591 . G A 99 . DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,12,10;MQ=49;PV4=0.48,1,1,0.083 PL:DP:SP:GT:GQ 190,53,0:23:0:1/1:99
- chr10 71923472 . T C 28.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 60,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 71923763 . G A 4.13 . DP=2;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,26:2:0:0/1:28
- chr10 71942617 . AGA AGACACGCGGA 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 71955095 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71968946 . A T 11.3 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,3,0;MQ=49;PV4=1,0.17,0.0015,0.069 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,95:8:0:0/1:44
- chr10 71969062 . G A 13.9 . DP=15;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 45,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 71971484 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71988215 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 71996558 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72079307 . tcc tCCTCTCcc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72083609 . G T 6.98 . DP=10;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,1,2;MQ=49;PV4=0.11,0.041,0.26,0.35 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,131:8:10:0/1:39
- chr10 72115554 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72119639 . G GTCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72124336 . A C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72135000 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72140057 . C CGA 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72141001 . C G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72144225 . A T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72149318 . T G 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72179689 . C G 6.2 . DP=8;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,3,0;MQ=47;PV4=0.4,0.17,0.077,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,58:5:0:0/1:38
- chr10 72184402 . T C 5.46 . DP=4;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=49;PV4=1,0.36,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,44:4:0:0/1:37
- chr10 72184480 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72192303 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72195439 . T C 69.1 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,9,1;MQ=49;PV4=1,0.18,0.34,1 PL:DP:SP:GT:GQ 100,5,0:11:0:1/1:46
- chr10 72237179 . G C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72243570 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72243572 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72257113 . T A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72258316 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72264905 . t tCTGCATC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72291304 . G A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72297567 . G A 30 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=47;PV4=1,0.011,0.17,1 PL:DP:SP:GT:GQ 60,0,63:6:0:0/1:61
- chr10 72298631 . T C 3.04 . DP=9;AF1=0.5048;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=50;PV4=1,0.045,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,17:4:0:0/1:20
- chr10 72298631 . T TC 19.3 . INDEL;DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 58,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 72307101 . C T 49.3 . DP=29;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 82,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 72318807 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72324143 . A G 98 . DP=24;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,5,3;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 131,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 72325243 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72326469 . G A 7.89 . DP=3;AF1=0.5128;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=47;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,13:2:0:0/1:16
- chr10 72338347 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72338356 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72349908 . G C 5.46 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72350882 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72357713 . C T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72358577 . G A 54.3 . DP=33;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 87,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 72376370 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72380251 . T C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72422448 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72432905 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72442179 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72460879 . C T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72468594 . C T 4.26 . DP=5;AF1=0.5262;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=46;PV4=1,1,0.089,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,10:3:0:0/1:13
- chr10 72468601 . GG GGAG 12.5 . INDEL;DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 51,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 72473263 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72496375 . A G 99 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 167,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 72500763 . T C 23.8 . DP=29;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=0,1,1,4;MQ=49;PV4=1,0.21,0.29,1 PL:DP:SP:GT:GQ 53,0,4:6:0:0/1:6
- chr10 72500863 . C G 29.6 . DP=33;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=0,1,5,0;MQ=49;PV4=0.17,0.34,0.35,1 PL:DP:SP:GT:GQ 59,0,5:6:0:0/1:7
- chr10 72502783 . G A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72505097 . C CTA 3.25 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.31 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,109:4:0:0/1:41
- chr10 72511223 . TCTCC TCTCCTCC 5.08 . INDEL;DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,0,1;MQ=50;PV4=0.33,1,1,0.2 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,83:3:0:0/1:44
- chr10 72512068 . T A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 44,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 72512168 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72516986 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72517830 . G A 13.2 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,4,1,2;MQ=49;PV4=1,0.01,0.044,0.12 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,167:8:0:0/1:46
- chr10 72519067 . G A 3.54 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,1,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,44:2:0:0/1:34
- chr10 72520330 . A G 7.8 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,5,4,1;MQ=50;PV4=0.61,0.0031,0.022,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,253:18:2:0/1:40
- chr10 72520660 . T C 42 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,9;MQ=49;PV4=1,5.5e-05,0.23,1 PL:DP:SP:GT:GQ 72,0,84:12:0:0/1:75
- chr10 72536922 . TCCT TCCTTAGAGACCT 3.25 . INDEL;DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,2,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,45:4:0:0/1:40
- chr10 72540555 . tt tTTCt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72544968 . ACTTC ACTTCTTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72563875 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72576574 . A G 12.3 . DP=10;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=48;PV4=1,0.01,0.092,0.029 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,30:4:0:0/1:33
- chr10 72608849 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72619205 . C T 99 . DP=45;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,1,6,9;MQ=49;PV4=1,0.37,0.14,1 PL:DP:SP:GT:GQ 147,7,0:17:0:1/1:57
- chr10 72633458 . C T 49 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,10;MQ=49;PV4=1,1.5e-08,0.39,1 PL:DP:SP:GT:GQ 79,0,89:13:0:0/1:82
- chr10 72635335 . T C 3.01 . DP=44;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=9,10,0,6;MQ=49;PV4=0.057,0.014,0.074,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,255:25:12:0/1:33
- chr10 72638054 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72646409 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72655715 . GA GAATA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72663731 . T C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72676367 . g gCACCCAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72677631 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72694842 . G A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72702134 . TGG T 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72734308 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72738289 . T TCAATAGTGGCTCCC 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72747467 . c cCT 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 72759115 . C G 7.8 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72797736 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72816063 . G C 4.78 . DP=2;AF1=0.5024;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=45;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,20:2:0:0/1:23
- chr10 72843258 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72846130 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72850977 . ac aCATc 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72855077 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72864036 . A G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72885660 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72906936 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72916818 . C A 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72950686 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72961410 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72976875 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 72998844 . C A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73023383 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73028960 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73036193 . G GACGGT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73056288 . GG GGTG 3.25 . INDEL;DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,68:4:0:0/1:41
- chr10 73056289 . G A 11.3 . DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,3,0;MQ=48;PV4=1,0.14,1,0.052 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,73:6:0:0/1:44
- chr10 73060184 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73091885 . t tGGGGAGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73104056 . A G 99 . DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,21;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 166,66,0:22:0:1/1:99
- chr10 73111258 . G T 26.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 58,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 73111408 . C T 86 . DP=44;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,5,5;MQ=49;PV4=0.47,0.0091,0.38,1 PL:DP:SP:GT:GQ 116,0,31:12:3:0/1:34
- chr10 73119313 . ACCC ACCCTTTTCCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73121913 . A G 99 . DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,16,16;MQ=42;PV4=1,1,0.055,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,79,0:33:0:1/1:99
- chr10 73121945 . T C 99 . DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,10;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 217,54,0:18:0:1/1:99
- chr10 73126978 . T C 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73132073 . c cTT 3.25 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73173698 . t tCTTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73188220 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73197656 . A G 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73222734 . a aGAGG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73238547 . G A 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73240337 . T A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73257658 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73265008 . gaga gAGAaga 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73269314 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73275956 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73320123 . G GA 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73369784 . C T 7.09 . DP=4;AF1=0.5162;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,0,1;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,12:2:0:0/1:15
- chr10 73382844 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73383757 . T C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73398982 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73436040 . G GGTTGCCCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73446700 . A ACCCTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73447589 . C T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73448723 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73483308 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73484902 . A T 4.77 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73487415 . cacataca caca 5.08 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73491026 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73510924 . CCAAG C 5.08 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,0.024,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,83:3:0:0/1:44
- chr10 73515764 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73520632 . A C 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 132,27,0:9:0:1/1:99
- chr10 73525405 . G GCCCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73533616 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73572561 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73576226 . C CACA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73578503 . G A 6.02 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 73578882 . T C 99 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,34;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 175,105,0:35:0:1/1:99
- chr10 73579405 . C T 64 . DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,7;MQ=47;PV4=1,4.2e-05,1.9e-06,1 PL:DP:SP:GT:GQ 94,0,235:23:0:0/1:97
- chr10 73579501 . AGAGG AG 10.8 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 48,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73579979 . G A 99 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,16,0;MQ=47;PV4=1,1.3e-05,1.4e-12,0.049 PL:DP:SP:GT:GQ 190,0,233:32:0:0/1:99
- chr10 73623276 . G A 13.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73625515 . C CAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73657201 . C CAAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73665019 . C T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73700635 . g gAAAATTC 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73711243 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73721132 . C A 5.46 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73722685 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73775393 . T TGC 4.42 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73806360 . C G 4.77 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73820817 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73834604 . at aTAGCt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73852554 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73885468 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73892709 . A G 3.06 . DP=8;AF1=0.5099;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=49;PV4=1,0.33,0.33,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,14:3:0:0/1:17
- chr10 73895174 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73895178 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73898652 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73933787 . tg tGGCGg 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73935011 . C G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73956869 . C CTCT 3.25 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.31 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,114:4:0:0/1:41
- chr10 73979170 . A T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 73992783 . A G 3.54 . DP=30;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,5,6,0;MQ=49;PV4=0.031,0.004,0.0045,0.49 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,201:14:15:0/1:34
- chr10 74023805 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74035041 . T A 93 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,16;MQ=48;PV4=1,1,0.2,1 PL:DP:SP:GT:GQ 126,27,0:17:0:1/1:99
- chr10 74052490 . C A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74073683 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74100693 . C CGTTGGAAA 5.08 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.26 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,80:3:0:0/1:44
- chr10 74116582 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74174641 . G A 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74185488 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74185493 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74193088 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74222408 . G A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74226624 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74262936 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74262951 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74285446 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74323575 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74381365 . A C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74383021 . ctctgtcaa c 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74483371 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74507559 . ct cTATTt 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74515624 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74515651 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74582856 . a aCAC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74596052 . G C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74628428 . T TTTTCCCCAG 7.57 . INDEL;DP=4;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,9:2:0:0/1:12
- chr10 74669962 . a aCTGC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74671611 . C T 99 . DP=61;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,16,35;MQ=44;PV4=1,1,2.3e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,138,0:52:0:1/1:99
- chr10 74673910 . G T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74695287 . T C 13.2 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74735286 . T G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74745816 . c cGCCGTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74761878 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74813116 . A G 29 . DP=21;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,7,5,1;MQ=47;PV4=0.041,0.19,0.044,1 PL:DP:SP:GT:GQ 59,0,157:15:14:0/1:62
- chr10 74813127 . T C 30 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,2,1,5;MQ=48;PV4=0.24,0.055,0.036,1 PL:DP:SP:GT:GQ 60,0,130:12:6:0/1:63
- chr10 74827251 . T G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74834281 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74834651 . T C 60.3 . DP=15;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 93,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 74857712 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74859512 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74874262 . T C 46 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 79,24,0:8:0:1/1:96
- chr10 74879505 . G T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74886384 . CCCT CCCTCTCCT 12.7 . INDEL;DP=11;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74886392 . GCC GC 99 . INDEL;DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 157,36,0:12:0:1/1:99
- chr10 74886598 . C G 99 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,1,15;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 213,48,0:16:0:1/1:99
- chr10 74892434 . TA TACTCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74894375 . T C 23 . DP=27;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,7,0;MQ=48;PV4=0.22,0.047,0.23,1 PL:DP:SP:GT:GQ 53,0,30:9:0:0/1:33
- chr10 74896664 . T C 45.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 78,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 74899134 . C G 99 . DP=42;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,23;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 255,105,0:35:0:1/1:99
- chr10 74914256 . T G 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 133,27,0:9:0:1/1:99
- chr10 74916002 . T G 37.1 . DP=26;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,5,0;MQ=49;PV4=1,1,0.23,1 PL:DP:SP:GT:GQ 68,5,0:6:0:1/1:46
- chr10 74916173 . T A 99 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,5;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 194,33,0:11:0:1/1:99
- chr10 74920436 . C T 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 45,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 74923562 . C T 99 . DP=60;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,1,9,6;MQ=48;PV4=0.44,7.9e-06,0.26,0.4 PL:DP:SP:GT:GQ 137,0,2:16:0:0/1:3
- chr10 74928151 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74940456 . T TAGCAGCGGAAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74976149 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 74999252 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75003600 . C G 9.52 . DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,1,4,0;MQ=48;PV4=1,0.2,0.11,0.27 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,88:8:0:0/1:42
- chr10 75013805 . CAATT C,CATT 9.94 . INDEL;DP=18;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 67,23,47,20,0,44:2:0:1/1:41
- chr10 75013807 . ATTT ATT 3.66 . INDEL;DP=15;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 75013883 . CCTCT CCT 99 . INDEL;DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 144,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 75032032 . gc gCCTAGTCGTAAc 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75053202 . GTTT GTT 99 . INDEL;DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 157,54,0:18:0:1/1:99
- chr10 75054433 . C G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75055736 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75056737 . T C 49.1 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 82,18,0:6:0:1/1:90
- chr10 75056863 . A C 66.1 . DP=60;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,5,2;MQ=49;PV4=1,1,0.24,1 PL:DP:SP:GT:GQ 97,5,0:8:0:1/1:46
- chr10 75058601 . G C 99 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 161,33,0:11:0:1/1:99
- chr10 75059331 . A T 12 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 43,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 75069872 . T C 99 . DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,29,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 136,87,0:29:0:1/1:99
- chr10 75071272 . g gGGAGAACC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75072199 . G C 99 . DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,20,2;MQ=49;PV4=0.13,0.3,0.28,1 PL:DP:SP:GT:GQ 143,45,0:23:0:1/1:99
- chr10 75072238 . C A 13.2 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,7,6,0;MQ=49;PV4=0.13,0.082,4.3e-06,0.36 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,255:24:9:0/1:46
- chr10 75090600 . C T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75095253 . G A 99 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,4,15;MQ=47;PV4=1,1,0.14,1 PL:DP:SP:GT:GQ 243,40,0:20:0:1/1:99
- chr10 75108146 . T G 5.46 . DP=9;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=48;PV4=1,1,0.019,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,26:4:0:0/1:28
- chr10 75143458 . C T 14.9 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 46,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 75147544 . GGAAGAA GGAAGAAGAA 99 . INDEL;DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,2,1,32;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,75,0:35:0:1/1:99
- chr10 75147579 . C T 65 . DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,24;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 98,72,0:24:0:1/1:99
- chr10 75148116 . A G 99 . DP=26;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,1,11,7;MQ=47;PV4=1,1,0.0033,1 PL:DP:SP:GT:GQ 203,15,0:20:0:1/1:75
- chr10 75156152 . T C 13.2 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 43,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75160439 . C T 15.9 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 47,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 75160478 . A T 18.8 . DP=28;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 50,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 75186107 . C T 18.1 . DP=19;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,2,0,4;MQ=48;PV4=0.076,0.3,0.12,1 PL:DP:SP:GT:GQ 48,0,99:10:11:0/1:51
- chr10 75186609 . TGA TGACAGA 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75186973 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75187502 . G A 33 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,6,4,1;MQ=48;PV4=0.072,0.031,0.025,1 PL:DP:SP:GT:GQ 63,0,156:12:11:0/1:66
- chr10 75187516 . C G 7.8 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,2,0,4;MQ=48;PV4=0.015,0.037,0.056,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,212:14:18:0/1:40
- chr10 75208216 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75211077 . T A 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75220107 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75227278 . aa aATGa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75264495 . G GAC 5.08 . INDEL;DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,0.042 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,80:3:0:0/1:44
- chr10 75285741 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75286691 . C A 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75289359 . C A 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 45,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 75294524 . C T 6.98 . DP=25;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=5,5,0,5;MQ=49;PV4=0.1,0.054,0.0086,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,214:15:10:0/1:39
- chr10 75294528 . C T 55 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,3,0,10;MQ=48;PV4=0.0065,0.021,0.017,1 PL:DP:SP:GT:GQ 85,0,170:18:22:0/1:88
- chr10 75296186 . T G 6.2 . DP=25;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=5,7,0,5;MQ=49;PV4=0.24,0.022,1,0.49 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,226:17:6:0/1:38
- chr10 75301505 . T G 15.1 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,15,0,6;MQ=49;PV4=1,0.02,2e-06,1 PL:DP:SP:GT:GQ 45,0,190:21:0:0/1:48
- chr10 75302752 . A C 22 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,3,5,0;MQ=49;PV4=0.18,0.096,0.06,1 PL:DP:SP:GT:GQ 52,0,134:11:7:0/1:55
- chr10 75302801 . T A 13.2 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,1,0,6;MQ=48;PV4=0.00018,0.055,0.17,0.18 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,182:20:37:0/1:46
- chr10 75312755 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75322851 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75335857 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75345230 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75406021 . GT GTTT 6.68 . INDEL;DP=2;AF1=0.5207;CI95=0.5,1;DP4=1,0,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 43,0,11:2:0:0/1:14
- chr10 75411282 . C G 4.13 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75427486 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75476882 . A G 3.55 . DP=11;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=49;PV4=1,1,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,25:4:0:0/1:27
- chr10 75479869 . T G,C 5.29 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 48,19,34,13,0,34:3:0:1/1:49
- chr10 75487099 . T C 7.8 . DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75491908 . G T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75506674 . T C 99 . DP=62;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,13,4,17;MQ=48;PV4=0.068,2.2e-10,2.8e-12,1 PL:DP:SP:GT:GQ 224,0,255:45:12:0/1:99
- chr10 75526651 . T C 37 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,3,0,6;MQ=48;PV4=0.4,0.17,0.46,0.43 PL:DP:SP:GT:GQ 67,0,76:10:0:0/1:69
- chr10 75527537 . A C 9.31 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 75527708 . A G 99 . DP=48;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=9,7,4,22;MQ=49;PV4=0.014,2.5e-05,0.0069,0.47 PL:DP:SP:GT:GQ 161,0,255:42:19:0/1:99
- chr10 75554158 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75555276 . A G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75564883 . T G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75567844 . T G 4.77 . DP=41;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=8,7,0,6;MQ=49;PV4=0.046,0.0068,0.21,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,255:21:13:0/1:36
- chr10 75568649 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75574848 . G C 12.3 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,3,4,0;MQ=50;PV4=0.2,0.14,0.056,1 PL:DP:SP:GT:GQ 42,0,130:10:7:0/1:45
- chr10 75578020 . G A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75599882 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75602188 . A T 6.98 . DP=20;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,3,0;MQ=49;PV4=1,0.35,0.028,1 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,101:10:0:0/1:39
- chr10 75605400 . ttc tTCCTTAtc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75607168 . T C 4.77 . DP=30;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,4;MQ=49;PV4=1,0.0021,0.002,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,209:15:0:0/1:36
- chr10 75607643 . C CT 59.4 . INDEL;DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 99,9,0:3:0:1/1:63
- chr10 75607696 . CAA CA 99 . INDEL;DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 154,42,0:14:0:1/1:99
- chr10 75608300 . C T 9.52 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=3,4,4,0;MQ=49;PV4=0.19,0.049,0.021,1 PL:DP:SP:GT:GQ 39,0,190:11:7:0/1:42
- chr10 75630262 . AGG AGGGG 3.81 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75643453 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75655368 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75663816 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75672961 . G A 5.31 . DP=13;AF1=0.6242;CI95=0.5,1;DP4=1,0,0,4;MQ=50;PV4=0.2,0.1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 33,0,4:5:0:0/1:6
- chr10 75673101 . T C 72.1 . DP=39;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,6,2;MQ=49;PV4=0.33,0.23,0.26,1 PL:DP:SP:GT:GQ 101,1,0:9:0:1/1:23
- chr10 75673879 . C T 99 . DP=42;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,12,23;MQ=44;PV4=1,1,0.0073,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,82,0:36:0:1/1:99
- chr10 75674381 . A T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75682466 . G C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75731664 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75746575 . gc gCTCc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75772415 . A AATT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75788551 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75795805 . g gTTCTC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75807161 . AA AACTAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75830739 . A G 26 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,2,5,0;MQ=49;PV4=0.47,0.16,0.0048,0.44 PL:DP:SP:GT:GQ 56,0,144:12:3:0/1:59
- chr10 75831517 . AA AACAGA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75842152 . G A 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 132,30,0:10:0:1/1:99
- chr10 75843100 . T A 67.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 100,21,0:7:0:1/1:84
- chr10 75854057 . G C 4.13 . DP=14;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=48;PV4=1,0.12,1,0.035 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,38:6:0:0/1:34
- chr10 75859813 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75863750 . C T 61 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,7;MQ=48;PV4=1,0.00017,0.015,0.46 PL:DP:SP:GT:GQ 91,0,143:12:0:0/1:94
- chr10 75876591 . A ATGGCGAGGAGG 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75877926 . A G 3.54 . DP=8;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=2,1,0,2;MQ=49;PV4=0.4,0.14,0,0.38 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,99:5:4:0/1:34
- chr10 75888907 . A C 10.4 . DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,0,5;MQ=49;PV4=0.00033,0.0088,0.0011,0.02 PL:DP:SP:GT:GQ 40,0,159:15:35:0/1:43
- chr10 75893733 . C A 5.46 . DP=6;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.19,0.32,1 PL:DP:SP:GT:GQ 34,0,27:3:0:0/1:29
- chr10 75898015 . A G 6.2 . DP=27;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=9,1,0,4;MQ=49;PV4=0.005,1.8e-05,0.00035,1 PL:DP:SP:GT:GQ 35,0,250:14:23:0/1:38
- chr10 75931540 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75974039 . T C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 75974545 . G T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76004751 . A C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76018185 . A ACTCTCTGT 11.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 49,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76062343 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76111330 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76117086 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76128388 . T C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76131890 . G C 15.1 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=1,1,2,0;MQ=48;PV4=1,0.24,0.16,1 PL:DP:SP:GT:GQ 45,0,68:4:0:0/1:48
- chr10 76154971 . C G 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76158177 . C T 21.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 54,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 76238343 . T C 11.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 41,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76257614 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76299939 . A ACTAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76306233 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76318422 . t tACTA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76336344 . C G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76345340 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76345781 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76353358 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76382860 . T G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76415666 . G T 6.02 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 76419641 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76435908 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=30 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76456897 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76456916 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76468002 . T C,G 24 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 63,16,53,7,0,53:4:0:1/1:63
- chr10 76484050 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76484076 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76504082 . C T 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 45,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 76509687 . C A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76522502 . T A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76527172 . T C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76535412 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76543877 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76549039 . ac aCGACACc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76561552 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76576692 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76600826 . T C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76606015 . T G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76617929 . G GACCAAGAA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76620195 . tc tCCGCTCACCc 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76627669 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76672061 . T C 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76689310 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76729901 . T A 7 . DP=7;AF1=0.5031;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,0.077,0.11,0.27 PL:DP:SP:GT:GQ 36,0,19:3:0:0/1:22
- chr10 76732425 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76748099 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76768205 . T A 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76772344 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76774968 . A C 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76790922 . G GCA 5.08 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.33 PL:DP:SP:GT:GQ 41,0,73:3:0:0/1:44
- chr10 76796236 . C T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76798480 . g gCAGA 12.7 . INDEL;DP=3;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76827555 . T G 4.63 . DP=2;AF1=0.6241;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,1;MQ=30;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,4:2:0:0/1:6
- chr10 76833280 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76841147 . a aCAT 8.19 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 45,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76841297 . C G 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76849523 . TGC TGCGC 7.35 . INDEL;DP=3;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,43:2:0:0/1:43
- chr10 76854564 . C T 99 . DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,13,6;MQ=48;PV4=0.35,0.19,0.27,1 PL:DP:SP:GT:GQ 205,29,0:20:0:1/1:99
- chr10 76855326 . A G 9.31 . DP=14;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 40,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 76855412 . G A 99 . DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,9,29;MQ=44;PV4=0.26,1,9.9e-05,1 PL:DP:SP:GT:GQ 255,91,0:39:0:1/1:99
- chr10 76855597 . T TTC 3.25 . INDEL;DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,0.29 PL:DP:SP:GT:GQ 38,0,114:4:0:0/1:41
- chr10 76856668 . A T 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76857274 . A G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76857716 . A G 96 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=47 PL:DP:SP:GT:GQ 129,27,0:9:0:1/1:99
- chr10 76861680 . T C 99 . DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,4,12;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 190,48,0:16:0:1/1:99
- chr10 76955593 . CCT CCTCTTATTCACT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76973735 . T C 15.1 . DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=17,0,7,0;MQ=49;PV4=1,0.005,0.00014,1 PL:DP:SP:GT:GQ 45,0,200:24:0:0/1:48
- chr10 76978605 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 76980515 . A C 3.54 . DP=10;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=47;PV4=1,0.21,0.15,1 PL:DP:SP:GT:GQ 31,0,78:5:0:0/1:34
- chr10 76989595 . t tCTAG 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,44:2:0:0/1:44
- chr10 77007917 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77007925 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=33 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77008914 . A T 3.01 . DP=2;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=44;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,39:2:0:0/1:32
- chr10 77029284 . A G 6.02 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 77062276 . C G 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77085720 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77102200 . G A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77105075 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77124587 . T C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77129056 . t tTCTA 12.7 . INDEL;DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77200854 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77266452 . G A 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77314801 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77317399 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77317403 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77366393 . G A 4.13 . DP=2;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,1,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 32,0,34:2:0:0/1:33
- chr10 77397100 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77414622 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77429416 . T A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=32 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77454739 . A G 51.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,1;MQ=49 PL:DP:SP:GT:GQ 84,15,0:5:0:1/1:75
- chr10 77489335 . T A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77525603 . G C 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77542236 . TT TTGCACT 7.35 . INDEL;DP=2;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,1;MQ=50;PV4=1,1,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 44,0,39:2:0:0/1:41
- chr10 77542841 . A C 7.8 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=48;PV4=1,0.29,1,1 PL:DP:SP:GT:GQ 37,0,46:6:0:0/1:39
- chr10 77572780 . C G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77574901 . C G 12.3 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77612455 . TG TGACTTGAG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77622214 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77650478 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77673701 . T A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77675976 . A G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77689961 . G C 3.55 . DP=2;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77700318 . A G 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77706499 . C G 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77717599 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77745587 . C T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77778953 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77783745 . G A 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77818623 . C G 3.01 . DP=3;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,1,0;MQ=45;PV4=0.33,0.085,0.3,1 PL:DP:SP:GT:GQ 30,0,77:3:0:0/1:33
- chr10 77825988 . A C 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77839095 . TGGGTG T 7.35 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 44,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77843207 . G C 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77851160 . A T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77863902 . T C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77865813 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77932593 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77935713 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77935737 . G A 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77948101 . A C 7.59 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:DP:SP:GT:GQ 38,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 77967010 . ag aGCACACACACg 9.94 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 47,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77970889 . A T 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77988880 . G T 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 77998848 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78006088 . C G 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78009299 . A ACCC 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78028067 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78036652 . g gCAT 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78102854 . A C 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78104011 . A C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78104020 . G C 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=31 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78143749 . T G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78166705 . TTC TTCGGTTGCATC 5.8 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 42,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78212133 . A T 9.53 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 39,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78239707 . G A 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78251286 . T A 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78269867 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78290389 . ga gATTa 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78301846 . C T 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=34 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78405608 . G T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78438548 . G T 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=38 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78456769 . A G 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78481784 . A T 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78490476 . A T 10.4 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 40,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78506877 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78522185 . T A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78529107 . T C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=41 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78546368 . G A 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=35 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78565971 . A C 6.98 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 36,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78649399 . C T 99 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,14,0,14;MQ=47;PV4=1,0.044,9.2e-09,1 PL:DP:SP:GT:GQ 181,0,227:28:0:0/1:99
- chr10 78674048 . T G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78680536 . C A 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78728800 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78744081 . T G 8.65 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 38,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78786836 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=40 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78791687 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 31,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78828962 . C A 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=43 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78864421 . C T 7.8 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=37 PL:DP:SP:GT:GQ 37,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78867125 . G A 4.13 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=36 PL:DP:SP:GT:GQ 32,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78876625 . A C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=45 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78935329 . G C 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78937224 . T G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,1;MQ=46 PL:DP:SP:GT:GQ 44,6,0:2:0:1/1:49
- chr10 78974219 . T G 4.77 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=39 PL:DP:SP:GT:GQ 33,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 78983060 . G C 5.46 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 34,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 79017032 . A G 3.02 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT:GQ 30,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 79046186 . c cCATAGGTG 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,1;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 79046950 . C G 6.2 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=42 PL:DP:SP:GT:GQ 35,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 79055691 . TA TACTCA 12.7 . INDEL;DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=50 PL:DP:SP:GT:GQ 50,3,0:1:0:1/1:41
- chr10 79062235 . G T 3.55 . DP=1;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,0,1,0;MQ=44 PL:DP:SP:GT: